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1 | Schema.org Dataset | Description | Type | BioSchemas Dataset | Type | Requirement Level | Use Cases | Google Dataset | Citation Metadata | DATS.Dataset | HCLS | DataCite | omicsdi | Data repositories / Data catalogue | DATS.DataRepository | |||||||||||||||||||
2 | Overall aim: findability but not necessarily structured queries | M,R,O,NA (Mandatory, Recommended, Optional, Not Applicable). Inheriting from Schema.org "DataCatalog" | ||||||||||||||||||||||||||||||||
3 | name | A descriptive name of a dataset (e.g., “Snow depth in Northern Hemisphere”) | Text | 1. name | Text | MUST | to search on a title of dataset | name | title | title | dc:title | title | done | M | name | |||||||||||||||||||
4 | description | A short summary describing a dataset | Text | 2. description | Text | MUST | to enable discovery by indexing on free text description | description | NA | description | dc:description | description | done | M | description | |||||||||||||||||||
5 | url | Location of a page describing the dataset. | URL | 3. url | URL | MUST | enable direct access, resolution of dataset | url | dataset identifier | identifier | foaf:page | identifier | done | M | identifier | |||||||||||||||||||
6 | sameAs | Other URLs that can be used to access the dataset page. | URL | sameAs | NA | alternativeIdentifier | RelatedIdentifier | done | O | alternativeIdentifier | ||||||||||||||||||||||||
7 | version | The version number for this dataset. | Text, Number | version | Text,Number | SHOULD | version | version | version | pav:version | version | done | R | version | ||||||||||||||||||||
8 | keywords | Keywords summarizing the dataset. | Text | 4. keywords | Text | MUST | to enable discovery by indexing on free text description | keywords | NA | keywords | dcat:keyword | done | R | scopes | ||||||||||||||||||||
9 | variableMeasured (pending) | What does the dataset measure? (e.g., temperature, pressure) [sic variableMeasured in googles dataset page] | Text, PropertyValue | variableMeasured | Text | SHOULD | allow restriction to specific dimensions and variables specificly recorded in a dataset (e.g. get all climate datasets which have monitors CO2 concentration or datasets where metabolite concentration was recorded) | variableMeasured | NA | dimensions | NA | NA | done | NA | NA | |||||||||||||||||||
10 | creator | The name of the dataset creator (person or organization). | Person, Organization | creator | Text | SHOULD | allow attribution and credit | creator.name | creator | creator | dc:creator | creator | done | R - Provider/Contact? | publisher | |||||||||||||||||||
11 | includedInDataCatalog | The catalog to which this dataset belongs to. | DataCatalog | 5. includedInDataCatalog | DataCatalog | MUST | to search according to the repository of the datasets | includedInDataCatalog | data repository or archive | distribution.storedIn | publisher | NA | ||||||||||||||||||||||
12 | distribution | Description of the location for download of the dataset and the file format for download | DataDownload | distribution | distribution | dcat:distribution | R | |||||||||||||||||||||||||||
13 | distribution.fileFormat | The file format of this distribution | Text | datasets may be made available in various forms. providing information about format enables estabilishing compatibility to tools | distribution.fileFormat | distribution.formats | dc:format | R | ||||||||||||||||||||||||||
14 | distribution.contentUrl | The link for the download. | URL, | distribution.contentUrl | distribution.access (broader than just URL) | dcat:downloadURL | R | |||||||||||||||||||||||||||
15 | citation | A citation for a publication that describes the dataset (e.g., “J.Smith 'How I created an awesome dataset’, Journal of Data Science, 1966”) | CreativeWork, Text | citation | Text | SHOULD | citation | primaryPublication / citations | cito:citeAsAuthority, rdfs:seeAlso | citation/isBasedOn | R (not all databases have a citation) | |||||||||||||||||||||||
16 | license | A license under which the dataset is distributed. | URL, Text | licence | Text, URL | SHOULD | license | licenses | dc:licence | M | licenses | |||||||||||||||||||||||
17 | additionalType? | types | resourceTypeGeneral | |||||||||||||||||||||||||||||||
18 | identifier (pending) | Any kind of identifier for any kind of thing | 6. identifier | PropertyValue, Text, URL | MUST | Taxonomies (PROPOSAL) | R | |||||||||||||||||||||||||||
19 | measurementTechnique (pending) | A technique or technology used in a Dataset (or DataDownload, DataCatalog), corresponding to the method used for measuring the corresponding variable(s) (described using variableMeasured). | measurementTechnique | SHOULD | allow restriction to how a dataset has been generated , usually combined with the facet VariablesMeasured (e.g. get all climate datasets w metabolite concentration was recorded if acquired using 'measurementTechnique: mass spectrometry) | Cell Type (PROPOSAL) | ||||||||||||||||||||||||||||
20 | Diseases (PROPOSAL) | |||||||||||||||||||||||||||||||||
21 | Softwares (PROPOSAL) | |||||||||||||||||||||||||||||||||
22 | Instruments (PROPOSAL) | |||||||||||||||||||||||||||||||||
23 | Sample Protocol (PROPOSAL) | |||||||||||||||||||||||||||||||||
24 | dataType(PROPOSAL) | Data Protocol (PROPOSAL) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
25 | primaryPublication(PROPOSAL) | publications: Associated with the dataset (PROPOSAL) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
26 | acknowledges(PROPOSAL): Grant | M - BioDBcore ID (for databases) (PROPOSAL) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
27 | conformsTo (PROPOSAL), https://github.com/schemaorg/schemaorg/issues/1516 | M - identifiers:accessPattern (PROPOSAL) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
28 | M - identifiers:idPattern (PROPOSAL) | |||||||||||||||||||||||||||||||||
29 | O - identifiers: testId (PROPOSAL) | |||||||||||||||||||||||||||||||||
30 | M - Release: DataCatalog.dateModified | |||||||||||||||||||||||||||||||||
31 | R - Tools: webAPIs (PROPOSAL) | |||||||||||||||||||||||||||||||||
32 | O - Tools: SoftwareApplication | |||||||||||||||||||||||||||||||||
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