| A | B | C | D | E | F | G | H | I | J | K | L | M | N | O | P | Q | R | S | T | U | V | W | X | Y | Z | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 | Enzyme | Mutation | Antibiotic | Vector | Cell Line | Note | Date | |||||||||||||||||||
2 | Box K1 | |||||||||||||||||||||||||
3 | 1 | UXS Truncated | AMP | pET15b | BL21 | 5/12/2008 | ||||||||||||||||||||
4 | 2 | UXS Truncated | AMP | pET15b | BL21 | 5/20/2008 | ||||||||||||||||||||
5 | 3 | hUGDH | AMP | pET15b | DE3 PLysS | Replaced with 100 in box K2 | 6/3/2008 | |||||||||||||||||||
6 | 4 | UXS Truncated | R236H | AMP | pET15b | BL21 | 6/16/2008 | |||||||||||||||||||
7 | 5 | UXS Truncated | Y231F | AMP | pET15b | BL21 | 8/11/2008 | |||||||||||||||||||
8 | 6 | UXS Truncated | Y231F | AMP | pET15b | BL21 | 8/21/2008 | |||||||||||||||||||
9 | 7 | UXS Truncated | R236A | AMP | pET15b | DH5α | 8/21/2008 | |||||||||||||||||||
10 | 8 | UXS Truncated | R236A | AMP | pET15b | BL21 | 8/25/2008 | |||||||||||||||||||
11 | 9 | Human O-GlcNAC Transferase | AMP & CAM | Gateway cloning vector | BL21 | includes HA tag | 9/24/2008 | |||||||||||||||||||
12 | 10 | Human O-GlcNAC Transferase | AMP & CAM | Gateway cloning vector | BL21 | includes HA tag | 9/24/2008 | |||||||||||||||||||
13 | 11 | UXS Truncated | G188A | AMP | pET15b | DH5α | 1/30/2009 | |||||||||||||||||||
14 | 12 | UXS Truncated | NAD-loop deletion | AMP | pET15b | DH5α | 1/30/2009 | |||||||||||||||||||
15 | 13 | UXS Truncated | Y168H | AMP | pET15b | DH5α | 1/30/2009 | |||||||||||||||||||
16 | 14 | hUGDH | 9 lysines mutant | AMP | pET15b | BL21 | 1/30/2009 | |||||||||||||||||||
17 | 15 | hUGDH | 9 lysines mutant | AMP | pET15b | C41 cells | 1/30/2009 | |||||||||||||||||||
18 | 16 | hUGDH | 9 lysines mutant | AMP | pET15b | C41 cells | 1/30/2009 | |||||||||||||||||||
19 | 17 | hUGDH | 9 lysines mutant | AMP | pET15b | GenX Cells | 1/30/2009 | |||||||||||||||||||
20 | 18 | hUGDH | 9 lysines mutant | AMP | pET15b | BL21 pLysS | 1/30/2009 | |||||||||||||||||||
21 | 19 | hUGDH | 9 lysines mutant | AMP | pET15b | 1/30/2009 | ||||||||||||||||||||
22 | 20 | UXS Truncated | NAD-loop deletion | AMP | pET15b | BL21 GenX Cells | 1/30/2009 | |||||||||||||||||||
23 | 21 | UXS Truncated | NAD-loop deletion | AMP | pET15b | BL21 pLysS | 1/30/2009 | |||||||||||||||||||
24 | 22 | UXS Truncated | NAD-loop deletion | AMP | pET15b | Rosetta2 | 1/30/2009 | |||||||||||||||||||
25 | 23 | UXS Truncated | NAD-loop deletion | AMP | pET15b | BL21 | 1/30/2009 | |||||||||||||||||||
26 | 24 | UXS Truncated | G188A | AMP | pET15b | BL21 | 1/30/2009 | |||||||||||||||||||
27 | 25 | UXS Truncated | G188A | AMP | pET15b | BL21 pLysS | 1/30/2009 | |||||||||||||||||||
28 | 26 | UXS Truncated | G188A | AMP | pET15b | Rosetta2 | 1/30/2009 | |||||||||||||||||||
29 | 27 | UXS Truncated | G188A | AMP | pET15b | C41 cells | 1/30/2009 | |||||||||||||||||||
30 | 28 | UXS Truncated | Y168H | AMP | pET15b | BL21 | 1/30/2009 | |||||||||||||||||||
