A | B | C | D | E | F | G | H | I | J | K | L | M | N | O | P | Q | R | S | T | U | V | W | X | Y | Z | AA | AB | AC | AD | |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 | Date | Name (student/RA) | Service Details | No. Of samples | Start date | Deadline | Status | Priority level | Any questions | P.I from our group | Outside P.I /Doctor | Contact | ||||||||||||||||||
2 | 2020/09/29 | Ching-Yu, Shih | metagenomic analysis | 1. 59 pairs (There is no sample175 in raw fastq data so it should be removed in clinical data, which I have already checked with JOB and Dr. Chen) 2. JOB said Dr. Chen has sent samples to him but I am not sure the exact number of the samples yet. | 2020/09/29 | 1. Finished 2.Yet to recieve | Dr. Tsai | 陳國興醫師 | ||||||||||||||||||||||
3 | 2020/09/30 | Ching-Yu, Shih | methylation analysis | 10 | 2020/09/30 | 1. check annotation info with JOB, and wait for reply 2. heatmap and IPA with top 1000 genes and 8 conditions | Dr. Tsai | 林芯伃醫師 | ||||||||||||||||||||||
4 | 2020/11/12 | Ching-Yu, Shih | metagenomic analysis | 59 pairs | 2020/10/15 | done | Dr. Tsai | 陳國興醫師 | ||||||||||||||||||||||
5 | 2020/11/12 | Ching-Yu, Shih | methylation analysis | 10 | 2020/11/05 | IPA, heatmap, statistical analysis, write methods | Dr. Tsai | 林芯伃醫師 | ||||||||||||||||||||||
6 | 2020/11/12 | Ching-Yu, Shih | trim adapters | 16 | 2020/10/26 | trim adapters | 1 | Dr. Tsai | 海洋所陳韋仁老師 | |||||||||||||||||||||
7 | 2020/11/12 | Ching-Yu, Shih | ATAC-seq | 4 | 2020/11/10 | QC | Dr. Lai | 生理所張哲逢老師 | ||||||||||||||||||||||
8 | 2020/11/12 | Ching-Yu, Shih | Single Cell RNA-seq | 3 | 2020/07/31 | fold change and anova in aggregation data trajectory in M4045 | Dr. Lai | 潘思宇醫師 | ||||||||||||||||||||||
9 | 2020/11/12 | Ching-Yu, Shih | R package | 2020/09/30 | add new functions | Dr. Lu | ||||||||||||||||||||||||
10 | 2020/11/12 | Ching-Yu, Shih | methylation analysis | 32 | 2020/11/04 | done | Dr. Lu | 江盈澄醫師 | ||||||||||||||||||||||
11 | 2020/11/12 | Hsin-ying, Lee | mRNA-seq analysis | 15 samples (5 groups) | 2020/10/07 | answering questions | ||||||||||||||||||||||||
12 | 2020/11/12 | Hsin-ying, Lee | RNA-seq | 4 samples (4 groups) | 2020/11/06 | pathway | ||||||||||||||||||||||||
13 | 2020/11/19 | Hsin-ying, Lee | pseudomonas bacteria WGS | 2020/11/23 | 3weeks | De-Novo, Done | ||||||||||||||||||||||||
14 | 2020/12/18 | Yuan-Mao Hung | 16S adapter trimming | 32 samples | 2020/12/18 | Done | Dr. Tsai | 海洋所陳韋壬老師 | ||||||||||||||||||||||
15 | 2021/7/2 | Yuan-Mao Hung | 16S data analysis | 2 samples | 2021/7/5 | Done | Dr. Chuang | 生醫電資所-曾宇鳳老師 | ||||||||||||||||||||||
16 | ||||||||||||||||||||||||||||||
17 | 2022/1/5 | Ching-Yu, Shih | e-Fish seq, (Identical to metagenome adapters) (R1 adapter trimming and QC only, do not need to analyze) Please offer the clean reads. | 7 | 2022/1/5 | Done | High | Dr. Tsai | 國立臺灣大學海洋研究所/陳韋仁老師 | 林秀貞, Michelle hsiuchen@ntu.edu.tw 02-33661384 | ||||||||||||||||||||
18 | 2022/1/5 | Ching-Yu, Shih | Metagenome (Human) | 52 | Moderate | Dr. Tsai | 臺大醫院腫瘤醫學部/陳國興醫師 | 陳國興醫師 019614@ntuh.gov.tw | ||||||||||||||||||||||
