A | B | C | D | E | F | G | H | I | J | K | L | M | N | O | P | Q | R | S | T | U | V | W | X | Y | Z | AA | AB | AC | AD | AE | AF | AG | AH | AI | |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
2 | Data do expto: | 2023.00.00 | 2. Conferindo Soluções | 5. Ensaios para medição de GSSG e tGSH | |||||||||||||||||||||||||||||||
3 | 2.1 NADPH | 5.1 GSSG | |||||||||||||||||||||||||||||||||
4 | 1. Soluções | 1. Em uma cubeta de quartzo, adicionar água milliQ e "zerar" o espectrofotometro em 340 nm. | Para medir especificamente a concentração de glutationa em sua forma dissulfeto (GSSG) as amostras devem ser incubadas com 2-VP para bloquear os grupos tiol (-SH) das moléculas de glutationa na forma reduzida (GSH). | ||||||||||||||||||||||||||||||||
5 | Com exceção da água, que deve permanecer em temperatura ambiente, todas as demais soluções devem ser mantidas em gelo ao longo do experimento. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
6 | 2. Diluir, direto na cubeta, um pequeno volume de solução estoque de NADPH (e.g., 10 µL ). | A reação entre 2-VP e grupos -SH leva 1 h para acontecer em temperatura ambiente. | |||||||||||||||||||||||||||||||||
7 | 3. Homogeneizar o conteúdo da cubeta com ajuda de um parafilm. | Está incubação ocorre diretamente na placa do ensaio e deve ser realizada em cabine exaustora com uso de EPI. | |||||||||||||||||||||||||||||||||
8 | 4. Ler em 340 nm. | 5.1.1 GSSG - Ensaio | |||||||||||||||||||||||||||||||||
9 | 1.1 Soluções preparadas com antencedência | 5. Repetir mais duas vezes (3 x no total). | 1. Trabalhando em capela exaustora, adicionar em uma placa de 96 poços os reagentes conforme concentrações e volumes descritos na tabela abaixo até o asterisco (*), que marca um ponto de parada para incubação. Curva-padrão e amostras são adicionadas e lidas simultaneamente na placa. | ||||||||||||||||||||||||||||||||
10 | 1.1.1 10% (p/v) Ácido tricloroacético (TCA) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
11 | Diluir solução estoque de 100% TCA em água milliQ usando os volumes abaixo. | 2.1.1 Cálculo | Curva-Padrão | ||||||||||||||||||||||||||||||||
12 | Vol. final cubeta (µL) | 800 | 2. Fazer adição dos reagentes em triplicata para cada ponto da curva ou amostra. | Inclinação | 80.454 | ||||||||||||||||||||||||||||||
13 | Vol. sol. NADPH (µL) | 10 | 3. Deixar placa tampada no interior da cabine exaustora por 1 h. | Intercepção | 7.433 | ||||||||||||||||||||||||||||||
14 | Vol. desejado (mL) | 50 | 4. Adicionar demais reagentes descritos na tabela após o (*) e tampar a placa. | R^2 | 0.9993 | ||||||||||||||||||||||||||||||
15 | Vol. 100% TCA (mL) | 5 | Leitura | A340 | NADPH estoque (mM) | 5. Levar placa tampada até o leitor de placas e realizar leitura no modo cinética (tempo total = 90 s; intervalo = 15 segundos) em 412 nm. Se o número de amostras for grande, aumentar o intervalo, contanto que sejam feitas pelo menos 5 leituras dentro do período total. | |||||||||||||||||||||||||||||
16 | Vol. água milliQ (mL) | 45 | Leitura 1 | 0.622 | |||||||||||||||||||||||||||||||
17 | Leitura 2 | 0.622 | 8.00 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
18 | 1.1.2 KPE - tampão 500 mM KPi + 5 mM EDTA (pH 7.0) | Leitura 3 | 0.622 | 6. Registrar na planilha os valores da velocidade de variação da absorbância em 412 nm ao longo do tempo ("Vmax" ou "rate") na planilha. | |||||||||||||||||||||||||||||||
19 | Verificar em outro protocolo como preparar o tampão fosfato + EDTA e corrigir o pH. | 0.622 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
