A | B | C | D | E | F | G | H | I | J | K | L | M | N | O | P | Q | R | S | T | U | V | W | X | Y | Z | AA | AB | AC | AD | AE | |
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1 | NovaSeq Sample Sign Up | ||||||||||||||||||||||||||||||
2 | Abbreviations: SE= single-end; PE= paired-end; M= million | ||||||||||||||||||||||||||||||
3 | If you are unsure how to fill a column, leave blank and we will contact you for consultation. | ||||||||||||||||||||||||||||||
4 | NovaSeq now uses the reverse complement for the i5 index. Tab 2 has some common index sequences: Tab3 has Core lab contact information | ||||||||||||||||||||||||||||||
5 | User Name | PI, if not user | Sample Type | ProjectName | Preferred run method | Alternative acceptable methods | Reads needed (Total Project) | Expected Library Completion | sampleID | I7_Index_ID | IndexSequence | I5_Index_ID | IndexSequence | SingleIndexID | IndexSequence | Avg Frag Size | KAPA | Volume (ul) | Run Schedule (Estimated) | Pooled Samples? | Contact Information | Comments / Special Considerations | |||||||||
6 | Example1 | HiC | HiC | 50PE | Any PE | 30M | Done | HiC2 | D701 | ATTACTCG | D501 | AGGCTATA | 600 | 12nM | 20 ul | TSL fill | No | cynthia.vied@med.fsu.edu | Will run on any flowcell for faster turnaround | ||||||||||||
7 | Example2 | RNA-Seq | TBI | 100SE | Any | 100M | 07/21/2018 | TBI1 | Try not to use single indices | GGCTAC | 350 | 10nM | 15 ul | Mid July | No | Need lane sharing: RNA-Seq | |||||||||||||||
8 | New NovaSeq chemistry uses reverse complement for the i5 primer (not i7) Use the complement tool if help is needed: https://www.bioinformatics.org/sms/rev_comp.html | ||||||||||||||||||||||||||||||
9 | No Characters or spaces | No Characters or spaces | No Characters or spaces | No Characters or spaces | No Characters or spaces | ||||||||||||||||||||||||||
10 | |||||||||||||||||||||||||||||||
11 | Villa_lab | ChIP-seq | pool3_RNAP_binding | 100SE, 50 PEor higher | 20M | vRNAP_IgGA_5mpi | D706 | GAATTCGT | D501 | AGGCTATA | |||||||||||||||||||||
12 | Villa_lab | ChIP-seq | pool3_RNAP_binding | 100SE, 50 PEor higher | 20M | vRNAP_IgGB_15mpi | D707 | CTGAAGCT | D501 | AGGCTATA | |||||||||||||||||||||
13 | Villa_lab | ChIP-seq | pool3_RNAP_binding | 100SE, 50 PEor higher | 20M | vRNAP_IgGC_30mpi | D708 | TAATGCGC | D501 | AGGCTATA | |||||||||||||||||||||
14 | Villa_lab | ChIP-seq | pool3_RNAP_binding | 100SE, 50 PEor higher | 20M | vRNAP_5mpiA | D709 | CGGCTATG | D501 | AGGCTATA | |||||||||||||||||||||
15 | Villa_lab | ChIP-seq | pool3_RNAP_binding | 100SE, 50 PEor higher | 20M | vRNAP_5mpiB | D710 | TCCGCGAA | D501 | AGGCTATA | |||||||||||||||||||||
