A | B | C | D | E | F | G | H | I | J | K | L | M | N | O | P | Q | R | S | T | U | V | W | X | Y | Z | |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 | Var_name | Var_name_unrolled | Refference | Positon | Mutation | Genetic_region | Mutation_type | AA_sub | Nuc_sub | Last step | Aliases | |||||||||||||||
2 | A | A | C | 8782 | T | NSP4 | synonymous | S76S | C8782T | 1 | ||||||||||||||||
3 | A | A | T | 28144 | C | ORF8 | nonsynonymous | L84S | T28144C | 1 | ||||||||||||||||
4 | A.2.5.1 | A.2.5.1 | C | 275 | T | NSP1 | nonsynonymous | L4F | C275T | missing parent | ||||||||||||||||
5 | A.2.5.1 | A.2.5.1 | C | 1567 | T | NSP2 | synonymous | N254N | C1567T | missing parent | ||||||||||||||||
6 | A.2.5.1 | A.2.5.1 | C | 4543 | T | NSP3 | synonymous | T608T | C4543T | missing parent | ||||||||||||||||
7 | A.2.5.1 | A.2.5.1 | A | 5234 | G | NSP3 | nonsynonymous | K839E | A5234G | missing parent | ||||||||||||||||
8 | A.2.5.1 | A.2.5.1 | A | 5488 | G | NSP3 | synonymous | L923L | A5488G | missing parent | ||||||||||||||||
9 | A.2.5.1 | A.2.5.1 | C | 8782 | T | NSP4 | synonymous | S76S | C8782T | missing parent | ||||||||||||||||
10 | A.2.5.1 | A.2.5.1 | T | 9477 | A | NSP4 | nonsynonymous | F308Y | T9477A | missing parent | ||||||||||||||||
11 | A.2.5.1 | A.2.5.1 | C | 10029 | T | NSP4 | nonsynonymous | T492I | C10029T | missing parent | ||||||||||||||||
12 | A.2.5.1 | A.2.5.1 | C | 11005 | A | NSP6 | nonsynonymous | H11Q | C11005A | missing parent | ||||||||||||||||
13 | A.2.5.1 | A.2.5.1 | C | 12815 | T | NSP9 | synonymous | L44L | C12815T | missing parent | ||||||||||||||||
14 | A.2.5.1 | A.2.5.1 | C | 14805 | T | NSP12b | synonymous | Y446Y | C14805T | missing parent | ||||||||||||||||
15 | A.2.5.1 | A.2.5.1 | C | 16466 | T | NSP13 | nonsynonymous | P77L | C16466T | missing parent | ||||||||||||||||
16 | A.2.5.1 | A.2.5.1 | T | 16857 | C | NSP13 | synonymous | D207D | T16857C | missing parent | ||||||||||||||||
17 | A.2.5.1 | A.2.5.1 | T | 18417 | C | NSP14 | synonymous | D126D | T18417C | missing parent | ||||||||||||||||
18 | A.2.5.1 | A.2.5.1 | T | 21983 | - | SPIKE | deletion | LGV141- | T21983- | missing parent | ||||||||||||||||
19 | A.2.5.1 | A.2.5.1 | T | 21984 | - | SPIKE | deletion | LGV141- | T21984- | missing parent | ||||||||||||||||
20 | A.2.5.1 | A.2.5.1 | G | 21985 | - | SPIKE | deletion | LGV141- | G21985- | missing parent | ||||||||||||||||
21 | A.2.5.1 | A.2.5.1 | G | 21986 | - | SPIKE | deletion | LGV142- | G21986- | missing parent | ||||||||||||||||
22 | A.2.5.1 | A.2.5.1 | G | 21987 | - | SPIKE | deletion | LGV142- | G21987- | missing parent | ||||||||||||||||
23 | A.2.5.1 | A.2.5.1 | T | 21988 | - | SPIKE | deletion | LGV142- | T21988- | missing parent | ||||||||||||||||
