A | B | C | D | E | F | G | H | I | J | K | L | M | N | O | P | Q | R | S | T | U | V | W | X | ||
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1 | Source of ID | Circuit ID | Names | Sub-Circuits | Super Class | Uniform | Transmitter | Modulation Type | Size | Projections | Interpretation(φ&f) | Label(1) | Function(1) | Projections in Use(1) | Comments(1) | ||||||||||
2 | collection | HF | Hippocampal formation | Hipp; LEC; MEC; S; PrS; PaS | FALSE | PERI (origin LEC_deep_uc1); VISpor (origin MEC_deep_uc1); | HF | Top Level Functions for HF: (i) Self-localization, (ii) Place categorization by integrating allocentric and egocentric information | PERI (GIPA:G) | Inputs to HF are from PERI, VISpor, RSC and MSN | |||||||||||||||
3 | DHBA | Hipp | Hippocampus proper | CA1; CA2; CA3 | FALSE | Excitatory | |||||||||||||||||||
4 | DHBA | CA1 | cornu Ammonis 1 | CA1_distal; CA1_proximal | FALSE | Excitatory | MEC_III [Moser, 2010]; MEC_V [Moser, 2010]; Medial septum [Rolls, 2013]; Nucleus acumens [Rolls, 2013]; PFC.L2 [Verwer, 1997]; PFC.L3 [Verwer, 1997]; S [Llorens-Martín, 2014]; | Ensemble activity in CA3, but not in CA1, is sensitive to the content of a scene or place in the environment; CA3 supports the retrieval of memories about where an objects is in a scene [Robertson,1998] [Rolls,1998] or where a reward could be found in the environment [Brun, 2002]. | |||||||||||||||||
5 | [Bubb, 2017] | CA1_distal | CA1, distal | TRUE | Excitatory | S_proximal [Knierim, 2014][Witter, 2000]; LEC_deep [Knierim, 2014]; MEC_III [Moser, 2010]; | Non-spatial semantic memory [author, year] | C | Place category (internal representation of visual spatial information) | S_proximal (GIPA:G) | |||||||||||||||
6 | [Bubb, 2017] | CA1_proximal | CA1, proximal | TRUE | Excitatory | S_distal [Knierim, 2014][Witter, 2000] MEC_deep [Knierim, 2014]; | Place cells [Brun, 2002] [O’Keefe,1976] | r | Position distribution (cluster information regarding positions) | S_distal (GIPA:G) | |||||||||||||||
7 | DHBA | CA2 | cornu Ammonis 2 | TRUE | Excitatory | CA1*[Llorens-Martín, 2014]; CA3 [Llorens-Martín, 2014]; MEC_II [Llorens-Martín, 2014]; | |||||||||||||||||||
8 | DHBA | CA3 | cornu Ammonis 3 | TRUE | Excitatory | CA1_distal [Knierim, 2015]; CA1_proximal [Knierim, 2015] [Witter, 2000]; CA2 [Llorens-Martín, 2014][Knierim, 2015]; CA3 [Knierim, 2015]; DG [Llorens-Martín, 2014]; | Pattern completion, information integration [Kesner, 2007 ][Rolls, 2007] | H^{III} | Integrated semantic memory and episodic memory of information from X and Z | CA1_distal (GIPA:G) | |||||||||||||||
9 | DHBA | DG | dentate gyrus | TRUE | Excitatory | CA2 [Llorens-Martín, 2014]; CA3 [Llorens-Martín, 2014][Witter, 2000]; DG [Knierim, 2015]; | Pattern separation [Kesner, 2007 ][Rolls, 2007] | H^{DG} | Integrated semantic memory | CA3 (GIPA:G) | |||||||||||||||
10 | DHBA | PFC | prefromtal cortex | A10; DFC; VFC | FALSE | ||||||||||||||||||||
11 | DHBA | EC | entorhinal cortex | MEC; LEC | Cx | FALSE | - | ||||||||||||||||||
12 | DHBA | LEC | lateral entorhinal cortex | LEC_I; LEC_II; LEC_III; LEC_V; LEC_VI | Cx | FALSE | - | ||||||||||||||||||
13 | collection | LEC_deep | deep layer of lateral entorihinal cortex | LEC_V; LEC_VI; LEC_deep_uc1 | FALSE | - | |||||||||||||||||||
14 | makeshift | LEC_deep_uc1 | deep layer of lateral entorihinal cortex, uniform circuit 1 | TRUE | Excitatory | PERI [Knierim, 2014]; | l | Predictive representation of Z (Prediction at the future time from the difference between C' and C) | PERI(GIPA:G) | PERI(Output from HF) | |||||||||||||||