16 | Villa_lab | ChIP-seq | pool3_RNAP_binding | 100SE, 50 PEor higher | 20M | vRNAP_5mpiC | D711 | TCTCGCGC | D501 | AGGCTATA | |||||||||||||||||||||
17 | Villa_lab | ChIP-seq | pool3_RNAP_binding | 100SE, 50 PEor higher | 20M | vRNAP_15mpiA | D712 | AGCGATAG | D501 | AGGCTATA | |||||||||||||||||||||
18 | Villa_lab | ChIP-seq | pool3_RNAP_binding | 100SE, 50 PEor higher | 20M | vRNAP_15mpiB | D702 | TCCGGAGA | D502 | GCCTCTAT | |||||||||||||||||||||
19 | Villa_lab | ChIP-seq | pool3_RNAP_binding | 100SE, 50 PEor higher | 20M | vRNAP_15mpiC | D703 | CGCTCATT | D502 | GCCTCTAT | |||||||||||||||||||||
20 | Villa_lab | ChIP-seq | pool3_RNAP_binding | 100SE, 50 PEor higher | 20M | vRNAP_30mpiA | D704 | GAGATTCC | D502 | GCCTCTAT | |||||||||||||||||||||
21 | Villa_lab | ChIP-seq | pool3_RNAP_binding | 100SE, 50 PEor higher | 20M | vRNAP_30mpiB | D705 | ATTCAGAA | D502 | GCCTCTAT | |||||||||||||||||||||
22 | Villa_lab | ChIP-seq | pool3_RNAP_binding | 100SE, 50 PEor higher | 20M | vRNAP_30mpiC | D710 | TCCGCGAA | D502 | GCCTCTAT | |||||||||||||||||||||
23 | Villa_lab | ChIP-seq | pool3_RNAP_binding | 100SE, 50 PEor higher | 20M | nvRNAP_IgGA_5mpi | D711 | TCTCGCGC | D502 | GCCTCTAT | |||||||||||||||||||||
24 | Villa_lab | ChIP-seq | pool3_RNAP_binding | 100SE, 50 PEor higher | 20M | nvRNAP_IgGB_15mpi | D712 | AGCGATAG | D502 | GCCTCTAT | |||||||||||||||||||||
25 | Villa_lab | ChIP-seq | pool3_RNAP_binding | 100SE, 50 PEor higher | 20M | nvRNAP_IgGC_30mpi | D702 | TCCGGAGA | D507 | ACGTCCTG | |||||||||||||||||||||
26 | Villa_lab | ChIP-seq | pool3_RNAP_binding | 100SE, 50 PEor higher | 20M | nvRNAP_5mpiB | D704 | GAGATTCC | D507 | ACGTCCTG | |||||||||||||||||||||
27 | Villa_lab | ChIP-seq | pool3_RNAP_binding | 100SE, 50 PEor higher | 20M | nvRNAP_5mpiC | D705 | ATTCAGAA | D507 | ACGTCCTG | |||||||||||||||||||||
28 | Villa_lab | ChIP-seq | pool3_RNAP_binding | 100SE, 50 PEor higher | 20M | nvRNAP_15mpiB | D702 | TCCGGAGA | D508 | GTCAGTAC | |||||||||||||||||||||
29 | Villa_lab | ChIP-seq | pool3_RNAP_binding | 100SE, 50 PEor higher | 20M | nvRNAP_15mpiC | D703 | CGCTCATT | D508 | GTCAGTAC | |||||||||||||||||||||
30 | Villa_lab | ChIP-seq | pool3_RNAP_binding | 100SE, 50 PEor higher | 20M | nvRNAP_30mpiB | D705 | ATTCAGAA | D508 | GTCAGTAC | |||||||||||||||||||||
31 | Villa_lab | ChIP-seq | pool3_RNAP_binding | 100SE, 50 PEor higher | 20M | nvRNAP_60mpiC | D706 | GAATTCGT | D508 | GTCAGTAC | |||||||||||||||||||||
32 | |||||||||||||||||||||||||||||||
33 | Jane | Dennis | MOAseq | MOA_pool_su24 | PE50 or greater | any PE | 550M | complete | MOA_10A_scrI | 7-447 | CCTACGGG | 5-399 | AGCTGTCA | ||||||||||||||||||
34 | MOA_10A_scrII | 7-448 | TGCTATAT | 5-400 | GGGTGATG | ||||||||||||||||||||||||||
