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1 | in general... | |||||||||||||||||||||||||
2 | ||||||||||||||||||||||||||
3 | # of reactions | |||||||||||||||||||||||||
4 | prepare as if there were | |||||||||||||||||||||||||
5 | ||||||||||||||||||||||||||
6 | per reaction | total to make of mastermix | ||||||||||||||||||||||||
7 | ||||||||||||||||||||||||||
8 | reagent | quantity (units) | reagent | quantity (units) | ||||||||||||||||||||||
9 | ||||||||||||||||||||||||||
10 | Generic Thing A | Generic Thing A | quantity per reaction of Generic Thing A * "prepare as if there were" number | |||||||||||||||||||||||
11 | Generic Thing B | Generic Thing B | quantity per reaction of Generic Thing B * "prepare as if there were" number | |||||||||||||||||||||||
12 | Generic Thing C | Generic Thing C | quantity per reaction of Generic Thing B * "prepare as if there were" number | |||||||||||||||||||||||
13 | Generic Thing D | Generic Thing D | quantity per reaction of Generic Thing B * "prepare as if there were" number | |||||||||||||||||||||||
14 | ||||||||||||||||||||||||||
15 | unique thing | |||||||||||||||||||||||||
16 | ||||||||||||||||||||||||||
17 | final volume | sum of all above columns | volume mastermix to make | sum of all above columns | ||||||||||||||||||||||
18 | ||||||||||||||||||||||||||
19 | amount of master mix per sample | sum of all generic | ||||||||||||||||||||||||
20 | ||||||||||||||||||||||||||
21 | an example (for an RNA labeling reaction) | |||||||||||||||||||||||||
22 | ||||||||||||||||||||||||||
23 | # of reactions | 8 | ||||||||||||||||||||||||
24 | prepare as if there were | 9.5 | ||||||||||||||||||||||||
25 | ||||||||||||||||||||||||||
26 | per reaction | total to make of mastermix | ||||||||||||||||||||||||
27 | ||||||||||||||||||||||||||
28 | reagent | quantity (μL) | reagent | quantity (μL) | ||||||||||||||||||||||
29 | ||||||||||||||||||||||||||
30 | 10X PNK buffer | 5 | 10X PNK buffer | 47.5 | ||||||||||||||||||||||
31 | water | 37 | water | 351.5 | ||||||||||||||||||||||
32 | hot ATP | 5 | hot ATP | 47.5 | ||||||||||||||||||||||
33 | PNK | 1 | PNK | 9.5 | ||||||||||||||||||||||
34 | ||||||||||||||||||||||||||
35 | RNA (at 50 μM) | 2 | ||||||||||||||||||||||||
36 | ||||||||||||||||||||||||||
37 | final volume | 50 | volume mastermix to make | 456 | ||||||||||||||||||||||
38 | ||||||||||||||||||||||||||
39 | amount of master mix per sample | 48 | ||||||||||||||||||||||||
40 | ||||||||||||||||||||||||||
41 | ||||||||||||||||||||||||||
42 | ||||||||||||||||||||||||||
43 | ||||||||||||||||||||||||||
44 | ||||||||||||||||||||||||||
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