A | B | C | D | E | F | G | H | I | J | K | L | M | N | O | P | Q | R | S | T | U | V | W | X | Y | Z | AA | AB | AC | |
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1 | allow 5s to calculate......... | ||||||||||||||||||||||||||||
2 | Diagnositic & Clinical Utility Index Calculator | ||||||||||||||||||||||||||||
3 | Quickly find the Qualitative and Quantitative Accuracy & Utility of Diagnostic and Screening Tests | try our | emotionthermometer screener | ||||||||||||||||||||||||||
4 | share | bit.ly/cuisheet | |||||||||||||||||||||||||||
5 | Instructions: enter your data from diagnostic/screening test results in yellow cells and all others are automatically calculated // help? see www.clinicalutility.co.uk | ||||||||||||||||||||||||||||
6 | |||||||||||||||||||||||||||||
7 | |||||||||||||||||||||||||||||
8 | Data Entry | Data Table | Reverse LookUp | ||||||||||||||||||||||||||
9 | 0 | Very Poor | |||||||||||||||||||||||||||
10 | 0.36 | Poor | |||||||||||||||||||||||||||
11 | Enter Total # Cases: | 60 | CASES | NON-CASES | If prevalence is | 0.15 | 0.49 | Fair | |||||||||||||||||||||
12 | total by criterion standard | cases | 0.64 | Good | |||||||||||||||||||||||||
13 | # Cases Correctly Detected: | 59 | >>>> | 1 | TEST POSITIVE | 59 | 4 | 63 | >>> | PPV= 0.937 | and sensitivity is | 0.886 | 0.81 | Excellent | |||||||||||||||
14 | number of true positives | true positives | False negatives | true positives | false positives | total positives | |||||||||||||||||||||||
15 | Enter Total # Non-Cases: | 43 | TEST NEGATIVE | 1 | 39 | 40 | >>> | NPV= 0.975 | and specificity is | 0.985 | |||||||||||||||||||
16 | non-cases (aka controls) by criterion standard | non-cases | false negatives | true negatives | total negatives | 0 | Tiny | ||||||||||||||||||||||
17 | # Non-Cases Correctly Detected: | 39 | >>>> | 4 | 60 | 43 | 103 | and sample is | 276 | 1 | 13 | Very small | |||||||||||||||||
18 | number of true negatives | true negatives | False positives | total cases | total non-cases | total tested | ...............then | 2 | 87 | Small | |||||||||||||||||||
19 | Cases | 41.4 | 3 | 477 | Moderate | ||||||||||||||||||||||||
20 | ......therefore you had a tested population of | 103 | Sensitivity= 0.983 | Specificity= 0.907 | Prevalence =0.583 | TP = | 36.6804 | 4 | 2888 | Large | |||||||||||||||||||
21 | 0.971 | Non-cases | 234.6 | 5 | 19877 | Very large | |||||||||||||||||||||||
22 | TN = | 231.1 | |||||||||||||||||||||||||||
23 | Quantitative Results | Qualitative Interpretation | |||||||||||||||||||||||||||
24 | allow 5s to calculate......... | ||||||||||||||||||||||||||||
25 | Lower 95%CI | Upper 95%CI | |||||||||||||||||||||||||||
26 | |||||||||||||||||||||||||||||
27 | Sensitivity => | 98.33% | 95.09% | 100.00% | sensitivity (useful if you already know the number of cases) | The SENSITIVITY of the test is | HIGH…..meaning a positive test often occurs in those with the condition | ||||||||||||||||||||||
28 | TP / TP+TN | ||||||||||||||||||||||||||||
29 | Specificity => | 90.70% | 82.02% | 99.38% | specificity (useful if you already know the number of non-cases) | The SPECIFICITY of the test is | HIGH…..meaning a negative test often occurs in those without the condition | ||||||||||||||||||||||
30 | TN / TN+FP | ||||||||||||||||||||||||||||
31 | Positive Predictive Value = > | 93.65% | 87.63% | 99.67% | positive predictive value (useful when you know the number of positive results) | The PPV of the test is | HIGH…..meaning false positives are uncommon in those who screen positive | ||||||||||||||||||||||
32 | TP / TP+FP | ||||||||||||||||||||||||||||
33 | Negative Predictive Value = > | 97.50% | 92.66% | 100.00% | negative predictive value (useful when you know the number of negative results) | The NPV of the test is | VERY HIGH…..meaning false negatives are rare in those who screen negative, suggesting a potentially useful screening test | ||||||||||||||||||||||
34 | TN / TN+FN | ||||||||||||||||||||||||||||
35 | CUI Positive | 0.921 | 0.861 | 0.981 | case-finding value (ruling-in true positives) | CLINICAL UTILITY of the test for case-finding (confirmation) is | EXCELLENT for case-finding | ||||||||||||||||||||||
36 | SN*PPV | ||||||||||||||||||||||||||||
37 | CUI Negative | 0.884 | 0.822 | 0.947 | screening value (ruling out true negatives) | CLINICAL UTILITY of the test for screening (ruling out) is | EXCELLENT for screening (ie confirming a non-case) | ||||||||||||||||||||||
