| A | B | C | D | E | F | G | H | I | J | K | L | M | N | O | P | Q | R | S | T | U | V | W | X | Y | Z | AA | AB | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 | PATIENT_BARCODE | SAMPLE_BARCODE | DISEASE | SUBTYPE | SQUAMOUS | COMPLETE | n=9,125 patients | |||||||||||||||||||||
2 | TCGA-OR-A5J1 | TCGA-OR-A5J1-01 | ACC | Not_Applicable | Each patient has been mapped to a single sample barcode | |||||||||||||||||||||||
3 | TCGA-OR-A5J2 | TCGA-OR-A5J2-01 | ACC | Not_Applicable | All of these samples have code 01 for primary solid tumor, except some samples with code for primary blood derived cancer (03, n=115, all LAML) and some samples with code for metastatic solid tumor (06, n=357, all SKCM). | |||||||||||||||||||||||
4 | TCGA-OR-A5J3 | TCGA-OR-A5J3-01 | ACC | Not_Applicable | ||||||||||||||||||||||||
5 | TCGA-OR-A5J5 | TCGA-OR-A5J5-01 | ACC | Not_Applicable | ||||||||||||||||||||||||
6 | TCGA-OR-A5J6 | TCGA-OR-A5J6-01 | ACC | Not_Applicable | Log of recent changes: | |||||||||||||||||||||||
7 | TCGA-OR-A5J7 | TCGA-OR-A5J7-01 | ACC | Not_Applicable | Date | Change | Person | |||||||||||||||||||||
8 | TCGA-OR-A5J8 | TCGA-OR-A5J8-01 | ACC | Not_Applicable | 01/04/17 | Removed duplicated patient and sample barcode (TCGA-2G-AAKO, of TGCT type) | FSV | |||||||||||||||||||||
9 | TCGA-OR-A5J9 | TCGA-OR-A5J9-01 | ACC | Not_Applicable | 01/05/17 | Fixed error in 357 SKCM sample barcodes previously labeled as -05, now relabeled as -06 | FSV | |||||||||||||||||||||
10 | TCGA-OR-A5JA | TCGA-OR-A5JA-01 | ACC | Not_Applicable | 01/26/17 | Updated sample_barcode for 4 SKCM patients (TCGA-D9-A1X3, TCGA-D9-A4Z6, TCGA-HR-A2OG,TCGA-HR-A2OH), from -01 to -06, to reflect MAF contents | FSV | |||||||||||||||||||||
11 | TCGA-OR-A5JB | TCGA-OR-A5JB-01 | ACC | Not_Applicable | 02/08/17 | Sample TCGA-CS-6669 had been erroneously labeled as GBM, when it is in fact LGG. This has been fixed. | FSV | |||||||||||||||||||||
12 | TCGA-OR-A5JC | TCGA-OR-A5JC-01 | ACC | Not_Applicable | 02/21/17 | Samples for patients TCGA-H7-A6C5 (HNSC) and TCGA-44-6144 (LUAD) have been excluded because RNA-Seq was only available for the normal sample, and not the tumor sample | FSV | |||||||||||||||||||||
13 | TCGA-OR-A5JD | TCGA-OR-A5JD-01 | ACC | Not_Applicable | 02/23/17 | Added 47 LAML samples based on the updated MC3 2.8 MAF with LAML patch | FSV | |||||||||||||||||||||
14 | TCGA-OR-A5JE | TCGA-OR-A5JE-01 | ACC | Not_Applicable | 02/09/18 | Sample TCGA-JX-A3Q8 in CESC was labeled as subtype AdenoCarcinoma (previously listed as NA) | FSV | |||||||||||||||||||||