35 | MOA_CA_scr5 | 7-449 | AACCGAAC | 5-401 | TACTCCAG | ||||||||||||||||||||||||||
36 | MOA_CA_scr8 | 7-450 | ACCTGCTT | 5-402 | CCCGGATC | ||||||||||||||||||||||||||
37 | MOA_CA_A3 | 7-451 | CCCATGCG | 5-403 | CAGGTGTT | ||||||||||||||||||||||||||
38 | MOA_CA_A11 | 7-473 | TCCCAGCC | 5-425 | GGCAGTTC | ||||||||||||||||||||||||||
39 | MOA_10A_A5 | 7-453 | TAGACAAT | 5-405 | TTTCCTGT | ||||||||||||||||||||||||||
40 | MOA_10A_A6 | 7-454 | TTCTTCCT | 5-406 | CAGAGCAC | ||||||||||||||||||||||||||
41 | MOA_10A_AE | 7-455 | CACCTAAA | 5-407 | CCAGGTAC | ||||||||||||||||||||||||||
42 | MOA_10A_AE2 | 7-463 | ATCGTCTC | 5-415 | CAGGCGAA | ||||||||||||||||||||||||||
43 | MOA_10A_B9 | 7-456 | GTACTCGC | 5-408 | TTTGCGCT | ||||||||||||||||||||||||||
44 | MOA_10A_B92 | 7-464 | CCTTGTGA | 5-416 | GGAGCTAG | ||||||||||||||||||||||||||
45 | MOA_10A_B15 | 7-457 | TAACCAGT | 5-409 | AGGGCGTT | ||||||||||||||||||||||||||
46 | MOA_10A_BD | 7-458 | CGGAAACT | 5-410 | CCGTACGC | ||||||||||||||||||||||||||
47 | MOA_10A_BD2 | 7-466 | CAAATTCT | 5-418 | CCAACATT | ||||||||||||||||||||||||||
48 | MOA_CA_B12 | 7-467 | CTCCTCAC | 5-419 | TATCCGAT | ||||||||||||||||||||||||||
49 | MOA_CA_B21 | 7-468 | ATGTGCAA | 5-420 | GTCACTAT | ||||||||||||||||||||||||||
50 | MOA_CA_Z7 | 7-474 | CTATTCGT | 5-426 | ACAATGCT | ||||||||||||||||||||||||||
51 | MOA_CA_Z23 | 7-470 | ACGCATGG | 5-422 | AATTGACT | ||||||||||||||||||||||||||
52 | MOA_10A_ZA | 7-471 | ACACCACC | 5-423 | AGCGTATT | ||||||||||||||||||||||||||
53 | MOA_10A_Z4 | 7-472 | CACGCTGA | 5-424 | ACGAAGTT | ||||||||||||||||||||||||||
54 | Jane | Dennis | MNase-seq | genomic_pool_su24 | PE50 or greater | any PE | 1B | complete | |||||||||||||||||||||||
55 | genomic_10A_scr1_5U | 7-475 | GAGCCATT | 5-427 | TCCTGGTC | ||||||||||||||||||||||||||
56 | genomic_10A_scr1_200U | 7-476 | ATTAATCG | 5-428 | AATGCTGT | ||||||||||||||||||||||||||
57 | genomic_10A_scr2_5U | 7-477 | GAAGGAGC | 5-429 | TGCAGAAC | ||||||||||||||||||||||||||
58 | genomic_10A_scr2_200U | 7-478 | GATTACAA | 5-430 | CCGGACAG | ||||||||||||||||||||||||||
59 | Jane | Dennis | ChIP | ChIP_pool2_su24 | PE50 or greater | any PE | 850M | complete | |||||||||||||||||||||||
60 | CA1a_shHP1a_3_5U_H2AZ | 7-399 | TGACAGCT | 5-447 | CCCGTAGG | ||||||||||||||||||||||||||
61 | CA1a_shHP1a_3_200U_H2AZ | 7-400 | CATCACCC | 5-448 | ATATAGCA | ||||||||||||||||||||||||||
62 | CA1a_shHP1a_11_5U_H2AZ | 7-401 | CTGGAGTA | 5-449 | GTTCGGTT | ||||||||||||||||||||||||||
63 | CA1a_shHP1a_11_200U_H2AZ | 7-402 | GATCCGGG | 5-450 | AAGCAGGT | ||||||||||||||||||||||||||
64 | CA1a_shHP1b_12_5U_H2AZ | 7-403 | AACACCTG | 5-451 | CGCATGGG | ||||||||||||||||||||||||||