31 | 29 | UXS Truncated | Y168H | AMP | pET15b | BL21 GenX Cells | 1/30/2009 | |||||||||||||||||||
32 | 30 | UXS Truncated | Y168H | AMP | pET15b | BL21 pLysS | 1/30/2009 | |||||||||||||||||||
33 | 31 | UXS Truncated | Y168H | AMP | pET15b | Rosetta2 | 1/30/2009 | |||||||||||||||||||
34 | 32 | UXS Truncated | Y168H | AMP | pET15b | C41 cells | 1/30/2009 | |||||||||||||||||||
35 | 33 | TEV | AMP & CAM | pTh24 | Rosetta pLysS | |||||||||||||||||||||
36 | 34 | JBP2 Full-Length | ||||||||||||||||||||||||
37 | 35 | JBP2 Truncated (1-540) | ||||||||||||||||||||||||
38 | 36 | JBP1 LT | ||||||||||||||||||||||||
39 | 37 | Similar to ArnA (Maors Lab?) | Makes a lot of ketose, and little xylose | |||||||||||||||||||||||
40 | 38 | hUGDH | Δ132 | AMP | pET15b | Rosetta pLysS | ||||||||||||||||||||
41 | 39 | cUGDH | KAN & CAM | pET24D | Rosetta pLysS | From Doering lab | ||||||||||||||||||||
42 | 40 | pgUGDH | AMP | pET15b | Rosetta pLysS | 10/26/2009 | ||||||||||||||||||||
43 | 41 | pgUGDH | AMP | pET15b | Rosetta pLysS | Dilute | 11/4/2009 | |||||||||||||||||||
44 | 42 | pgUGDH | AMP | pET15b | Rosetta pLysS | Dilute | 11/4/2009 | |||||||||||||||||||
45 | 43 | UXS Truncated | Y231F and NAD-loop deletion | AMP | pET15b | DH5α | 11/6/2009 | |||||||||||||||||||
46 | 44 | hUGDH | C276A | AMP | pET15b | DH5α | 11/6/2009 | |||||||||||||||||||
47 | 45 | hUGDH | D280N | AMP | pET15b | DH5α | ||||||||||||||||||||
48 | 46 | hUGDH | K279A | AMP | pET15b | DH5α | ||||||||||||||||||||
49 | 47 | C. Neoformans UXS | pET28A | +HIS, replate before use | ||||||||||||||||||||||
50 | 48 | C. Neoformans UXS | pET24D | -HIS, replate before use | ||||||||||||||||||||||
51 | 49 | C. Neoformans UGDH | pET24D | DH5α | replate before use | |||||||||||||||||||||
52 | 50 | C. Neoformans UXS | pProEXTC | DH5α | replate before use | |||||||||||||||||||||
53 | 51 | C. Neoformans UGDH | pProcEXHT | DH5α | replate before use | |||||||||||||||||||||
54 | 52 | ArnA (E. coli) | KAN | pMS159 | Rosetta pLysS | decarboxylase domain (from M. Sousa lab) | 2/9/2010 | |||||||||||||||||||
55 | 53 | UXS Truncated | NADH loop modification (VΔFFT)G(ΔR) | AMP | pET15b | DH5α | 5/25/2010 | |||||||||||||||||||
56 | 54 | hUGDH | D280N | AMP | pET15b | Rosetta pLysS | 5/28/2010 | |||||||||||||||||||
57 | 55 | hUGDH | C276A | AMP | pET15b | Rosetta pLysS | 5/28/2010 | |||||||||||||||||||
58 | 56 | UXS Truncated | NADH loop modification (VΔFFT)G(ΔR) | AMP | pET15b | Rosetta pLysS | 5/28/2010 | |||||||||||||||||||
59 | 57 | UXS Truncated | NADH loop modification (VΔFFT)G(ΔR)T176A | AMP | pET15b | Rosetta pLysS | 5/28/2010 | |||||||||||||||||||
60 | 58 | UXS Truncated | NADH loop modification (VΔFFT)G(ΔR)T176A | AMP | pET15b | DH5α | 6/4/2010 | |||||||||||||||||||
61 | 59 | hUGDH (full-length) | C276A | AMP | pET15b | BL21-T1R | ||||||||||||||||||||
62 | 60 | hUGDH (full-length) | A225L | AMP | pET15b | BL21-T1R | ||||||||||||||||||||