15 | TCGA-OR-A5JF | TCGA-OR-A5JF-01 | ACC | Not_Applicable | 02/21/18 | This table was updated to reflect the new POLE assignments in UCEC that we had submitted to Cell in November 2017 (there should now be n=49 POLE samples in UCEC) | FSV | |||||||||||||||||||||
16 | TCGA-OR-A5JG | TCGA-OR-A5JG-01 | ACC | Not_Applicable | ||||||||||||||||||||||||
17 | TCGA-OR-A5JI | TCGA-OR-A5JI-01 | ACC | Not_Applicable | ||||||||||||||||||||||||
18 | TCGA-OR-A5JJ | TCGA-OR-A5JJ-01 | ACC | Not_Applicable | Please email suggestions and feedback to: sanchezf@cbio.mskcc.org | |||||||||||||||||||||||
19 | TCGA-OR-A5JK | TCGA-OR-A5JK-01 | ACC | Not_Applicable | ||||||||||||||||||||||||
20 | TCGA-OR-A5JL | TCGA-OR-A5JL-01 | ACC | Not_Applicable | ||||||||||||||||||||||||
21 | TCGA-OR-A5JM | TCGA-OR-A5JM-01 | ACC | Not_Applicable | ||||||||||||||||||||||||
22 | TCGA-OR-A5JO | TCGA-OR-A5JO-01 | ACC | Not_Applicable | ||||||||||||||||||||||||
23 | TCGA-OR-A5JP | TCGA-OR-A5JP-01 | ACC | Not_Applicable | ||||||||||||||||||||||||
24 | TCGA-OR-A5JQ | TCGA-OR-A5JQ-01 | ACC | Not_Applicable | ||||||||||||||||||||||||
25 | TCGA-OR-A5JR | TCGA-OR-A5JR-01 | ACC | Not_Applicable | ||||||||||||||||||||||||
26 | TCGA-OR-A5JS | TCGA-OR-A5JS-01 | ACC | Not_Applicable | ||||||||||||||||||||||||
27 | TCGA-OR-A5JT | TCGA-OR-A5JT-01 | ACC | Not_Applicable | ||||||||||||||||||||||||
28 | TCGA-OR-A5JV | TCGA-OR-A5JV-01 | ACC | Not_Applicable | ||||||||||||||||||||||||
29 | TCGA-OR-A5JW | TCGA-OR-A5JW-01 | ACC | Not_Applicable | ||||||||||||||||||||||||
30 | TCGA-OR-A5JX | TCGA-OR-A5JX-01 | ACC | Not_Applicable | ||||||||||||||||||||||||
31 | TCGA-OR-A5JY | TCGA-OR-A5JY-01 | ACC | Not_Applicable | ||||||||||||||||||||||||
32 | TCGA-OR-A5JZ | TCGA-OR-A5JZ-01 | ACC | Not_Applicable | ||||||||||||||||||||||||
33 | TCGA-OR-A5K0 | TCGA-OR-A5K0-01 | ACC | Not_Applicable | ||||||||||||||||||||||||
34 | TCGA-OR-A5K1 | TCGA-OR-A5K1-01 | ACC | Not_Applicable | ||||||||||||||||||||||||
35 | TCGA-OR-A5K2 | TCGA-OR-A5K2-01 | ACC | Not_Applicable | ||||||||||||||||||||||||
36 | TCGA-OR-A5K3 | TCGA-OR-A5K3-01 | ACC | Not_Applicable | ||||||||||||||||||||||||
37 | TCGA-OR-A5K4 | TCGA-OR-A5K4-01 | ACC | Not_Applicable | ||||||||||||||||||||||||
38 | TCGA-OR-A5K5 | TCGA-OR-A5K5-01 | ACC | Not_Applicable | ||||||||||||||||||||||||
39 | TCGA-OR-A5K6 | TCGA-OR-A5K6-01 | ACC | Not_Applicable | ||||||||||||||||||||||||
40 | TCGA-OR-A5K8 | TCGA-OR-A5K8-01 | ACC | Not_Applicable | ||||||||||||||||||||||||
41 | TCGA-OR-A5K9 | TCGA-OR-A5K9-01 | ACC | Not_Applicable | ||||||||||||||||||||||||