24 | A.2.5.1 | A.2.5.1 | G | 21989 | - | SPIKE | deletion | LGV143- | G21989- | missing parent | ||||||||||||||||
25 | A.2.5.1 | A.2.5.1 | T | 21990 | - | SPIKE | deletion | LGV143- | T21990- | missing parent | ||||||||||||||||
26 | A.2.5.1 | A.2.5.1 | T | 21991 | - | SPIKE | deletion | LGV143- | T21991- | missing parent | ||||||||||||||||
27 | A.2.5.1 | A.2.5.1 | - | 22205 | C | SPIKE | nonsynonymous | D215R | -22205C | missing parent | ||||||||||||||||
28 | A.2.5.1 | A.2.5.1 | - | 22206 | G | SPIKE | nonsynonymous | D215R | -22206G | missing parent | ||||||||||||||||
29 | A.2.5.1 | A.2.5.1 | - | 22207 | G | SPIKE | nonsynonymous | D215R | -22207G | missing parent | ||||||||||||||||
30 | A.2.5.1 | A.2.5.1 | - | 22208 | C | SPIKE | nonsynonymous | L216Q | -22208C | missing parent | ||||||||||||||||
31 | A.2.5.1 | A.2.5.1 | - | 22209 | A | SPIKE | nonsynonymous | L216Q | -22209A | missing parent | ||||||||||||||||
32 | A.2.5.1 | A.2.5.1 | - | 22210 | G | SPIKE | nonsynonymous | L216Q | -22210G | missing parent | ||||||||||||||||
33 | A.2.5.1 | A.2.5.1 | - | 22211 | G | SPIKE | nonsynonymous | P217A | -22211G | missing parent | ||||||||||||||||
34 | A.2.5.1 | A.2.5.1 | - | 22212 | C | SPIKE | nonsynonymous | P217A | -22212C | missing parent | ||||||||||||||||
35 | A.2.5.1 | A.2.5.1 | - | 22213 | T | SPIKE | nonsynonymous | P217A | -22213T | missing parent | ||||||||||||||||
36 | A.2.5.1 | A.2.5.1 | A | 22525 | G | SPIKE | synonymous | Q321Q | A22525G | missing parent | ||||||||||||||||
37 | A.2.5.1 | A.2.5.1 | T | 22917 | G | SPIKE | nonsynonymous | L452R | T22917G | missing parent | ||||||||||||||||
38 | A.2.5.1 | A.2.5.1 | A | 23403 | G | SPIKE | nonsynonymous | D614G | A23403G | missing parent | ||||||||||||||||
39 | A.2.5.1 | A.2.5.1 | G | 24697 | A | SPIKE | synonymous | K1045K | G24697A | missing parent | ||||||||||||||||
40 | A.2.5.1 | A.2.5.1 | C | 25613 | T | ORF3a | nonsynonymous | S74F | C25613T | missing parent | ||||||||||||||||
41 | A.2.5.1 | A.2.5.1 | G | 25979 | T | ORF3a | nonsynonymous | G196V | G25979T | missing parent | ||||||||||||||||
42 | A.2.5.1 | A.2.5.1 | C | 26681 | T | MEMBRANE | synonymous | F53F | C26681T | missing parent | ||||||||||||||||
43 | A.2.5.1 | A.2.5.1 | T | 28144 | C | ORF8 | nonsynonymous | L84S | T28144C | missing parent | ||||||||||||||||
44 | A.2.5.1 | A.2.5.1 | A | 28272 | T | extragenic | non coding SNP | NA | A28272T | missing parent | ||||||||||||||||
45 | A.2.5.1 | A.2.5.1 | C | 28657 | T | NUCAP | synonymous | D128D | C28657T | missing parent | ||||||||||||||||
46 | A.2.5.1 | A.2.5.1 | C | 28863 | T | NUCAP | nonsynonymous | S197L | C28863T | missing parent | ||||||||||||||||
47 | A.2.5.1 | A.2.5.1 | G | 28975 | T | NUCAP | nonsynonymous | M234I | G28975T | missing parent | ||||||||||||||||
