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1 | LAST REVIEWED: 14 SEPTEMBER 2022 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
2 | Test-to-Treat: Test kit and Treatment Courses Estimation Tool | ||||||||||||||||||||||||||||||||
3 | Instructions: adjust scenario data in items (1), (2), and (3) below | ||||||||||||||||||||||||||||||||
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5 | Scenario 1 | Scenario 2 | Scenario 3 | Scenario 4 | Scenario 5 | Scenario 6 | |||||||||||||||||||||||||||
6 | Description: similar to current epidemiology e.g. moderate infection rates, moderate test positivity, moderate patient eligibility. | Omicron-like wave | BA.4/5-like surge | [fill as necessary] | [fill as necessary] | [fill as necessary] | |||||||||||||||||||||||||||
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8 | Country | ABC | ABC | ABC | ABC | ABC | ABC | ||||||||||||||||||||||||||
9 | Reference data | District | DEF (or N/A) | DEF (or N/A) | DEF (or N/A) | DEF (or N/A) | DEF (or N/A) | DEF (or N/A) | |||||||||||||||||||||||||
10 | Site | GHI (or N/A) | GHI (or N/A) | GHI (or N/A) | GHI (or N/A) | GHI (or N/A) | GHI (or N/A) | ||||||||||||||||||||||||||
11 | Cumulative Omicron tests and cases determined using OWID between Dec 25 2021 and Mar 3 2021. Included for reference. (adjustable) | National Cumulative Omicron cases* | [fill for reference only - not used in calculations below] | ||||||||||||||||||||||||||||||
12 | National cumulative number of tests* | [fill for reference only - not used in calculations below] | |||||||||||||||||||||||||||||||
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15 | Based on current data | Based on similar omicron outbreak | Based on similar BA.4/5 outbreak | e.g. Yearly estimate July 2021 to June 2022 (OWID) | e.g. Proxy - No waves of infections | e.g. Proxy - 2 BA.5 waves of infection | |||||||||||||||||||||||||||
16 | Est number of cases per [define time period] of implementation+ | 18,000 | 100,000 | 65,000 | |||||||||||||||||||||||||||||
17 | Total estimate over implementation period for catchment area. Adjust these scenarios according to your desired projection. In the absense of reliable catchment or district level data, a calculation of (population of catchment area)/(total country population) * (national cases) may be a useful proxy to estimate the number of cases | ||||||||||||||||||||||||||||||||
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20 | Testing | Test Positivity (Example source: National testing data, OWID, FIND) | 10% | 10% | 10% | 10% | 10% | 10% | |||||||||||||||||||||||||
21 | Positivity can be included and adjusted if helpful. Note: positivity changes rapidly at the outset of a surge, and is primarily useful to calculate tests and cases during times of a relatively stable infection rate. Positivity may range from very low, ~3-5%, to 35% in periods of high infectivity. ALTERNATIVELY, teams can remove calculation in ROW 26, and insert number specific for the country context (further clarification in ROW 26) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
22 | Est percent mild/moderate | 90% | 90% | 90% | 90% | 90% | 90% | ||||||||||||||||||||||||||
23 | Evidence suggests 90% of patients will have mild/moderate disease [reference] | ||||||||||||||||||||||||||||||||
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25 | Est number of tests required | ||||||||||||||||||||||||||||||||
26 | Estimated number of tests required can be calculated based on 1) # of tests performed in district/catchment area over defined period, 2) (population of catchment area)/(total country population) * (national tests) 3) (District/catchment positivity for defined period) * (# cases), 4) (National positivity for defined period) * (# cases in district/catchment area for defined period) | 933,000 | 1,000,000 | 650,000 | 0 | 0 | 0 | ||||||||||||||||||||||||||
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28 | Treatment | Est Percent high risk*** | 15% | 15% | 15% | 15% | 15% | 15% | |||||||||||||||||||||||||
29 | Est percent high risk based on literature | ||||||||||||||||||||||||||||||||
30 | Est percent identified w/in 5 days | 50% | 50% | 50% | 35% | 35% | 35% | ||||||||||||||||||||||||||
31 | NMV/r Percent of stock (optional)* | 50% | 80% | ||||||||||||||||||||||||||||||
32 | Number of mild/mod cases | 16,200 | 90,000 | 58,500 | 0 | 0 | 0 | ||||||||||||||||||||||||||
33 | Number eligible for treatment | 2,430 | 13,500 | 8,775 | 0 | 0 | 0 | ||||||||||||||||||||||||||
34 | Total # of courses required over [insert time period] | 1,215 | 6,750 | 4,388 | 0 | 0 | 0 | ||||||||||||||||||||||||||
35 | Number of NMV/r courses | 3,375 | 3,510 | ||||||||||||||||||||||||||||||
36 | Number of Molnupiravir courses | 3,375 | 878 | ||||||||||||||||||||||||||||||
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41 | Total cost of commodities to implement T2T per quarter | Legend | Notes | ||||||||||||||||||||||||||||||
42 | Cost per RDT (ex works) ^ | Total cost of RDT | Cost per Tx course† | Total cost of Tx | Total cost Dx + Tx | Location | Template can be used to calculate estimates down to catchment area (if preferable) | ||||||||||||||||||||||||||
43 | Scenario 1 | $2.25 | $2,099,250 | $85 | $103,275 | $2,202,525 | OWID | Data retreived from OWID represents worst-case scenario for future outbreaks. Can be used as either reference or to inform calculations | |||||||||||||||||||||||||
44 | Scenario 2 | $2.25 | $2,250,000 | $85 | $573,750 | $2,823,750 | Est Calculation | Calculated fields based on assumptions | |||||||||||||||||||||||||
45 | Scenario 3 | $2.25 | $1,462,500 | $85 | $372,938 | $1,835,438 | Ex works price | Additional costs can be added based on country context | |||||||||||||||||||||||||
46 | Scenario 4 | $2.25 | $0 | $85 | $0 | $0 | Assumptions | These should be updated based on country context | |||||||||||||||||||||||||
47 | Scenario 5 | $2.25 | $0 | $85 | $0 | $0 | Calculated cost | Summarize costs associated with estimated testing and treatment volumes. | |||||||||||||||||||||||||
48 | Scenario 6 | $2.25 | $0 | $85 | $0 | $0 | |||||||||||||||||||||||||||
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50 | Symbol | Notes | |||||||||||||||||||||||||||||||
51 | * | Both Paxlovid and Molnupiravir have contraindications and therefore countries may choose to stock both ARVs. If helpful, country teams may designate the percent of total procured courses that will come from Pfizer. This row is optional. If data is inserted Rows 35 and 36 will calculate total need for each | |||||||||||||||||||||||||||||||
52 | ^ | Represents current cost of test kit without shipping. Country teams can adjust based on average shipping costs per country (USAID has used 30% of RDT cost previously) | |||||||||||||||||||||||||||||||
53 | † | Based on publically available MOL price | |||||||||||||||||||||||||||||||
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55 | Caveats | ||||||||||||||||||||||||||||||||
56 | # of previously infected people within past several months | ||||||||||||||||||||||||||||||||
57 | # vaccinated +/- booster | ||||||||||||||||||||||||||||||||
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