15 | collection | LEC_I | lateral entorhinal cortex, layer 1 | EO1; ER1; ELR1; EMI1 | Cx1 | ||||||||||||||||||||
16 | collection | LEC_II | lateral entorhinal cortex, layer 2 | EO2; ER2; ELR2; EMI2 | Cx2 | TRUE | Excitatory | CA3 [Moser, 2010][Witter, 2000]; DG [Moser, 2010][Witter, 2000]; | Z^{II} | Abstraction of information from y^{PER} (transmission of prediction, generation of prediction signal) | CA3 (GIPA:G) | ||||||||||||||
17 | collection | LEC_III | lateral entorhinal cortex, layer 3 | EO3; ER3; ELR3; EMI3 | Cx3 | TRUE | Excitatory | CA1_distal [Moser, 2010][Witter, 2000]; S_proximal [Moser, 2010][Witter, 2000]; LEC_V [Witter, 2000]; | Z^{III} | Abstraction of information from y^{PER} (Observation transmission) | CA1_distal (GIPA:G) | ||||||||||||||
18 | collection | LEC_V | lateral entorhinal cortex, layer 5 | EO5; ER5; ELR5; EMI5 | Cx5 | PERI [Witter, 2000][Knierim, 2014]; | l | Predictive representation of Z (Prediction at the future time from the difference between C' and C) | PERI(GIPA:G) | PERI(Output from HF) | |||||||||||||||
19 | collection | LEC_VI | lateral entorhinal cortex, layer 6 | EO6; ER6; ELR6; EMI6 | Cx6 | ||||||||||||||||||||
20 | DHBA | MEC | medial entorhinal cortex | MEC_I; MEC_II; MEC_III; MEC_V; MEC_V; MEC_VI | Cx | FALSE | |||||||||||||||||||
21 | collection | MEC_I | medial entorhinal cortex, layer 1 | ELI1; Ec1; ECL1; ELC1 | Cx1 | FALSE | MEC_II [Witter, 2017][Winterer, 2017]; | ||||||||||||||||||
22 | collection | MEC_II | medial entorhinal cortex, layer 2 | ELI2; Ec2; ECL2; ELC2 | Cx2 | TRUE | Excitatory | CA2 [Llorens-Martín, 2014]; CA3 [Moser, 2010][Witter, 2000]; DG [Moser, 2010][Witter, 2000]; MEC_I [Witter, 2017][Winterer, 2017]; MEC_II [Witter, 2017][Winterer, 2017]; MEC_V [Witter, 2017][Winterer, 2017]; | Grid cells, Border cells, path integration [author, year] | X^{II} | Self-position information, predictive distribution | CA3 (GIPA:G) | |||||||||||||
23 | collection | MEC_III | medial entorhinal cortex, layer 3 | ELI3; Ec3; ECL3; ELC3 | Cx3 | TRUE | Excitatory | CA1_proximal [Moser, 2010][Witter, 2000]; MEC_II [Witter, 2017][Winterer, 2017]; MEC_III [Witter, 2017][Winterer, 2017]??; MEC_V [Witter, 2000]; S_distal [Moser, 2010][Witter, 2000]; | Grid cells, HD cells, border cells [author, year] | X^{III} | Self-posture information (position and orientation), observation likelihood | CA1_proximal (GIPA:G) | |||||||||||||
24 | collection | MEC_deep | deep layer of medial entorihinal cortex | MEC_V;MEC_VI; MEC_deep_uc1 | FALSE | ||||||||||||||||||||
25 | collection | MEC_V | medial entorhinal cortex, layer 5 | ELI5; Ec5; ECL5; ELC5 | Cx5 | MEC_II [Witter, 2017][Winterer, 2017]; MEC_III [Witter, 2017][Winterer, 2017]; MEC_V [Witter, 2017][Winterer, 2017]; VISpor [Witter, 2000][Moser, 2010]; | prospective speed calculation [author, year] | g | Predictive representation of X (Prediction at the future time regarding movement/speed amount or posture) | VISpor (GIPA:G) | VISpor (Output from HF) | ||||||||||||||
26 | collection | MEC_VI | medial entorhinal cortex, layer 6 | ELI6; Ec6; ECL6; ELC6 | Cx6 | ||||||||||||||||||||
27 | DHBA | MSN | Medial septum | MEC_II [Ohara, 2018]; | Theta phase generator input | Input to HF | |||||||||||||||||||
28 | DHBA | PaS | parasubiculum | PaS_uc1 | FALSE | MN [Bubb, 2017]; MEC_II [Moser, 2010]; | |||||||||||||||||||