63 | 61 | hUGDH (full-length) | D280N | AMP | pET15b | BL21-T1R | ||||||||||||||||||||
64 | 62 | hUGDH (full-length) | K279A | AMP | pET15b | BL21-T1R | ||||||||||||||||||||
65 | 63 | hUGDH (full-length) | K94E | AMP | pET15b | BL21-T1R | ||||||||||||||||||||
66 | 64 | ArnA | F125A | KAN | pET-28 | DH5α | ||||||||||||||||||||
67 | 65 | ArnA | F125A | KAN | pET-28 | BL21-T1R | ||||||||||||||||||||
68 | 66 | ArnA | KAN | BL21-T1R | ||||||||||||||||||||||
69 | 67 | UXS Truncated | NAD-loop deletion (ΔFFT) | AMP | pET15b | BL21-T1R | 6/8/2011 | |||||||||||||||||||
70 | 68 | ArnA | KAN | BL21-T1R | very slow growth | |||||||||||||||||||||
71 | 69 | GDH | KAN | BL21-T1R | ||||||||||||||||||||||
72 | 70 | CgIMPDH | KAN | BL21-T1R | ||||||||||||||||||||||
73 | 71 | hUGDH Truncated (1-465) | A225L | AMP | BL21-T1R | |||||||||||||||||||||
74 | 72 | hGHPR | AMP | pSGX3 | BL21-T1R | |||||||||||||||||||||
75 | 73 | KPR | KAN | pSGX3 | BL21-T1R | |||||||||||||||||||||
76 | ||||||||||||||||||||||||||
77 | Box K2 | |||||||||||||||||||||||||
78 | 74 | KPR | I244A | KAN | pSGX3 | BL21-T1R | ||||||||||||||||||||
79 | 75 | KPR | A181L | KAN | pSGX3 | BL21-T1R | (S. aureus) | |||||||||||||||||||
80 | 76 | UXS | P148A & Y150A | AMP | pET15b | BL21-T1R | ||||||||||||||||||||
81 | 77 | UXS | BL21-T1R | (wild-type) | ||||||||||||||||||||||
82 | 78 | UXS | P148A & Y150A | AMP | pET15b | BL21-T1R | ||||||||||||||||||||
83 | 79 | hUGDH Truncated | E165Q | AMP | pET15b | BL21-T1R | ||||||||||||||||||||
84 | 80 | PUC18 | AMP | pLysS | 9/25/2011 | |||||||||||||||||||||
85 | 81 | hUGDH (wild-type) + ArnA | AMP & KAN | Rosetta pLysS | 4/19/2010 | |||||||||||||||||||||
86 | 82 | hUGDH Truncated (1-465) | AMP | pET15b | BL21-T1R | 7/18/2012 | ||||||||||||||||||||
87 | 83 | KPR | KAN | pSGX3 | BL21-T1R | 7/18/2012 | ||||||||||||||||||||
88 | 84 | Glutathione Reductase | AMP | pET14b | BL21-T1R | B. Henselae | ||||||||||||||||||||
89 | 85 | hUGDH Truncated (1-465) | A82L | AMP | pET15b | BL21-T1R | ||||||||||||||||||||
90 | 86 | A415LGR | AMP | pET14b | B. Henselae | |||||||||||||||||||||
91 | 87 | L417FGR | AMP | pET14b | B. Henselae | |||||||||||||||||||||
92 | 89 | KPR | A201L | KAN | BL21 | |||||||||||||||||||||
93 | 90 | hUGDH Truncated (1-465) | R141C | AMP | BL21 | |||||||||||||||||||||
94 | 91 | hUGDH Truncated (1-465) | F323-N324-T32S-V236 T327 to D323 D325 V326 V327 | AMP | pET15b | BL21 | M11 Dimer (Truncated) | |||||||||||||||||||
95 | 92 | hUGDH | R141C | AMP | pET15b | DH5α | WRONG? | |||||||||||||||||||
96 | 93 | hUGDH | T253W & E250H | AMP | pET15b | BL21 | 8/5/2013 | |||||||||||||||||||
97 | 94 | hUGDH | T253W | AMP | pET15b | BL21 | 1/23/2014 | |||||||||||||||||||
98 | 95 | hUGDH | Y473E | AMP | pET15b | BL21 | 2/27/2014 | |||||||||||||||||||
99 | 96 | ID-Peptide hUGDH | KAN | BL21 | ID-tail peptide construct 1 | 2/27/2014 | ||||||||||||||||||||
100 | 97 | ID-Peptide hUGDH | AMP | pET14b | ID-tail peptide construct 2 | 3/12/2014 |