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1 | Spring 2019 tentative schedule for Bio 79 | |||||||||||||||||||||||||
2 | Note: Subject to change! Please check back often. | |||||||||||||||||||||||||
3 | Date | Lecture | Laboratory | |||||||||||||||||||||||
4 | 1/22 | Introduction | Laboratory Orientation/Documentation | |||||||||||||||||||||||
5 | 1/24 | pH and Buffers | Buffers and Media Preparation | |||||||||||||||||||||||
6 | 1/29 | pH and Buffers cont. | Buffers and Media Preparation cont.; Spectrophotometry, OD, and Aseptic Technique | |||||||||||||||||||||||
7 | 1/31 | Spectrophotometry and Optical Density (OD) | No lab due to instructor illness | |||||||||||||||||||||||
8 | 2/5 | Spectrophotometry and Optical Density (OD) cont. | Spectrophotometry, OD, and Aseptic Technique | |||||||||||||||||||||||
9 | 2/7 | Upstream Processing Math homework 1 due | Effects of Culture Conditions on Bacterial Growth | |||||||||||||||||||||||
10 | 2/12 | Upstream Processing cont. | Effects of Culture Conditions on Bacterial Growth, TF reading and data analysis | |||||||||||||||||||||||
11 | 2/14 | Upstream Processing cont. | Optimization of induction and GFP production in E. coli | |||||||||||||||||||||||
12 | 2/19 | Upstream Processing cont. | Optimization of induction and GFP production in E. coli | |||||||||||||||||||||||
13 | 2/21 | Upstream Processing cont. | Optimization of induction and GFP production in E. coli, day 3; TF reading and data analysis in F170; | |||||||||||||||||||||||
14 | 2/26 | Upstream Processing cont.; Quiz 1 on math hw 1 | Start 1-L spinner flask; start 3-L insulin bioreactor | |||||||||||||||||||||||
15 | 2/28 | Upstream Processing cont. | Monitor 1-L spinner; LB Agar Plate Media and Plate Pouring | |||||||||||||||||||||||
16 | 3/5 | Upstream processing cont. | DHFR (Day 1): Streak plates, pgs. 121-123; clean 1-L spinner flasks | |||||||||||||||||||||||
17 | 3/7 | Upstream processing cont.; Lab notebook check 1 | DHFR (Day 2): Subculture and Induction, pgs. 121-123 | |||||||||||||||||||||||
18 | 3/12 | Data Analysis | No class due to instructor illness | |||||||||||||||||||||||
19 | 3/14 | Data Analysis cont.; Math homework 2 due | Instrumentation calibration: pipettes, scales, pH meters | |||||||||||||||||||||||
20 | 3/19 | Working in a Regulated Environment; Quiz 2 on Data Analysis | cGMP popcorn | |||||||||||||||||||||||
21 | 3/21 | Professional Development Day -- no classes | SOLANO TOUR -- ARRIVE BY 11 AM 2001 N Village Pkwy, Vacaville, CA 95688 | |||||||||||||||||||||||
22 | 3/26 | Working in a Regulated Environment; Graph and table due | Continue DHFR (Day 3): Collecting Cell Pellet and Lysing Cells, pgs. 124-125; save samples for Gram stain | |||||||||||||||||||||||
23 | 3/28 | Midterm exam | DHFR (Day 4): Separation of Soluble and Insoluble Factions and SDS-PAGE Analysis of Induction, pgs. 126-129 | |||||||||||||||||||||||
24 | 4/2 | Spring Break -- no classes | ||||||||||||||||||||||||
25 | 4/4 | Spring Break -- no classes | ||||||||||||||||||||||||
26 | 4/9 | Downstream Processing | DHFR (Day 5); Affinity Purification of GST-DHFR-His Using AKTA, pgs. 139-151; Artel Pipetting Challenge Week | |||||||||||||||||||||||
27 | 4/11 | Downstream Processing cont. | Continue Purification of DHFR; Start Sf9 cells media prep; Artel Pipetting Challenge Week (also with student PDA chapter at 6:30 pm) | DHFR (Day 6): Desalting and Prep for SDS-PAGE; Quantitation of Protein in Desalted Fractions, pgs. 152-157 | ||||||||||||||||||||||
28 | 4/16 | Downstream Processing cont. | Sf9 cell counts; poster project work in groups in F170 4-5 pm | DHFR (Day 7): SDS-PAGE of Purified Fractions, pgs. 158-160 | ||||||||||||||||||||||
29 | 4/18 | Kelly Scientific talk in lecture; arrive promptly at 1 pm! | Analysis of Sf9 culture; Poster project work in groups F170 3-5 pm | DHFR (Day 8): DHFR Enzymatic Assay, pgs. 201-209 | ||||||||||||||||||||||
30 | 4/23 | Downstream Processing cont. | Poster project work in groups in lab 2:30-5 pm | |||||||||||||||||||||||
31 | 4/25 | Downstream Processing cont. | Poster project work in groups in lab 3:30-5 pm | |||||||||||||||||||||||
32 | 4/30 | Downstream Processing cont. | More group work | |||||||||||||||||||||||
33 | 5/2 | Downstream Processing cont. | General and aspetic gowning; resume on Canvas, LinkedIn profile w/ your pic and Laney BioMFG group join & connect to D. Bruce by Sun., 5/5 at 12 midnight | |||||||||||||||||||||||
34 | 5/7 | Metrology and Calibration; Quiz 3; Poster final graphs due | ||||||||||||||||||||||||
35 | 5/9 | ABPDU Tour 2-3 pm | Address 5885 Hollis Street in Emeryville. BE THERE AT LEAST 15 MINS EARLY TO REGISTER IN THE LOBBY. | |||||||||||||||||||||||
36 | 5/14 | Aseptic Processing & Environmental Monitoring | Finalize posters in F170 | |||||||||||||||||||||||
37 | 5/16 | Quality | Poster session 4-5 pm | |||||||||||||||||||||||
38 | 5/21 | Final exam (starts at 12 pm); SOP Assignment (group, assigned topic) submitted via GoolgeDocs to douglasbruceatwork@gmail.com by Fri., 5/24 at 5 pm | ||||||||||||||||||||||||
39 | 5/23 | Optional: Solano Bachelor's graduation ceremony 4 pm in Vacaville | ||||||||||||||||||||||||
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