29 | makeshift | PaS_uc1 | parasubiculum, uniform circuit 1 | TRUE | Excitatory | MEC_II [Moser, 2010]; | X' | Self-posture information | MEC_II (GIPA:G) | ||||||||||||||||
30 | MBA | PERI | perirhinal area | PERI_uc1; PERI_uc2 | FALSE | - | |||||||||||||||||||
31 | makeshift | PERI_uc1 | perirhinal cortex, uniform circuit 1 | TRUE | Excitatory | LEC_II [Moser, 2010] (via LEC_I); LEC_II [Witter, 2000]; | y^{PER} | Egocentric visual information (proximal distance/landmarks, relative object positions, object category, landscape information) | LEC_II (GIPA:I) | Input to HF | |||||||||||||||
32 | makeshift | PERI_uc2 | perirhinal cortex, uniform circuit 2 | TRUE | Excitatory | LEC_III [Moser, 2010][Witter, 2000]; | y^{PER} | Egocentric visual information (proximal distance/landmarks, relative object positions, object category, landscape information) | LEC_III (GIPA:I) | Input to HF | |||||||||||||||
33 | MBA | VISpor | postrhinal area | VISpor_uc1; VISpor_uc2 | FALSE | ||||||||||||||||||||
34 | makeshift | VISpor_uc1 | postrhinal cortex, uniform circuit 1 | TRUE | MEC_II [Moser, 2010](via MEC_I); MEC_II [Witter, 2000] | y^{POR} | Allocentric visual information (distal distance/landmarks, absolute object positions) | MEC_II (GIPA:I) | Input to HF | ||||||||||||||||
35 | makeshift | VISpor_uc2 | postrhinal cortex, uniform circuit 2 | TRUE | MEC_III [Moser, 2010][Witter, 2000] | y^{POR} | Allocentric visual information (distal distance/landmarks, absolute object positions) | MEC_III (GIPA:I) | Input to HF | ||||||||||||||||
36 | DHBA | PrS | presubiculum | PrS_uc1 | FALSE | ||||||||||||||||||||
37 | makeshift | PrS_uc1 | presubiculum, uniform circuit 1 | TRUE | Excitatory | MEC_III [Moser, 2010] | MEC_III (GIPA:G) | ||||||||||||||||||
38 | DHBA | RSC | retrosphlenial cortex | isocortex | FALSE | Head direction signal [author, year] | |||||||||||||||||||
39 | makeshift | RSC_uc1 | retrosphlenial cortex, uniform circit 1 | TRUE | MEC_V [Witter, 2017]; PrS [Andersen, 2006]; | u^w | Rotational speed movement | PrS (GIPA:G) | Input to HF | ||||||||||||||||
40 | DHBA | S | subiculum | S_distal; S_proximal | FALSE | ANC [Bubb, 2017]; MN [Bubb, 2017]; MEC_V [Witter, 2017]; PaS [author, year]; | |||||||||||||||||||
41 | [Bubb, 2017 | S_distal | Subiculum, distal | TRUE | PaS [Moser, 2010]; MEC_deep [Moser, 2010] | State at CA1 proximal with time delay | r' | Position distribution at the previous time | PaS (GIPA:G-Δt) | ||||||||||||||||
42 | [Bubb, 2018 | S_proximal | Subiculum, proximal | TRUE | LEC_deep [Moser, 2010] | State at CA1 distal with time delay | C' | Place category at the previous time | LEC_deep (GIPA:G-Δt) | ||||||||||||||||
43 | DHBA | ANC | anterior nuclear complex of thalamus | AD; AM; AV; LD | FALSE | ||||||||||||||||||||
44 | DHBA | MN | mammilary neucleus | MM; LM | FALSE | ||||||||||||||||||||
45 | DHBA | Cx | cerebral cortex | Cx1; Cx2; Cx3; Cx4; Cx5; Cx6; | FALSE | ||||||||||||||||||||
46 | collection | Cx.L1 | layer 1 of cerebral cortex | FALSE | |||||||||||||||||||||
47 | collection | Cx.L2 | layer 2 of cerebral cortex | FALSE | |||||||||||||||||||||
48 | collection | Cx.L3 | layer 3 of cerebral cortex | FALSE | |||||||||||||||||||||
49 | collection | Cx.L4 | layer 4 of cerebral cortex | FALSE | |||||||||||||||||||||
50 | collection | Cx.L5 | layer 5 of cerebral cortex | FALSE | |||||||||||||||||||||
51 | collection | Cx.L6 | layer 6 of cerebral cortex | FALSE | |||||||||||||||||||||
52 | |||||||||||||||||||||||||
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