20 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
21 | 2.2 Glutationa Redutase de levedura (GR) | 5.1.1.1 Curva-padrão | |||||||||||||||||||||||||||||||||
22 | 1.1.3 Tampão PBS 1x | Diluir um pequeno volume (e.g., 2 µL) da solução estoque de GR de levedura em PBS 1x. | Posição | ID | KPE | Solução Padrão GSSG | 10% TCA | 500 mM | * | 500mM KPi | Água | DTNB + GR | 5 mM NADPH | GSSG (μM) | (A412nm/min)*1000 | ||||||||||||||||||||
23 | Verificar em outro protocolo como preparar PBS 1x. | O volume final vai depender da atividade/concentração de GR que foi aferida pela última vez ou a concentração no frasco original caso esteja lacrado. | 2-VP | Na placa | i | ii | iii | Média | |||||||||||||||||||||||||||
24 | A1–A3 | Blank | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 200 | 0 | 0 | Blank | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | ||||||||||||||||||||
25 | 1.2 Soluções para preparar no dia | Última medida de atividade da GR estoque: | B1–B3 | Zero | 45 | 0 | 15 | 3 | 30 | 57 | 40 | 10 | 0.000 | 7.221 | 7.507 | 7.364 | 7.364 | ||||||||||||||||||
26 | 1.2.1 4 mM DTNB (396.3 g/mol) em 100 mM KPi pH 7.0 | Vol. (µL) | C1–C3 | 0.2 µM | 45 | 10 | 5 | 3 | 30 | 57 | 40 | 10 | 0.010 | 8.093 | 7.936 | 8.036 | 8.022 | ||||||||||||||||||
27 | Diluir alíquota em tampão usando os volumes/proporções abaixo. | Data | Atividade (U/mL) | GR estoque | 2 | D1–D3 | 0.4 µM | 45 | 10 | 5 | 3 | 30 | 57 | 40 | 10 | 0.020 | 9.536 | 8.964 | 9.250 | 9.250 | |||||||||||||||
28 | Adicionar primeiro o tampão, depois a água. | 6-Oct | 436.44 | PBS 1x | 783.6 | E1–E3 | 0.8 µM | 45 | 10 | 5 | 3 | 30 | 57 | 40 | 10 | 0.040 | 11.307 | 10.564 | 10.279 | 10.717 | |||||||||||||||
29 | Agitar em vortex até solubilizar todo o reagente. | Vol. Final | 785.6 | F1–F3 | 1.6 µM | 45 | 10 | 5 | 3 | 30 | 57 | 40 | 10 | 0.080 | 13.593 | 13.664 | 13.621 | 13.626 | |||||||||||||||||
30 | G1–G3 | 3.2 µM | 45 | 10 | 5 | 3 | 30 | 57 | 40 | 10 | 0.160 | 21.193 | 20.964 | 20.007 | 20.721 | ||||||||||||||||||||
31 | Peso (mg) | Vol. (µL) | 2.2.1 Ensaio | H1–H3 | 6.4 µM | 45 | 10 | 5 | 3 | 30 | 57 | 40 | 10 | 0.320 | 32.364 | 34.350 | 32.336 | 33.017 | |||||||||||||||||
32 | 15.852 | ----- | 10000 | 1. Em uma cubeta de quartzo, adicionar água e "zerar" espectrofotometro em 340 nm. | |||||||||||||||||||||||||||||||
33 | 21.90 | ----- | 13815.3 | 2. Em seguida, adicionar os reagentes nas concentrações e volumes abaixo. | 5.1.1.2 Amostras | ||||||||||||||||||||||||||||||
34 | KPE | 2763.1 | Posição | ID | KPE | Amostra | 10% TCA | 500 mM | * | 500mM KPi | Água | DTNB + GR | 5 mM NADPH | (A412nm/min)*1000 | GSSG (μM) | GSSG (μM) | Diluição | ID | GSSG (μM) | ||||||||||||||||
35 | Água | 11052.2 | KPE | Água | 20 mM GSSG | ~1 U/mL GR | 8 mM NADPH | 2-VP | i | ii | iii | Média | Na placa | No sobrenadante | Homogeneização | Na amostra | |||||||||||||||||||
36 | 80 | 665.0 | 40 | 5 | 10.0 | A4–A6 | Smp_1 | 45 | 15 | 0 | 3 | 30 | 57 | 40 | 10 | 10.000 | 10.000 | 10.000 | 10.000 | 0.032 | 0.425 | 1.11 | Smp_1 | 0.47 | |||||||||||
37 | 1.2.2 20 mM GSSG (612.63 g/mol) em água | B4–B6 | Smp_2 | 45 | 15 | 0 | 3 | 30 | 57 | 40 | 10 | 11.000 | 11.000 | 11.000 | 11.000 | 0.044 | 0.591 | 1.11 | Smp_2 | 0.66 | |||||||||||||||
38 | Diluir alíquota em água usando os volumes/proporções abaixo. | 3. Com um parafilm, homogeneizar conteúdo da cubeta e realizar leitura. | C4–C6 | Smp_3 | 45 | 15 | 0 | 3 | 30 | 57 | 40 | 10 | 12.000 | 12.000 | 12.000 | 12.000 | 0.057 | 0.757 | 1.11 | Smp_3 | 0.84 | ||||||||||||||