38 | SP*NNP | ||||||||||||||||||||||||||||
39 | Prevalence = > | 0.583 | n/a | n/a | The PREVALENCE of the condition is | BALANCED…..hence close to an ideal prevalence for diagnostic testing | |||||||||||||||||||||||
40 | CASES/POPULATION | ||||||||||||||||||||||||||||
41 | Likelihood Ratio +ve => | 10.571 | 4.15 | 26.90 | The total SAMPLE SIZE is | Small | |||||||||||||||||||||||
42 | Sensitivity / 1-specificity | ||||||||||||||||||||||||||||
43 | Likelihood Ratio -ve => | 0.018 | 0.00 | 0.129 | Notes and cautions | LOW total sample size, be aware of all confidence intervals | |||||||||||||||||||||||
44 | 1-specificity / sensitivity | ||||||||||||||||||||||||||||
45 | Test Score (Fraction Correct) % => | 95.15 | 91.00 | 99.30 | Value of this single test for *BOTH* screening and case-finding is | EXCELLENT (but depends on prevalence) | |||||||||||||||||||||||
46 | TP+TN/POPULATION | ||||||||||||||||||||||||||||
47 | Added NPV Value | Added PPV Value | Take home message | This test is EXCELLENT for case-finding (ie confirming a case) | |||||||||||||||||||||||||
48 | Graphical | 2.5% | 55.8% | 35.4% | 6.3% | and its best feature is its | sensitivity (useful if you already know the number of cases) | ||||||||||||||||||||||
49 | We would rate this test as | 9/10 | |||||||||||||||||||||||||||
50 | Normalized Results (per 100 people) | Live Visual (tab #2 to view) | |||||||||||||||||||||||||||
51 | |||||||||||||||||||||||||||||
52 | CASES | NON-CASES | |||||||||||||||||||||||||||
53 | |||||||||||||||||||||||||||||
54 | TEST POSITIVE | 57 | 4 | 61 | |||||||||||||||||||||||||
55 | true positives | false positives | total positives | ||||||||||||||||||||||||||
56 | TEST NEGATIVE | 1 | 38 | 39 | |||||||||||||||||||||||||
57 | false negatives | true negatives | total negatives | ||||||||||||||||||||||||||
58 | 58 | 42 | 100 | ||||||||||||||||||||||||||
59 | total cases | total non-cases | adjusted | ||||||||||||||||||||||||||
60 | |||||||||||||||||||||||||||||
61 | |||||||||||||||||||||||||||||
62 | Normalized Results (per 1000 people) | ||||||||||||||||||||||||||||
63 | |||||||||||||||||||||||||||||
64 | CASES | NON-CASES | |||||||||||||||||||||||||||
65 | |||||||||||||||||||||||||||||
66 | TEST POSITIVE | 573 | 39 | 612 | |||||||||||||||||||||||||
67 | true positives | false positives | total positives | ||||||||||||||||||||||||||
68 | TEST NEGATIVE | 10 | 378 | 388 | |||||||||||||||||||||||||
69 | false negatives | true negatives | total negatives | ||||||||||||||||||||||||||
70 | 583 | 417 | 1000 | ||||||||||||||||||||||||||
71 | total cases | total non-cases | adjusted | ||||||||||||||||||||||||||
72 | Open Graphic | ||||||||||||||||||||||||||||
73 | |||||||||||||||||||||||||||||
74 | Everday description | ||||||||||||||||||||||||||||
75 | |||||||||||||||||||||||||||||
76 | |||||||||||||||||||||||||||||
77 | In a sample of 1000, where 583 are cases, this test would correctly identify 573 of 583 true cases but it would miss 10 cases (ie false negatives). | ||||||||||||||||||||||||||||
78 | |||||||||||||||||||||||||||||
79 | Of the 417 non-cases, this test would correctly identify 378 non-cases but it would falsy identify 39 non-cases as false positives. | ||||||||||||||||||||||||||||
80 | |||||||||||||||||||||||||||||
81 | If you ran this test 1000 times, 612 tests would be positive, but of these 39 would be false positives, which is 6.3% | ||||||||||||||||||||||||||||
82 | |||||||||||||||||||||||||||||
83 | If you ran this test 1000 times, 388 tests would come back negative, but of these 10 would be false negatives, which is 2.5% | ||||||||||||||||||||||||||||
84 | |||||||||||||||||||||||||||||
85 | If you ran this test 1000 times, 951 tests would be correct, and 49 would be false (incorrect) which means the fraction correct would be 95.1% | ||||||||||||||||||||||||||||
86 | |||||||||||||||||||||||||||||
87 | but take note of the ...LOW total sample size, be aware of all confidence intervals | ||||||||||||||||||||||||||||
88 | |||||||||||||||||||||||||||||
89 | and be aware that even an excellent test may require definitive 2nd stage lab test if the implications of the condition are serious | ||||||||||||||||||||||||||||
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100 |