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2 | Bio427 Schedule -- Spring 2024 -- Dr. Madelaine Bartlett | |||||||||||||||||||||||||
3 | Week | Date | Day | Class/Lab | Module | Lecture/Paper/Lab/Exam or Deadline | Notes | |||||||||||||||||||
4 | Week 1 | 2/5/24 | M | Plant evolution and architecture I | Plant Evolution and Architecture | L1 | Class intro. Major lineages, emergence over deep time. Intro to tree thinking (mosses are NOT basal or ancestral) | |||||||||||||||||||
5 | 2/7/24 | W | Plant evolution and architecture II | L2 | Vascular plant architecture I - leaves, branching (name those parts!). meristems | |||||||||||||||||||||
6 | 2/7/24 | W | lab 1 | The naming of parts. Find the leaf. lycophytes, bryophytes, diversity, alstoemeria, Ruscus | ||||||||||||||||||||||
7 | Week 2 | 2/12/24 | M | Plant evolution and architecture III | L3 | life cycles I - ferns | ||||||||||||||||||||
8 | 2/14/2024 | W | Plant evolution and architecture IV | L4 | life cycles II | |||||||||||||||||||||
9 | 2/14/2024 | W | lab 2 | ferns, fern life cycles - gametophytes, sporophytes; tree thinking/traits on a tree. fern gametophytes, prepared slides | ||||||||||||||||||||||
10 | Week 3 | 2/19/2024 | M | No class - President's Day | Fruits | NA | ||||||||||||||||||||
11 | 2/21/2024 | W | fruits I | L5 | what is a fruit? angiosperm life cycles and sex | |||||||||||||||||||||
12 | 2/21/2024 | W | team project day 1 | discuss the team assignments, start working with individual plant | Polytrichum - antheridia held in splash cup | |||||||||||||||||||||
13 | 2/22/24 | Th | fruits II | L6 | gymnosperm life cycles | 2/22 = monday schedule | ||||||||||||||||||||
14 | Week 4 | 2/26/24 | M | fruits III | L7 | MBW complexes, protein-protein interactions | ||||||||||||||||||||
15 | 2/28/24 | W | fruits IV | L8 | Noemi | |||||||||||||||||||||
16 | 2/28/24 | W | lab 3 | fruit diversity (grocery store) including Citrus diversity; seed plant life cycles | ||||||||||||||||||||||
17 | 3/1/24 | F | deadline: team assignment part 1 | draft of the first 'systematics' part, one or two ideas on what feature they'll be focusing on, and a plan for dividing up/completing the work | ||||||||||||||||||||||
18 | Week 5 | 3/4/24 | M | fruits V | L9 | original CLV1/3 paper; reverse logic of genetics | ||||||||||||||||||||
19 | 3/6/24 | W | fruits VI | L10 | paper discussion: Rodriguez-Leal 2017 | |||||||||||||||||||||
20 | 3/6/24 | W | lab 4 | clv1 and wus mutants from maize arabidopsis; diversity through modulating branching | ||||||||||||||||||||||
21 | Week 6 | 3/11/24 | M | review session | What is a flower? sporangia | |||||||||||||||||||||
22 | 3/13/24 | W | exam 1 | exam 1 | Madelaine at UPenn | |||||||||||||||||||||
23 | Week 7 | 3/18/24 | M-F | No class - Spring Break | NA | |||||||||||||||||||||
24 | Week 8 | 3/25/24 | M | flowers I | Flowers | L11 | what is a flower? pollination and fertilization | |||||||||||||||||||
25 | 3/27/24 | W | flowers II | L12 | what is a flower? pollination and fertilization II | |||||||||||||||||||||
26 | 3/27/24 | W | team project day 2 | discuss the presentations and infographic/video - 3-4 intro slides: (1) systematics overview, (2-3) developmental genetics, (4) modifications/engineering. Then - walk through informational graphic or video. | ||||||||||||||||||||||
27 | Week 9 | 4/1/24 | M | flowers III | L13 | gamete type specification | ||||||||||||||||||||
28 | 4/3/24 | W | flowers IV | L14 | floral diversity I - diversity in sexuality, pollination, evolution of the flower | |||||||||||||||||||||
29 | 4/3/24 | W | lab 5 | grocery store floral diversity | ||||||||||||||||||||||
30 | Week 10 | 4/8/24 | M | flowers V - recorded lecture | L15 | floral diversity II - diversity happens at the tips | Madelaine out of town - remote lecture | |||||||||||||||||||
31 | 4/10/24 | W | flowers VI | L16 | ABC(DE) model | |||||||||||||||||||||
32 | 4/10/24 | W | lab 6 | arabidopsis and maize ABC(E) mutants | ||||||||||||||||||||||
33 | 4/12/24 | F | deadline: team assignment part 2 | draft of the second 'developmental genetics' part, and a plan for the presentation and informational graphic/video | ||||||||||||||||||||||
34 | 4/12/24 | F | class canceled | CANCELED | 4/12 = monday schedule | |||||||||||||||||||||
35 | Week 11 | 4/15/24 | M | No class - Patriot's Day | NA | |||||||||||||||||||||
36 | 4/16/24 | T | exam review session - 5 pm | |||||||||||||||||||||||
37 | 4/17/24 | W | exam 2 | exam 2 | ||||||||||||||||||||||
38 | Week 12 | 4/22/24 | M | leaves I | Leaves | L17 | evolution of macrophylls, leaf domains, leaf development 1 | |||||||||||||||||||
39 | 4/24/24 | W | leaves II | L18 | leaf diversity - playing with domains | |||||||||||||||||||||
40 | 4/24/24 | W | team project day 3 | |||||||||||||||||||||||
41 | Week 13 | 4/29/24 | M | leaves III | L19 | Utricularia leaf development | ||||||||||||||||||||
42 | 5/1/24 | W | leaves IV | L20 | evolution of CCMs or modification of photosynthesis | |||||||||||||||||||||
43 | 5/1/24 | W | lab 7 | leaf morphological diversity, patterning mutants | ||||||||||||||||||||||
44 | Week 14 | 5/6/24 | M | leaves V | L21 | leaf development continued, non-coding sequence change | ||||||||||||||||||||
45 | 5/8/24 | W | leaves VI | L22 | RCO | |||||||||||||||||||||
46 | 5/8/24 | W | team project presentations | team presentations in class (10 min, 2-3 min for questions) | ||||||||||||||||||||||
47 | 5/10/24 | F | deadline: team assignment part 3 | write-up and infographic | https://www.science.org/doi/full/10.1126/science.adc9831?casa_token=yCgYXFotMb4AAAAA%3ARtZ1K93nSjhDQAQb99bWHiaqEmpNCPBrjSjFLCtavpx7noN9veIpCNP9vrLfhCgEeUW7RvfoHnBo | |||||||||||||||||||||
48 | Week 15 | TBC | TBC | exam 3 | exam 3 | http://csip.cornell.edu/Curriculum_Resources/CEIRP/Photosynthesis_Student.htm | ||||||||||||||||||||
49 | Week 15 | 5/13/24 | M-F | exam 3 in finals week | Finals Week | https://www.sciencedirect.com/topics/engineering/stomatal-aperture | ||||||||||||||||||||
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