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1 | Please read the accompanying aricle at: | http://articles.qos.ch/covid19-testing.html | ||||||||||||||||||||||||
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3 | The present analysis builds on the yet unpublished work "Pooling Method for Accelerated Testing of COVID-19" by researches at Technion Israel. | |||||||||||||||||||||||||
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6 | Optimal pool sizes as function of infection ratios: | |||||||||||||||||||||||||
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8 | Discard frequency: that frequency at which pools would need to be discarded given a positive test result (i.e. not all negatives). | |||||||||||||||||||||||||
9 | The optimal pool size should be close to the estimated discard frequency. | |||||||||||||||||||||||||
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11 | Infection rates | Test pool size | ||||||||||||||||||||||||
12 | One in every | Infection ratio | 16 | 32 | 64 | 128 | ||||||||||||||||||||
13 | Discard frequency | |||||||||||||||||||||||||
14 | 100 | 0.01 | 6.732092331 | 3.636103635 | 2.107910194 | 1.381695757 | ||||||||||||||||||||
15 | 200 | 0.005 | 12.97540657 | 6.747722996 | 3.643868787 | 2.111694323 | ||||||||||||||||||||
16 | 300 | 0.003333333333 | 19.22318427 | 9.868268348 | 5.197477088 | 2.875348573 | ||||||||||||||||||||
17 | 400 | 0.0025 | 25.47207438 | 12.99104278 | 6.755528562 | 3.647746605 | ||||||||||||||||||||
18 | 1000 | 0.001 | 62.97007878 | 31.73704035 | 16.12252183 | 8.319262186 | ||||||||||||||||||||
19 | 2000 | 0.0005 | 125.4694142 | 62.98570736 | 31.74485414 | 16.12642773 | ||||||||||||||||||||
20 | 4000 | 0.00025 | 250.4690821 | 125.4850411 | 62.99352067 | 31.74876054 | ||||||||||||||||||||
21 | 5000 | 0.0002 | 312.9690157 | 156.7349079 | 78.61825401 | 39.56072714 | ||||||||||||||||||||
22 | 8000 | 0.000125 | 500.468916 | 250.484708 | 125.492854 | 62.99742708 | ||||||||||||||||||||
23 | 10000 | 0.0001 | 625.4688828 | 312.9846414 | 156.7427207 | 78.6221604 | ||||||||||||||||||||
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25 | Country | Population | Confirmed Cases as of 2020-03-18 | Ratio of cases to population | Actual infections** | Actual infection ratio | ||||||||||||||||||||
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27 | Italy | 60480000 | 35000 | 1728 | 175000 | 345.6 | ||||||||||||||||||||
28 | Swizerland | 8570000 | 3000 | 2856.666667 | 15000 | 571.3333333 | ||||||||||||||||||||
29 | South Korea | 51470000 | 8565 | 6009.340339 | 42825 | 1201.868068 | ||||||||||||||||||||
30 | Israel | 8712000 | 433 | 20120.09238 | 2165 | 4024.018476 | ||||||||||||||||||||
31 | USA | 327200000 | 9458 | 34595.05181 | 47290 | 6919.010362 | ||||||||||||||||||||
32 | France | 66990000 | 7730 | 8666.235446 | 38650 | 1733.247089 | ||||||||||||||||||||
33 | ** "Actual" infection rate assumes 5 fold underestimation of confirmed results | |||||||||||||||||||||||||
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35 | Given these tables above, USA and Israel could use pool sizes of 64, S. Korea and France 32, Italy and Swizerland 16. | |||||||||||||||||||||||||
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37 | It should be noted that the discard rate for a given pool size can help estimate the true contamination rate in a country. | |||||||||||||||||||||||||
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