48 | A.2.5.1 | A.2.5.1 | C | 29366 | T | NUCAP | nonsynonymous | P365S | C29366T | missing parent | ||||||||||||||||
49 | A.2.5.1 | A.2.5.1 | C | 29421 | T | NUCAP | nonsynonymous | P383L | C29421T | missing parent | ||||||||||||||||
50 | A.23.1 | A.23.1 | C | 4573 | T | NSP3 | synonymous | N618N | C4573T | missing parent | ||||||||||||||||
51 | A.23.1 | A.23.1 | C | 8782 | T | NSP4 | synonymous | S76S | C8782T | missing parent | ||||||||||||||||
52 | A.23.1 | A.23.1 | C | 10747 | T | NSP5 | synonymous | N231N | C10747T | missing parent | ||||||||||||||||
53 | A.23.1 | A.23.1 | G | 11230 | T | NSP6 | nonsynonymous | M86I | G11230T | missing parent | ||||||||||||||||
54 | A.23.1 | A.23.1 | G | 11266 | T | NSP6 | nonsynonymous | L98F | G11266T | missing parent | ||||||||||||||||
55 | A.23.1 | A.23.1 | G | 11521 | T | NSP6 | nonsynonymous | M183I | G11521T | missing parent | ||||||||||||||||
56 | A.23.1 | A.23.1 | C | 16575 | T | NSP13 | synonymous | D113D | C16575T | missing parent | ||||||||||||||||
57 | A.23.1 | A.23.1 | C | 17745 | T | NSP13 | synonymous | N503N | C17745T | missing parent | ||||||||||||||||
58 | A.23.1 | A.23.1 | C | 22000 | T | SPIKE | synonymous | H146H | C22000T | missing parent | ||||||||||||||||
59 | A.23.1 | A.23.1 | C | 22033 | A | SPIKE | nonsynonymous | F157L | C22033A | missing parent | ||||||||||||||||
60 | A.23.1 | A.23.1 | G | 22661 | T | SPIKE | nonsynonymous | V367F | G22661T | missing parent | ||||||||||||||||
61 | A.23.1 | A.23.1 | G | 23401 | T | SPIKE | nonsynonymous | Q613H | G23401T | missing parent | ||||||||||||||||
62 | A.23.1 | A.23.1 | C | 23604 | G | SPIKE | nonsynonymous | P681R | C23604G | missing parent | ||||||||||||||||
63 | A.23.1 | A.23.1 | T | 24097 | C | SPIKE | synonymous | A845A | T24097C | missing parent | ||||||||||||||||
64 | A.23.1 | A.23.1 | T | 28144 | C | ORF8 | nonsynonymous | L84S | T28144C | missing parent | ||||||||||||||||
65 | A.23.1 | A.23.1 | G | 28167 | A | ORF8 | nonsynonymous | E92K | G28167A | missing parent | ||||||||||||||||
66 | A.23.1 | A.23.1 | G | 28378 | C | NUCAP | synonymous | A35A | G28378C | missing parent | ||||||||||||||||
67 | A.23.1 | A.23.1 | G | 28878 | A | NUCAP | nonsynonymous | S202N | G28878A | missing parent | ||||||||||||||||
68 | A.23.1 | A.23.1 | G | 29742 | A | UTR3 | non coding SNP | NA | G29742A | missing parent | ||||||||||||||||
69 | A.27 | A.27 | A | 361 | G | NSP1 | synonymous | G32G | A361G | 1 | ||||||||||||||||
70 | A.27 | A.27 | C | 1122 | T | NSP2 | nonsynonymous | P106L | C1122T | 1 | ||||||||||||||||
71 | A.27 | A.27 | C | 2509 | T | NSP2 | synonymous | P568P | C2509T | 1 | ||||||||||||||||
72 | A.27 | A.27 | C | 8782 | T | NSP4 | synonymous | S76S | C8782T | 0 | ||||||||||||||||
