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1 | Day | Date | Week | Lecture | Topic | Title | ||||||||||||||||||||
2 | Tuesay | 03-Jan | 1 | 1 | Intro/Review | Course Logistics and Intro | ||||||||||||||||||||
3 | Thursday | 05-Jan | 1 | 2 | Review: ML, Stat | |||||||||||||||||||||
4 | Tuesay | 10-Jan | 2 | 3 | Genetics | Genetics, linear models, and inference I | ||||||||||||||||||||
5 | Thursday | 12-Jan | 2 | 4 | Genetics, linear models, and inference II | |||||||||||||||||||||
6 | Tuesay | 17-Jan | 3 | 5 | Genetics, linear models, and inference III | |||||||||||||||||||||
7 | Thursday | 19-Jan | 3 | 6 | Confounding and linear mixed effect models | |||||||||||||||||||||
8 | Tuesay | 24-Jan | 4 | 7 | Interaction effects in linear models | |||||||||||||||||||||
9 | Thursday | 26-Jan | 4 | 8 | Review of Genetics modules | |||||||||||||||||||||
10 | Tuesay | 31-Jan | 5 | 9 | Multi-omics Analysis | Multi-omics and GWAS mechanism | ||||||||||||||||||||
11 | Thursday | 02-Feb | 5 | 10 | Multi-omics association studies | |||||||||||||||||||||
12 | Tuesay | 07-Feb | 6 | 11 | Causal Inference | |||||||||||||||||||||
13 | Thursday | 09-Feb | 6 | 12 | Regulatory Genomics | Gene regulation | ||||||||||||||||||||
14 | Tuesay | 14-Feb | 7 | 13 | Gene regulation - Network biology | |||||||||||||||||||||
15 | Thursday | 16-Feb | 7 | 14 | Gene regulation - Sequence analysis | |||||||||||||||||||||
16 | Tuesay | 21-Feb | 8 | 15 | Deep learning models to learn regulation grammar | |||||||||||||||||||||
17 | Thursday | 23-Feb | 8 | 16 | Understanding what deep learning models learn | |||||||||||||||||||||
18 | Tuesay | 28-Feb | 9 | 17 | Single Cell Genomics | Single Cell Genomics Intro | ||||||||||||||||||||
19 | Thursday | 02-Mar | 9 | 18 | Unsupervised learning II | |||||||||||||||||||||
20 | Tuesay | 07-Mar | 10 | 19 | Batch effects & single cell data | |||||||||||||||||||||
21 | Thursday | 09-Mar | 10 | 20 | Special Topic | Invited speaker: Manu Setty (Fred Hutch) - Recent topics in single cell genomics | ||||||||||||||||||||
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