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1 | Linked data table for pirmary biodiversity data. Legend: 1 - Two groups of specimens/taxa related to each other in the context of the study; 2 - Data types (not changeable, linked to the appropriate ontology terms, whenever possible); 3 - Column names (not changeable, linked to the appropriate ontology terms, whenever possible); 4 - Specimen/taxon data; 5 - Linked to a resource; 6 - Linked by (author or publisher). | |||||||||||||||||||||||
2 | 1 | Specimens/Taxa group A (core/source species) | Biotic intercations (after OBO Relation Ontology) | Specimens/Taxa group B (related/target species) | Source of information | |||||||||||||||||||
3 | 2 | Preserved specimen | Type status | Associated sequences | Taxon name/MOTU | Other thematic repositories | Location | Habitat / Envoronment (after ENVO Ontology) | Preserved specimen | Associated sequences | Taxon name/MOTU | |||||||||||||
4 | 3 | Specimen code (InstCode and/or CollCode + Catalogue #) | Gene name #1 | Gene name #n | Persistent identifier (PID) (e.g. of images dataset) | Persistent identifier (PID) (e.g. of sound recordings) | Geolocation name / locality | Latitude | Longitude | Specimen code | Gene name #1 | Gene name #n | ||||||||||||
5 | 4 | |||||||||||||||||||||||
6 | 5 | GBIF, iDigBio, or DiSSCo | INSDC (GenBank, ENA or DDBJ) | INSDC (GenBank, ENA or DDBJ | Pensoft Taxon Profile | Image repository | Sound records repository | Geonames.org | Google Maps | Google Maps | ENVO vocabulary | OBO term vocabulary | GBIF, iDigBio, or DiSSCo | INSDC (GenBank, ENA or DDBJ) | INSDC (GenBank, ENA or DDBJ | Pensoft Taxon Profile | DOI, Source URL | |||||||
7 | 6 | Author | Pensoft | Pensoft | Pensoft | Author | Author | Author | Pensoft | Pensoft | Pensoft | Pensoft | Author | Pensoft | Pensoft | Pensoft | Author | |||||||
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9 | Stepwise instructions for table formatting (please also read and follow the guidelines in the Linked Data Table section of the Author Guidelines) | |||||||||||||||||||||||
10 | 1 | Make a copy in Google Spreadsheets (Make a copy in the File menu) or download the table in Excel, CSV or TSV to get an editable template of the table | ||||||||||||||||||||||
11 | 2 | Fill in your data | ||||||||||||||||||||||
12 | 3 | Delete empty columns or add new ones to adjust the table to the structure of your data | ||||||||||||||||||||||
13 | 4 | Delete the last two rows and these instructions | ||||||||||||||||||||||
14 | 5 | Edit the table caption always starting with: "Linked data table..." | ||||||||||||||||||||||
15 | 7 | Insert the table into your manuscript and/or submit it as a supplementary data file | ||||||||||||||||||||||
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