39 | Esta solução servirá apenas para verificar a atividade da solução estoque de GR. | 4. Leitura cinética em 340 nm, tempo total 90 s, intervalo ≤10 s. | D4–D6 | Smp_4 | 45 | 15 | 0 | 3 | 30 | 57 | 40 | 10 | 13.000 | 13.000 | 13.000 | 13.000 | 0.069 | 0.923 | 1.11 | Smp_4 | 1.03 | ||||||||||||||
40 | 5. Repetir mais duas vezes (3 x no total). | E4–E6 | Smp_5 | 45 | 15 | 0 | 3 | 30 | 57 | 40 | 10 | 14.000 | 14.000 | 14.000 | 14.000 | 0.082 | 1.088 | 1.11 | Smp_5 | 1.21 | |||||||||||||||
41 | Esta solução pode ser armazenada em geladeira e reutilizada por 1-2 meses. | F4–F6 | Smp_6 | 45 | 15 | 0 | 3 | 30 | 57 | 40 | 10 | 15.000 | 15.000 | 15.000 | 15.000 | 0.094 | 1.254 | 1.11 | Smp_6 | 1.39 | |||||||||||||||
42 | 2.2.2 Cálculo | G4–G6 | Smp_7 | 45 | 15 | 0 | 3 | 30 | 57 | 40 | 10 | 16.000 | 16.000 | 16.000 | 16.000 | 0.106 | 1.420 | 1.11 | Smp_7 | 1.58 | |||||||||||||||
43 | Peso (mg) | Vol. (µL) | H4–H6 | Smp_8 | 45 | 15 | 0 | 3 | 30 | 57 | 40 | 10 | 33.000 | 33.000 | 33.000 | 33.000 | 0.318 | 4.237 | 1.11 | Smp_8 | 4.71 | ||||||||||||||
44 | 12.2526 | ----- | 1000 | Leitura | A340/min | ||||||||||||||||||||||||||||||
45 | 5.00 | ----- | 408.1 | Leitura 1 | 0.0622 | 5.2 tGSH | |||||||||||||||||||||||||||||
46 | Leitura 2 | 0.0622 | Para medir a concentração de glutationa total, usamos glutationa na forma reduzida (GSH) para construir a curva. | ||||||||||||||||||||||||||||||||
47 | 1.2.3 20 mM GSSG (612.63 g/mol) em 10% TCA | Leitura 3 | 0.0622 | 5.2.1 tGSH - Ensaio | |||||||||||||||||||||||||||||||
48 | Diluir alíquota em 10% TCA usando os volumes/proporções abaixo. | Média | 0.0622 | 1. Na bancada, adicionar em uma placa de 96 poços os reagentes conforme concentrações e volumes descritos na tabela abaixo. Curva-padrão e amostras são adicionadas e lidas simultaneamente na placa. | |||||||||||||||||||||||||||||||
49 | Esta solução é o estoque para produzir a curva-padrão de GSSG. | GR na cubeta | 0.01 U/mL | ||||||||||||||||||||||||||||||||
50 | Esta solução pode ser armazenada em geladeira e usada por 30 dias. | 2. Fazer adição dos reagentes em triplicata para cada ponto da curva ou amostra. | Curva-Padrão | ||||||||||||||||||||||||||||||||
51 | Atividade de GR (U/mL), frasco estoque*: | 628.5 | 3. Levar placa tampada até o leitor de placas e realizar leitura no modo cinética (tempo total = 90 s; intervalo = 15 segundos) em 412 nm. Se o número de amostras for grande, aumentar o intervalo, contanto que sejam feitas pelo menos 5 leituras dentro do período total. | Inclinação | 36.118 | ||||||||||||||||||||||||||||||
52 | Peso (mg) | Vol. (µL) | *Ensaio realizado em: 06-Oct-2023 | Intercepção | 1.989 | ||||||||||||||||||||||||||||||
53 | 12.2526 | ----- | 1000 | 4. Registrar na planilha os valores da velocidade de variação da absorbância em 412 nm ao longo do tempo ("Vmax" ou "rate") na planilha. | R^2 | 0.9999 | |||||||||||||||||||||||||||||
54 | 5.00 | ----- | 408.1 | 3. Preparando solução de uso de GR + DTNB | |||||||||||||||||||||||||||||||
55 | 3.1 Calculando volume necessário para realizar o ensaio | 5.2.1.1 Curva-padrão | |||||||||||||||||||||||||||||||||
56 | 1.2.3.1 GSSG - Soluções-Padrão | Posição | ID | KPE | Água | Solução Padrão GSH | 10% TCA | DTNB + GR | 5 mM NADPH | GSH (μM) | (A412nm/min)*1000 | ||||||||||||||||||||||||