73 | A.27 | A.27 | A | 9204 | G | NSP4 | nonsynonymous | D217G | A9204G | 1 | ||||||||||||||||
74 | A.27 | A.27 | A | 11217 | G | NSP6 | nonsynonymous | N82S | A11217G | 1 | ||||||||||||||||
75 | A.27 | A.27 | C | 16466 | T | NSP13 | nonsynonymous | P77L | C16466T | 1 | ||||||||||||||||
76 | A.27 | A.27 | A | 18366 | G | NSP14 | synonymous | L109L | A18366G | 1 | ||||||||||||||||
77 | A.27 | A.27 | A | 20262 | G | NSP15 | synonymous | L214L | A20262G | 1 | ||||||||||||||||
78 | A.27 | A.27 | C | 21614 | T | SPIKE | nonsynonymous | L18F | C21614T | 1 | ||||||||||||||||
79 | A.27 | A.27 | G | 22468 | T | SPIKE | synonymous | T302T | G22468T | 1 | ||||||||||||||||
80 | A.27 | A.27 | T | 22917 | G | SPIKE | nonsynonymous | L452R | T22917G | 1 | ||||||||||||||||
81 | A.27 | A.27 | A | 23063 | T | SPIKE | nonsynonymous | N501Y | A23063T | 1 | ||||||||||||||||
82 | A.27 | A.27 | C | 23520 | T | SPIKE | nonsynonymous | A653V | C23520T | 1 | ||||||||||||||||
83 | A.27 | A.27 | C | 23525 | T | SPIKE | nonsynonymous | H655Y | C23525T | 1 | ||||||||||||||||
84 | A.27 | A.27 | G | 23948 | T | SPIKE | nonsynonymous | D796Y | G23948T | 1 | ||||||||||||||||
85 | A.27 | A.27 | G | 25218 | T | SPIKE | nonsynonymous | G1219V | G25218T | 1 | ||||||||||||||||
86 | A.27 | A.27 | T | 25541 | C | ORF3a | nonsynonymous | V50A | T25541C | 1 | ||||||||||||||||
87 | A.27 | A.27 | T | 26163 | - | ORF3a | deletion | NPVM257frmshft | T26163- | 1 | ||||||||||||||||
88 | A.27 | A.27 | C | 26164 | - | ORF3a | deletion | NPVM258frmshft | C26164- | 1 | ||||||||||||||||
89 | A.27 | A.27 | C | 26165 | - | ORF3a | deletion | NPVM258frmshft | C26165- | 1 | ||||||||||||||||
90 | A.27 | A.27 | A | 26166 | - | ORF3a | deletion | NPVM258frmshft | A26166- | 1 | ||||||||||||||||
91 | A.27 | A.27 | G | 26167 | - | ORF3a | deletion | NPVM259frmshft | G26167- | 1 | ||||||||||||||||
92 | A.27 | A.27 | T | 26168 | - | ORF3a | deletion | NPVM259frmshft | T26168- | 1 | ||||||||||||||||
93 | A.27 | A.27 | A | 26169 | - | ORF3a | deletion | NPVM259frmshft | A26169- | 1 | ||||||||||||||||
94 | A.27 | A.27 | A | 26170 | - | ORF3a | deletion | NPVM260frmshft | A26170- | 1 | ||||||||||||||||
95 | A.27 | A.27 | C | 27247 | T | ORF6 | synonymous | L16L | C27247T | 1 | ||||||||||||||||
96 | A.27 | A.27 | A | 27387 | - | ORF6 | deletion | *62frmshft | A27387- | 1 | ||||||||||||||||
97 | A.27 | A.27 | T | 28144 | C | ORF8 | nonsynonymous | L84S | T28144C | 0 | ||||||||||||||||
98 | A.27 | A.27 | G | 28248 | - | ORF8 | deletion | DF119- | G28248- | 1 | ||||||||||||||||
99 | A.27 | A.27 | A | 28249 | - | ORF8 | deletion | DF119- | A28249- | 1 | ||||||||||||||||
100 | A.27 | A.27 | T | 28250 | - | ORF8 | deletion | DF119- | T28250- | 1 |