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1 | Supplemental Table 3: Information about strains used in phylogenetic and morphologic studies. Species column lists all known names applied to the strain IDs and/or alternative strain IDs either in published literature and/or in NCBI Genbank. Clade column lists Entomophthora muscae clades as shown in Figure 6. Nuclei No., primary conidia length, and primary conidia width columns summarize data from previous publications listed in References column. For those three columns, all ranges represent minimum and maximum, and those separated with +- are mean and standard deviation. (---) denotes no data are available. Species IDs are based on ARSEF catalog desinations, NCBI GenBank accession IDs, and/or published literature. In instances where species-level identifications are unresolved or conflicting, all designations are listed. | |||||||||||||||||||||||||
2 | Species | Strain ID | Alt. strain IDs | Year | Location | Host species | Host family | ITS | 28S (LSU) | Clade | Nuclei No. | Primary conidia length (μm) | Primary conidia width (μm) | References | ||||||||||||
3 | E. muscae | KVL14-117 | --- | --- | --- | Musca domestica | Muscidae | KX639407 | OR502659 | I | 13.8 +- 0.25 | 27.8 +- 0.45 | 22.5 +- 0.30 | de Fine Licht et al. 2017 | ||||||||||||
4 | E. muscae | ARSEF 6132 | Mdom; KVL 99-13 | 1998 | Denmark: Kirke S˚aby, Zealand | Musca domestica | Muscidae | DQ481217 | DQ481224 | I | 16 - 18 | --- | --- | Jensen et al. 2006 | ||||||||||||
5 | E. muscae | ARSEF 6716 | KVL 99-95 | 1999 | Denmark: Sverkilde, Zealand | Musca domestica | Muscidae | --- | EF392408 | I | 18.4 +- 0.20 (16.1 - 20.7) | 29.0 +- 0.22 (25.2 - 31.5) | 23.1 +- 0.17 (21.1 - 25.2) | Jensen et al. 2001 | ||||||||||||
6 | E. muscae | ARSEF 13514 | EMB; ivFendel | 2015 | USA: Berkeley, Alameda County, California | Drosophila hydei | Drosophilidae | OR502655 | OR502660 | I | 13.9 +- 14.9 (8 - 22) | 23.5 +- 26.1 (19.2 - 31.8) | 18.4-20.5 (14.6 - 26.7) | Elya et al. 2018 | ||||||||||||
7 | E. muscae | ARSEF 6815 | KVL 99-102 | 1999 | Denmark: Sengeløse, Zealand | Delia radicum | Anthomyiidae | DQ481218 | DQ481225 | II | 14 - 16 | --- | --- | Jensen et al. 2006 | ||||||||||||
8 | E. muscae | ARSEF 3074 | AFTOL-28 | 1990 | USA: Prattsburg, New York | Delia antiqua | Anthomyiidae | AY997047 | DQ273772 | II | --- | --- | --- | James et al. 2006 | ||||||||||||
9 | E. ferdinandii | ARSEF 6918 | KVL 99-92 | 1999 | Denmark: Ørslev, Zealand | Coenosia tigrina | Muscidae | OR502656 | OR502661 | II | 14.6 +- 0.79 (14.5 - 14.9) | 25.0 +- 0.87 (24.3 - 25.7) | 20.2 +- 0.66 (19.3 - 21.1) | Jensen et al. 2001 | ||||||||||||
10 | E. scatophagae | ARSEF 6704 | KVL 00-60 | 2000 | Denmark: Tuse Næs, Zealand | Scatophaga stercoraria | Scathophagidae | DQ481219 | DQ481226 | II | 16 - 18 | --- | --- | Jensen et al. 2006 | ||||||||||||
11 | E. grandis, E. muscae, E. sp. | ARSEF 6701 | KVL 00-92 | 2000 | Denmark: Hundested, Zealand | Myospila meditabunda | Muscidae | DQ481222 | DQ481229 | N/A | 20 - 23 | --- | --- | Jensen et al. 2006, Jensen et al. 2009 | ||||||||||||
12 | E. sp. | SoCal cadaver 1 | SoCal cadaver 2017 | 2017 | USA: San Jacinto Mountains, California | Drosophila pseudoobscura | Drosophilidae | OR502657 | OR502662 | N/A | --- | --- | --- | --- | ||||||||||||
13 | E. syrphi | ARSEF 5955 (deposited in NCBI Genbank incorrectly as 5595) | KVL 98-19 | 1998 | Denmark: Zealand | Triglyphus primus | Syrphidae | DQ481223 | DQ481230 | N/A | 17 - 21 | --- | --- | Jensen et al. 2006 | ||||||||||||
14 | E. schizophorae | ARSEF 6137 | KVL 99-18 | 1996 | Denmark: Roskilde, Zealand | Musca domestica | Muscidae | DQ481220 | DQ481227 | N/A | 5 - 7 | --- | --- | Jensen et al. 2006 | ||||||||||||
15 | E. sp. | LTE cadaver 1 | 2017-08-29-RB | 2017 | USA: Lake Thomas Edison, California | Drosophila sp. | Drosophilidae | OR502658 | --- | N/A | --- | --- | --- | --- | ||||||||||||
16 | E. schizophorae | ARSEF 6817 | KVL 00-93 | 2000 | Denmark: Hundested, Zealand | Pollenia sp. | Polleniidae | DQ481221 | DQ481228 | N/A | 5 - 7 | --- | --- | Jensen et al. 2006 | ||||||||||||
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