57 | Diluir solução estoque (20 mM) em 10% TCA usando os volumes/proporções abaixo. | N | Vol./poço | Na placa | i | ii | iii | Média | |||||||||||||||||||||||||||
58 | Pontos Curva tGSH | 6 | 15 | A1–A3 | Blank | 0 | 200 | 0 | 0 | 0 | 0 | Blank | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | |||||||||||||||||||
59 | Agitar tubos em vortex entre diluições. | Pontos Curva GSSG | 7 | 40 | B1–B3 | Zero | 50 | 115 | 0 | 10 | 15 | 10 | 0.00 | 1.852 | 2.095 | 1.952 | 1.966 | ||||||||||||||||||
60 | Amostras GSH | 5 | 15 | C1–C3 | 5 µM | 50 | 115 | 10 | 0 | 15 | 10 | 0.25 | 11.167 | 10.938 | 11.252 | 11.119 | |||||||||||||||||||
61 | 5 µL 20 mM GSSG (10%TCA) | 80 µM | Amostras GSSG | 5 | 40 | D1–D3 | 10 µM | 50 | 115 | 10 | 0 | 15 | 10 | 0.50 | 20.395 | 20.381 | 20.538 | 20.438 | |||||||||||||||||
62 | + 1245 µL 10%TCA | E1–E3 | 20 µM | 50 | 115 | 10 | 0 | 15 | 10 | 1.00 | 37.910 | 38.224 | 38.281 | 38.138 | |||||||||||||||||||||
63 | Volume de reagente necessário (µL) | 1935 | F1–F3 | 40 µM | 50 | 115 | 10 | 0 | 15 | 10 | 2.00 | 74.624 | 73.310 | 72.124 | 73.353 | ||||||||||||||||||||
64 | 80 µL 80 µM GSSG (10% TCA) | 6.4 µM | Volume a ser feito (µL) | 2226 | G1–G3 | 80 µM | 50 | 115 | 10 | 0 | 15 | 10 | 4.00 | 149.710 | 144.281 | 146.510 | 146.834 | ||||||||||||||||||
65 | + 920 µL 10%TCA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
66 | 3.2 Preparando a solução | 5.2.1.2 Amostras | |||||||||||||||||||||||||||||||||
67 | Fazer diluições seriadas de 6.4 µM, 3.2 µM, 1.6 µM, 0.8 µM, 0.40 µM e 0.20 µM usando 10% TCA como solvente: 200 µL + 200 µL (10% TCA). | A solução deve ser preparada adicionando 1 (um) volume de 21 U/mL GR a 2 (dois) volumes de 4 mM DTNB. | Posição | ID | KPE | Água | Amostra | 10% TCA | DTNB + GR | 5 mM NADPH | (A412nm/min)*1000 | tGSH (μM) | tGSH (μM) | Diluição | ID | tGSH (μM) | GSH (μM) | GSSG/tGSH | |||||||||||||||||
68 | i | ii | iii | Média | Na placa | No sobrenadante | Homogeneização | Na amostra | Na amostra | Na amostra | |||||||||||||||||||||||||
69 | A concentração dos reagentes na solução deve ser de 7.00 U/mL GR e 2.67 mM DTNB. | A4–A6 | Smp_1 | 50 | 115 | 5 | 5 | 15 | 10 | 11.000 | 11.000 | 11.000 | 11.000 | 0.249 | 9.979 | 1.11 | Smp_1 | 11.09 | 10.62 | 4.26% | |||||||||||||||
70 | Em um único tubo, adicionar KPE, água milliQ e solução de GR estoque, totalizando o volume final necessário calculado no passo 3.1, conforme tabela abaixo | B4–B6 | Smp_2 | 50 | 115 | 5 | 5 | 15 | 10 | 20.000 | 20.000 | 20.000 | 20.000 | 0.499 | 19.947 | 1.11 | Smp_2 | 22.16 | 21.51 | 2.96% | |||||||||||||||
71 | 1.2.4 20 mM GSH (307.32 g/mol) em 10% TCA | C4–C6 | Smp_3 | 50 | 115 | 5 | 5 | 15 | 10 | 40.000 | 40.000 | 40.000 | 40.000 | 1.052 | 42.097 | 1.11 | Smp_3 | 46.77 | 45.93 | 1.80% | |||||||||||||||
72 | Diluir alíquota em 10% TCA usando os volumes/proporções abaixo. | D4–D6 | Smp_4 | 50 | 115 | 5 | 5 | 15 | 10 | 30.000 | 30.000 | 30.000 | 30.000 | 0.776 | 31.022 | 1.11 | Smp_4 | 34.47 | 33.44 | 2.97% | |||||||||||||||
73 | Esta solução é o estoque para produzir a curva-padrão de tGSH. | KPE | Água | GR Stock | Vol. final | E4–E6 | Smp_5 | 50 | 115 | 5 | 5 | 15 | 10 | 50.000 | 50.000 | 50.000 | 50.000 | 1.329 | 53.171 | 1.11 | Smp_5 | 59.08 | 57.87 | 2.05% | |||||||||||
74 | Esta solução pode ser armazenada em geladeira e usada por 15 dias. | 74.2 | 643.0 | 24.8 | 742.00 | F4–F6 | Smp_6 | 50 | 115 | 5 | 5 | 15 | 10 | 75.000 | 75.000 | 75.000 | 75.000 | 2.021 | 80.859 | 1.11 | Smp_6 | 89.84 | 88.45 | 1.55% | |||||||||||