19 | 2022/1/25 | Ching-Yu, Shih | ddRAD(amplicon)-seq (2*300bp) , (Identical to metagenome adapters) (adapter trimming and QC only, do not need to analyze) Please offer the clean reads. | 66 | 2022/1/25 | Moderate | Dr. Tsai | 國立臺灣大學海洋研究所/陳韋仁老師 | 林秀貞, Michelle hsiuchen@ntu.edu.tw 02-33661384 | |||||||||||||||||||||
20 | ||||||||||||||||||||||||||||||
21 | ||||||||||||||||||||||||||||||
22 | ||||||||||||||||||||||||||||||
23 | ||||||||||||||||||||||||||||||
24 | ||||||||||||||||||||||||||||||
25 | ||||||||||||||||||||||||||||||
26 | ||||||||||||||||||||||||||||||
27 | ||||||||||||||||||||||||||||||
28 | ||||||||||||||||||||||||||||||
29 | ||||||||||||||||||||||||||||||
30 | ||||||||||||||||||||||||||||||
31 | ||||||||||||||||||||||||||||||
32 | ||||||||||||||||||||||||||||||
33 | ||||||||||||||||||||||||||||||
34 | ||||||||||||||||||||||||||||||
35 | ||||||||||||||||||||||||||||||
36 | ||||||||||||||||||||||||||||||
37 | ||||||||||||||||||||||||||||||
38 | ||||||||||||||||||||||||||||||
39 | ||||||||||||||||||||||||||||||
40 | ||||||||||||||||||||||||||||||
41 | ||||||||||||||||||||||||||||||
42 | ||||||||||||||||||||||||||||||
43 | ||||||||||||||||||||||||||||||
44 | ||||||||||||||||||||||||||||||
45 | ||||||||||||||||||||||||||||||
46 | ||||||||||||||||||||||||||||||
47 | ||||||||||||||||||||||||||||||
48 | ||||||||||||||||||||||||||||||
49 | ||||||||||||||||||||||||||||||
50 | ||||||||||||||||||||||||||||||
51 | ||||||||||||||||||||||||||||||
52 | ||||||||||||||||||||||||||||||
53 | ||||||||||||||||||||||||||||||
54 | ||||||||||||||||||||||||||||||
55 | ||||||||||||||||||||||||||||||
56 | ||||||||||||||||||||||||||||||
57 | ||||||||||||||||||||||||||||||
58 | ||||||||||||||||||||||||||||||
59 | ||||||||||||||||||||||||||||||
60 | ||||||||||||||||||||||||||||||
61 | ||||||||||||||||||||||||||||||
62 | ||||||||||||||||||||||||||||||
63 | ||||||||||||||||||||||||||||||
64 | ||||||||||||||||||||||||||||||
65 | ||||||||||||||||||||||||||||||
66 | ||||||||||||||||||||||||||||||
67 | ||||||||||||||||||||||||||||||
68 | ||||||||||||||||||||||||||||||
69 | ||||||||||||||||||||||||||||||
70 | ||||||||||||||||||||||||||||||
71 | ||||||||||||||||||||||||||||||
72 | ||||||||||||||||||||||||||||||
73 | ||||||||||||||||||||||||||||||
74 | ||||||||||||||||||||||||||||||
75 | ||||||||||||||||||||||||||||||
76 | ||||||||||||||||||||||||||||||
77 | ||||||||||||||||||||||||||||||
78 | ||||||||||||||||||||||||||||||
79 | ||||||||||||||||||||||||||||||
80 | ||||||||||||||||||||||||||||||
81 | ||||||||||||||||||||||||||||||
82 | ||||||||||||||||||||||||||||||
83 | ||||||||||||||||||||||||||||||
84 | ||||||||||||||||||||||||||||||
85 | ||||||||||||||||||||||||||||||
86 | ||||||||||||||||||||||||||||||
87 | ||||||||||||||||||||||||||||||
88 | ||||||||||||||||||||||||||||||
89 | ||||||||||||||||||||||||||||||
90 | ||||||||||||||||||||||||||||||
91 | ||||||||||||||||||||||||||||||
92 | ||||||||||||||||||||||||||||||
93 | ||||||||||||||||||||||||||||||
94 | ||||||||||||||||||||||||||||||
95 | ||||||||||||||||||||||||||||||
96 | ||||||||||||||||||||||||||||||
97 | ||||||||||||||||||||||||||||||
98 | ||||||||||||||||||||||||||||||
99 | ||||||||||||||||||||||||||||||
100 |