42 | TCGA-OR-A5KO | TCGA-OR-A5KO-01 | ACC | Not_Applicable | ||||||||||||||||||||||||
43 | TCGA-OR-A5KT | TCGA-OR-A5KT-01 | ACC | Not_Applicable | ||||||||||||||||||||||||
44 | TCGA-OR-A5KU | TCGA-OR-A5KU-01 | ACC | Not_Applicable | ||||||||||||||||||||||||
45 | TCGA-OR-A5KV | TCGA-OR-A5KV-01 | ACC | Not_Applicable | ||||||||||||||||||||||||
46 | TCGA-OR-A5KW | TCGA-OR-A5KW-01 | ACC | Not_Applicable | ||||||||||||||||||||||||
47 | TCGA-OR-A5KX | TCGA-OR-A5KX-01 | ACC | Not_Applicable | ||||||||||||||||||||||||
48 | TCGA-OR-A5KY | TCGA-OR-A5KY-01 | ACC | Not_Applicable | ||||||||||||||||||||||||
49 | TCGA-OR-A5KZ | TCGA-OR-A5KZ-01 | ACC | Not_Applicable | ||||||||||||||||||||||||
50 | TCGA-OR-A5L3 | TCGA-OR-A5L3-01 | ACC | Not_Applicable | ||||||||||||||||||||||||
51 | TCGA-OR-A5L4 | TCGA-OR-A5L4-01 | ACC | Not_Applicable | ||||||||||||||||||||||||
52 | TCGA-OR-A5L5 | TCGA-OR-A5L5-01 | ACC | Not_Applicable | ||||||||||||||||||||||||
53 | TCGA-OR-A5L6 | TCGA-OR-A5L6-01 | ACC | Not_Applicable | ||||||||||||||||||||||||
54 | TCGA-OR-A5L8 | TCGA-OR-A5L8-01 | ACC | Not_Applicable | ||||||||||||||||||||||||
55 | TCGA-OR-A5L9 | TCGA-OR-A5L9-01 | ACC | Not_Applicable | ||||||||||||||||||||||||
56 | TCGA-OR-A5LA | TCGA-OR-A5LA-01 | ACC | Not_Applicable | ||||||||||||||||||||||||
57 | TCGA-OR-A5LB | TCGA-OR-A5LB-01 | ACC | Not_Applicable | ||||||||||||||||||||||||
58 | TCGA-OR-A5LC | TCGA-OR-A5LC-01 | ACC | Not_Applicable | ||||||||||||||||||||||||
59 | TCGA-OR-A5LD | TCGA-OR-A5LD-01 | ACC | Not_Applicable | ||||||||||||||||||||||||
60 | TCGA-OR-A5LE | TCGA-OR-A5LE-01 | ACC | Not_Applicable | ||||||||||||||||||||||||
61 | TCGA-OR-A5LG | TCGA-OR-A5LG-01 | ACC | Not_Applicable | ||||||||||||||||||||||||
62 | TCGA-OR-A5LH | TCGA-OR-A5LH-01 | ACC | Not_Applicable | ||||||||||||||||||||||||
63 | TCGA-OR-A5LJ | TCGA-OR-A5LJ-01 | ACC | Not_Applicable | ||||||||||||||||||||||||
64 | TCGA-OR-A5LK | TCGA-OR-A5LK-01 | ACC | Not_Applicable | ||||||||||||||||||||||||
65 | TCGA-OR-A5LL | TCGA-OR-A5LL-01 | ACC | Not_Applicable | ||||||||||||||||||||||||
66 | TCGA-OR-A5LM | TCGA-OR-A5LM-01 | ACC | Not_Applicable | ||||||||||||||||||||||||
67 | TCGA-OR-A5LN | TCGA-OR-A5LN-01 | ACC | Not_Applicable | ||||||||||||||||||||||||
68 | TCGA-OR-A5LO | TCGA-OR-A5LO-01 | ACC | Not_Applicable | ||||||||||||||||||||||||
69 | TCGA-OR-A5LP | TCGA-OR-A5LP-01 | ACC | Not_Applicable | ||||||||||||||||||||||||
70 | TCGA-OR-A5LR | TCGA-OR-A5LR-01 | ACC | Not_Applicable | ||||||||||||||||||||||||