75 | G4–G6 | Smp_7 | 50 | 115 | 5 | 5 | 15 | 10 | 110.000 | 110.000 | 110.000 | 110.000 | 2.991 | 119.621 | 1.11 | Smp_7 | 132.91 | 131.33 | 1.19% | ||||||||||||||||
76 | Peso (mg) | Vol. (µL) | Em seguida, no mesmo tubo, adicionar a solução de DTNB usando o volume mostrado abaixo. | H4–H6 | Smp_8 | 50 | 115 | 5 | 5 | 15 | 10 | 150.000 | 150.000 | 150.000 | 150.000 | 4.098 | 163.920 | 1.11 | Smp_8 | 182.13 | 177.43 | 2.58% | |||||||||||||
77 | 6.1464 | ----- | 1000 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
78 | 5.00 | ----- | 813.5 | 4 mM DTNB | 1484.00 | ||||||||||||||||||||||||||||||
79 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
80 | 1.2.4.1 GSH - Soluções-Padrão | 4. Preparo das Amostras | |||||||||||||||||||||||||||||||||
81 | Diluir solução estoque (20 mM) em 10% TCA usando os volumes/proporções abaixo. | Cada tipo de amostra pode ter requisitos de preparo diferentes, verifique o caso mais adequado para a sua amostra. | |||||||||||||||||||||||||||||||||
82 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
83 | Agitar tubos em vortex entre diluições. | Geralmente, as amostras são homogeneizadas com TCA de maneira a se obter uma concentração final de TCA de 10% no homogeneizado. | |||||||||||||||||||||||||||||||||
84 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
85 | 5 µL 20 mM GSH (10% TCA) | 80 µM | Após homogeneização, as amostras são incubadas em gelo por 10 min. | ||||||||||||||||||||||||||||||||
86 | + 1245 µL 10% TCA | Após incubação, são centrifugados a 10.000 x g por 10 min a 4°C. | |||||||||||||||||||||||||||||||||
87 | O sobrenadante*, contendo GSH e GSSG, é transferido para um novo tubo. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
88 | Fazer diluições seriadas de 80 µM, 40 µM, 20 µM, 10 µM e 5 µM usando 10% TCA como solvente: 100 µL + 100 µL (10% TCA). | Os tubos contendo os sobrenadantes são mantidos em gelo durante todo o experimento. | |||||||||||||||||||||||||||||||||
89 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
90 | *Os pellets provenientes do preparo de amostra com TCA descito acima pode sem usados para medir outras variáveis de interesse, tais como os níveis de proteínas totais, proteínas carboniladas, ou alguma outra proteína para a qual haja anticorpo (WB). Para que essas análises sejam viáveis, é necessário registrar o volume de amostra que deu origem a cada pellet. No caso da medição de proteínas carboniladas, é necessário separar dois pellets, de volume conhecido, para cada amostra. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
91 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
92 | 1.2.5 8 mM NADPH (833.35 g/mol) em PBS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
93 | Caso não haja solução pronta no -20°C ou -80°C, diluir alíquota em PBS usando os volumes/proporções abaixo. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
94 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
95 | O peso molecular do NADPH depende da forma do sal específico que se tem disponível. Verifique se o peso é o mesmo da planilha. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
96 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
97 | Uma vez descongelada a alíquota pode ser congelada novamente para uso posterior. Basta verificar a concentração novamente antes do uso. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
98 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
99 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
100 | Peso (mg) | Vol. (µL) |