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2 | Sample_information | Sequencing_information | Bioinformatics | Extra information | |||||||||||||||||||||||||||||
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4 | name | genus | species | subspecies | type | population | tissue | sampled_age | pop_collect_date | collector | locality | plant_grower_tissue_collector | latitude | library_type | library_prep | library_who | library_number | restriction_enzyme | read_tech | sequence_format | quality_format | date_sequenced | sequencing_facility | read_length | barcodes | barcode_type_position | mate_pair_library | current_known_location | who_received_sequences | notes | known_alias | sample_numbering | |
5 | HA412 | helianthus | annuus | elite | cDNA | 454 | fna | qual | cluster:/Linux/Loren/Seq/EST | 1 | |||||||||||||||||||||||
6 | HA369 | helianthus | annuus | elite | cDNA | illumina | fq | fastq | 2 x 100 | cluster:/Linux/Loren/Seq/EST | 2 | ||||||||||||||||||||||
7 | HA384 | helianthus | annuus | elite | cDNA | illumina | fq | fastq | 2 x 100 | cluster:/Linux/Loren/Seq/EST | 3 | ||||||||||||||||||||||
8 | HA412-flowers | helianthus | annuus | elite | cDNA | illumina | fq | fastq | 2 x 100 | cluster:/Linux/Loren/Seq/EST | 4 | ||||||||||||||||||||||
9 | HA412-roots_stems | helianthus | annuus | elite | cDNA | illumina | fq | fastq | 2 x 100 | cluster:/Linux/Loren/Seq/EST | 5 | ||||||||||||||||||||||
10 | HA89-5 | helianthus | annuus | elite | cDNA | illumina | fq | fastq | 2 x 100 | cluster:/Linux/Loren/Seq/EST | 6 | ||||||||||||||||||||||
11 | HA89-9 | helianthus | annuus | elite | cDNA | illumina | fq | fastq | 2 x 100 | cluster:/Linux/Loren/Seq/EST | 7 | ||||||||||||||||||||||
12 | KOSI | helianthus | annuus | elite | cDNA | illumina | fq | fastq | 2 x 100 | cluster:/Linux/Loren/Seq/EST | 8 | ||||||||||||||||||||||
13 | MAI | helianthus | annuus | elite | cDNA | illumina | fq | fastq | 2 x 100 | cluster:/Linux/Loren/Seq/EST | 9 | ||||||||||||||||||||||
14 | RHA274 | helianthus | annuus | elite | cDNA | illumina | fq | fastq | 2 x 100 | cluster:/Linux/Loren/Seq/EST | 10 | ||||||||||||||||||||||
15 | Sunrise | helianthus | annuus | elite | cDNA | illumina | fq | fastq | 2 x 100 | cluster:/Linux/Loren/Seq/EST | 11 | ||||||||||||||||||||||
16 | VNIIMK8931 | helianthus | annuus | elite | cDNA | illumina | fq | fastq | 2 x 100 | cluster:/Linux/Loren/Seq/EST | 12 | ||||||||||||||||||||||
17 | ha89 | helianthus | annuus | elite | cDNA | sanger | fasta | NA | cluster:/Linux/Loren/Seq/EST | 13 | |||||||||||||||||||||||
18 | psc8 | helianthus | annuus | elite | cDNA | sanger | fasta | NA | cluster:/Linux/Loren/Seq/EST | 14 | |||||||||||||||||||||||
19 | rha280 | helianthus | annuus | elite | cDNA | sanger | fasta | NA | cluster:/Linux/Loren/Seq/EST | 15 | |||||||||||||||||||||||
20 | rha801 | helianthus | annuus | elite | cDNA | sanger | fasta | NA | cluster:/Linux/Loren/Seq/EST | 16 | |||||||||||||||||||||||
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38 | illumina | fq | fastq (Phred+33) | spring 2011 | Genome quebec | 100 X 2 | |||||||||||||||||||||||||||
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