71 | TCGA-OR-A5LS | TCGA-OR-A5LS-01 | ACC | Not_Applicable | ||||||||||||||||||||||||
72 | TCGA-OR-A5LT | TCGA-OR-A5LT-01 | ACC | Not_Applicable | ||||||||||||||||||||||||
73 | TCGA-OU-A5PI | TCGA-OU-A5PI-01 | ACC | Not_Applicable | ||||||||||||||||||||||||
74 | TCGA-PA-A5YG | TCGA-PA-A5YG-01 | ACC | Not_Applicable | ||||||||||||||||||||||||
75 | TCGA-PK-A5H9 | TCGA-PK-A5H9-01 | ACC | Not_Applicable | ||||||||||||||||||||||||
76 | TCGA-PK-A5HA | TCGA-PK-A5HA-01 | ACC | Not_Applicable | ||||||||||||||||||||||||
77 | TCGA-PK-A5HB | TCGA-PK-A5HB-01 | ACC | Not_Applicable | ||||||||||||||||||||||||
78 | TCGA-2F-A9KO | TCGA-2F-A9KO-01 | BLCA | Not_Applicable | ||||||||||||||||||||||||
79 | TCGA-2F-A9KP | TCGA-2F-A9KP-01 | BLCA | Not_Applicable | ||||||||||||||||||||||||
80 | TCGA-2F-A9KQ | TCGA-2F-A9KQ-01 | BLCA | Not_Applicable | ||||||||||||||||||||||||
81 | TCGA-2F-A9KR | TCGA-2F-A9KR-01 | BLCA | Not_Applicable | ||||||||||||||||||||||||
82 | TCGA-2F-A9KT | TCGA-2F-A9KT-01 | BLCA | Not_Applicable | ||||||||||||||||||||||||
83 | TCGA-2F-A9KW | TCGA-2F-A9KW-01 | BLCA | Not_Applicable | ||||||||||||||||||||||||
84 | TCGA-4Z-AA7M | TCGA-4Z-AA7M-01 | BLCA | Not_Applicable | ||||||||||||||||||||||||
85 | TCGA-4Z-AA7N | TCGA-4Z-AA7N-01 | BLCA | Not_Applicable | ||||||||||||||||||||||||
86 | TCGA-4Z-AA7O | TCGA-4Z-AA7O-01 | BLCA | Not_Applicable | ||||||||||||||||||||||||
87 | TCGA-4Z-AA7Q | TCGA-4Z-AA7Q-01 | BLCA | Not_Applicable | ||||||||||||||||||||||||
88 | TCGA-4Z-AA7R | TCGA-4Z-AA7R-01 | BLCA | Not_Applicable | ||||||||||||||||||||||||
89 | TCGA-4Z-AA7S | TCGA-4Z-AA7S-01 | BLCA | Not_Applicable | ||||||||||||||||||||||||
90 | TCGA-4Z-AA7W | TCGA-4Z-AA7W-01 | BLCA | Not_Applicable | ||||||||||||||||||||||||
91 | TCGA-4Z-AA7Y | TCGA-4Z-AA7Y-01 | BLCA | Not_Applicable | ||||||||||||||||||||||||
92 | TCGA-4Z-AA80 | TCGA-4Z-AA80-01 | BLCA | Not_Applicable | ||||||||||||||||||||||||
93 | TCGA-4Z-AA81 | TCGA-4Z-AA81-01 | BLCA | Not_Applicable | ||||||||||||||||||||||||
94 | TCGA-4Z-AA82 | TCGA-4Z-AA82-01 | BLCA | Not_Applicable | ||||||||||||||||||||||||
95 | TCGA-4Z-AA83 | TCGA-4Z-AA83-01 | BLCA | Not_Applicable | ||||||||||||||||||||||||
96 | TCGA-4Z-AA84 | TCGA-4Z-AA84-01 | BLCA | Not_Applicable | ||||||||||||||||||||||||
97 | TCGA-4Z-AA86 | TCGA-4Z-AA86-01 | BLCA | Not_Applicable | ||||||||||||||||||||||||
98 | TCGA-4Z-AA87 | TCGA-4Z-AA87-01 | BLCA | Not_Applicable | ||||||||||||||||||||||||
99 | TCGA-4Z-AA89 | TCGA-4Z-AA89-01 | BLCA | Not_Applicable | ||||||||||||||||||||||||
100 | TCGA-5N-A9KI | TCGA-5N-A9KI-01 | BLCA | Not_Applicable |