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1 | family | genus | species | strain | partner_type | tissue_source | resource_type | methods | research_group | contact | publication_status | anticipated_release_date | data_link | publication_link | publication_reference | notes | |||||||||||||||
2 | Scleractinia | Acroporidae | Acropora | millepora | NA | host | holobiont | genome | PacBio / 10x genomics / Illumina | Matz, Przeworski | matz@utexas.edu, mp3284@columbia.edu | published | released | https://www.dropbox.com/s/hezqx79m3fk1l8e/Amil_v2.01_annotated.zip?dl=0 | https://doi.org/10.1126/science.aba4674 | ||||||||||||||||
24 | Scleractinia | Merulinidae | Cyphastrea | microphthalma | host | genome | short read | Parisa Alidoost Salimi/Pargol Ghavam Mostafavi | P_Alidoostsalimi@yahoo.com | published | https://link.springer.com/article/10.1007/s11033-021-06251-x | Alidoost Salimi et al. 2021, Mol Biol Rep. | |||||||||||||||||||
28 | Scleractinia | Merulinidae | Favites | pentagona | host | genome | short read | Parisa Alidoost Salimi/Pargol Ghavam Mostafavi | P_Alidoostsalimi@yahoo.com | published | https://link.springer.com/article/10.1007/s11033-021-06251-x | Alidoost Salimi et al. 2021, Mol Biol Rep. | |||||||||||||||||||
34 | Scleractinia | Poritidae | Goniopora | columna | host | genome | short read | Parisa Alidoost Salimi/Pargol Ghavam Mostafavi | P_Alidoostsalimi@yahoo.com | published | https://link.springer.com/article/10.1007/s11033-021-06251-x | Alidoost Salimi et al. 2021, Mol Biol Rep. | |||||||||||||||||||
35 | Scleractinia | Poritidae | Goniopora | djiboutiensis | host | genome | short read | Parisa Alidoost Salimi/Pargol Ghavam Mostafavi | P_Alidoostsalimi@yahoo.com | published | https://link.springer.com/article/10.1007/s11033-021-06251-x | Alidoost Salimi et al. 2021, Mol Biol Rep. | |||||||||||||||||||
40 | Scleractinia | Faviidae | Montastraea | cavernosa | NA | host | holobiont | genome | PacBio / 10x genomics | Matz | matz@utexas.edu | published | released | https://www.dropbox.com/s/yfqefzntt896xfz/Mcavernosa_genome.tgz | https://doi.org/10.1111/mec.15931 | Rippe et al 2021, Molecular Ecology | |||||||||||||||
45 | Scleractinia | Acroporidae | Montipora | capitata | host | sperm | genome | PacBio, hybrid | Bhattacharya, Putnam | hputnam@uri.edu | published | released | http://cyanophora.rutgers.edu/montipora/ | https://www.nature.com/articles/s41598-019-39274-3 | Shumaker et al 2019 | ||||||||||||||||
60 | Scleractinia | Agariciidae | Pavona | cactus | host | genome | short read | Parisa Alidoost Salimi/Pargol Ghavam Mostafavi | P_Alidoostsalimi@yahoo.com | published | https://link.springer.com/article/10.1007/s11033-021-06251-x | Alidoost Salimi et al. 2021, Mol Biol Rep. | |||||||||||||||||||
61 | Scleractinia | Agariciidae | Pavona | decussata | host | genome | short read | Parisa Alidoost Salimi/Pargol Ghavam Mostafavi | P_Alidoostsalimi@yahoo.com | published | https://link.springer.com/article/10.1007/s11033-021-06251-x | Alidoost Salimi et al. 2021, Mol Biol Rep. | |||||||||||||||||||
62 | Scleractinia | Merulinidae | Platygyra | daedalea | host | genome | short read | Parisa Alidoost Salimi/Pargol Ghavam Mostafavi | P_Alidoostsalimi@yahoo.com | published | https://link.springer.com/article/10.1007/s11033-021-06251-x | Alidoost Salimi et al. 2021, Mol Biol Rep. | |||||||||||||||||||
84 | Scleractinia | Siderastreidae | Siderastrea | savignyana | host | holobiont | genome | short read | Parisa Alidoost Salimi/Pargol Ghavam Mostafavi | P_Alidoostsalimi@yahoo.com | published | https://link.springer.com/article/10.1007/s11033-021-06251-x | Alidoost Salimi et al. 2021, Mol Biol Rep. | ||||||||||||||||||
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