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1 | This workshop will consists of an intro talk, then 3 brief tool demos. We will show examples from data.glygen.org and data.oncomx.org, briefly discuss how they are used, and then show the BCO Portal tool that can be used for making them. We will then do the same for the AWS HIVE instance and the AWS Galaxy instance. | Breakout Topic | Hosts | |||||||||||||||||||||||
2 | 1) General questions | Raja/Jonathon | ||||||||||||||||||||||||
3 | After that we will then hold a few breakout sessions for live discussion. | 2) Technical/computational | Hadley | |||||||||||||||||||||||
4 | 3) Knowledgebase | Janisha/Rahi | ||||||||||||||||||||||||
5 | Name | Affiliation | On Slack (yes/no) | Breakout session (See descriptions above, PLEASE SELECT ONE) | ||||||||||||||||||||||
6 | Anna Tran | Institute of Human Genetics Montpellier | anna.tran@igh.cnrs.fr | Yes | 3 | |||||||||||||||||||||
7 | Abhinav Mishra | Freie Universitat | mishraabhinav36@gmail.com | Yes | ||||||||||||||||||||||
8 | Umasri Sankarlal | Consultant | umasrisankarlal@gmail.com | yes | ||||||||||||||||||||||
9 | Stephanie Holmgren | Natl Inst Environmental Health Sciences | holmgren@niehs.nih.gov | yes | ||||||||||||||||||||||
10 | Ebtisam Alharbi | University of Manchester | ebtisam.alharbi@manchester.ac.uk | Yes | ||||||||||||||||||||||
11 | Bonnie McCaig | BASF | bonnie.mccaig@basf.com | yes | ||||||||||||||||||||||
12 | Chahrazed Debbagh | Institue of Human Genetics- U.Montpellier | chahrazed.debbagh@igh.cnrs.fr | yes | ||||||||||||||||||||||
13 | Andrew espira | ICIPE | aespira@icipe.org | yes | ||||||||||||||||||||||
14 | Birgit Meldal | EMBL-EBI Complex Portal | bmeldal@ebi.ac.uk | yes | ||||||||||||||||||||||
15 | Geof Hannigan | Merck ESC | geoffrey.hannigan@merck.com | yes | ||||||||||||||||||||||
16 | Petros Kountouris | The Cyprus Institute of Neurology and Genetics | petrosk@cing.ac.cy | no | ||||||||||||||||||||||
17 | Rabia Khan | Consultant [Real World Data, Ontologies, Dictionaries] | rabia.t.khan@gmail.com | Yes | 1 , 2 and 3 | |||||||||||||||||||||
18 | Andra Waagmeester | Gene wiki | andra@micelio.be | yes | ||||||||||||||||||||||
19 | Nishad Thalhath | University of Tsukuba | nishad@thalhath.org | yes | ||||||||||||||||||||||
20 | Magnus Sälgö | Wikidata volunteer | salgo60@msn.com | no | ||||||||||||||||||||||
21 | Tiago Lubiana | University of São Paulo | tiago.lubiana.alves@usp.br | no | ||||||||||||||||||||||
22 | Coralea Stephanou | The Cyprus Institute of Neurology and Genetics | coraleas@cing.ac.cy | no | ||||||||||||||||||||||
23 | Dorothy S. Reilly | Novartis | dorothy.reilly@novartis.com | yes | ||||||||||||||||||||||
24 | Alexis Norris | FDA | alexis.norris@fda.hhs.gov | yes | 1, 2, and 3 | |||||||||||||||||||||
25 | Jakob Goldmann | Merck Sharp & Dohme Manufactoring Division | jakob.goldmann@merck.com | no | ||||||||||||||||||||||
26 | Mike Livstone | Regeneron | mike.livstone@gmail.com | yes | ||||||||||||||||||||||
27 | Shivani Sharma | Indian Institute of Science | ishivani@outlook.in | yes | 1,2,3 | |||||||||||||||||||||
28 | Gabriel Backianathan | Novartis | gabriel.backiananthan@novartis.com | yes | ||||||||||||||||||||||
29 | Annat Haber | Jackson Lab | annat.haber@jax.org | yes | ||||||||||||||||||||||
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