65 | CA1a_shHP1b_12_200U_H2AZ | 7-404 | GTGACGTT | 5-452 | TCCCAGAT | ||||||||||||||||||||||||||
66 | CA1a_shHP1b_21_5U_H2AZ | 7-405 | ACAGGAAA | 5-453 | ATTGTCTA | ||||||||||||||||||||||||||
67 | CA1a_shHP1b_21_200U_H2AZ | 7-406 | GTGCTCTG | 5-454 | AGGAAGAA | ||||||||||||||||||||||||||
68 | CA1a_shH2AZ_7_5U_HP1a | 7-407 | GTACCTGG | 5-455 | TTTAGGTG | ||||||||||||||||||||||||||
69 | CA1a_shH2AZ_7_200U_HP1a | 7-408 | AGCGCAAA | 5-456 | GCGAGTAC | ||||||||||||||||||||||||||
70 | CA1a_shH2AZ_7_5U_HP1b | 7-409 | AACGCCCT | 5-457 | ACTGGTTA | ||||||||||||||||||||||||||
71 | CA1a_shH2AZ_7_200U_HP1b | 7-410 | GCGTACGG | 5-458 | AGTTTCCG | ||||||||||||||||||||||||||
72 | CA1a_shH2AZ_23_5U_HP1a | 7-411 | GCCAGATT | 5-459 | TTCTCAGC | ||||||||||||||||||||||||||
73 | CA1a_shH2AZ_23_200U_HP1b | 7-412 | ATAGCAGA | 5-460 | TAAGACAT | ||||||||||||||||||||||||||
74 | CA1a_shH2AZ_23_5U_HP1b | 7-413 | GAGATGAT | 5-461 | AGGCGTGA | ||||||||||||||||||||||||||
75 | CA1a_shH2AZ_23_200U_HP1b | 7-414 | GCCCGTCT | 5-462 | GCTGTTGC | ||||||||||||||||||||||||||
76 | 10A_shH2AZ_4_5U_HP1a | 7-418 | AATGTTGG | 5-466 | AGAATTTG | ||||||||||||||||||||||||||
77 | 10A_shH2AZ_4_200U_HP1a | 7-419 | ATCGGATA | 5-467 | GTGAGGAG | ||||||||||||||||||||||||||
78 | 10A_shH2AZ_1A_200U_HP1b | 7-420 | ATAGTGAC | 5-468 | TTGCACAT | ||||||||||||||||||||||||||
79 | 10A_shHP1b_D_5U_H2AZ | 7-421 | GCTCCCTG | 5-469 | ACATTTGC | ||||||||||||||||||||||||||
80 | 10A_shHP1b_15_200U_H2AZ | 7-422 | AGTCAATT | 5-470 | CCATGCGT | ||||||||||||||||||||||||||
81 | 10A_BD_5U_IgG | 7-432 | TTCGCTCA | 5-480 | TGGCAAGT | ||||||||||||||||||||||||||
82 | 10A_BD_200U_IgG | 7-433 | TCTTAGTT | 5-481 | CAATTCCT | ||||||||||||||||||||||||||
83 | 10A_BD_5U_H2AZ | 7-434 | ACCACTCG | 5-482 | TGTAATAG | ||||||||||||||||||||||||||
84 | 10A_BD_200U_H2AZ | 7-435 | AGAACGAT | 5-483 | GGTCCCTA | ||||||||||||||||||||||||||
85 | 10A_shZ1A_5U_HP1a | 7-436 | ATCCCGTA | 5-484 | GGTCTTCT | ||||||||||||||||||||||||||
86 | 10A_shZ1A_200U_HP1a | 7-437 | GCTGGACG | 5-485 | CTGTTACG | ||||||||||||||||||||||||||
87 | 10A_shZ1A_5U_HP1b | 7-438 | TGATTGAT | 5-486 | TTATGGGT | ||||||||||||||||||||||||||
88 | 10A_A5_5U_H2AZ | 7-439 | CCCAAATG | 5-487 | CAATGGTG | ||||||||||||||||||||||||||
89 | 10A_A5_200U_H2AZ | 7-440 | ATTCGCAT | 5-488 | ATAGCTAA | ||||||||||||||||||||||||||
90 | 10A_A6_5U_H2AZ | 7-441 | CGTCAAGA | 5-489 | GGGTTGTT | ||||||||||||||||||||||||||
91 | 10A_A6_200U_H2AZ | 7-442 | CTTCGACC | 5-490 | ACAGTAAC | ||||||||||||||||||||||||||
92 | 10A_AE_5U_H2AZ | 7-443 | CAGACGAC | 5-491 | GTGCTCGG | ||||||||||||||||||||||||||
93 | 10A_AE_200U_H2AZ | 7-444 | ATCGTAGG | 5-396 | TCGAAACT | ||||||||||||||||||||||||||
94 | CA_A11_5U_IgG | 7-445 | GCGCAGAC | 5-397 | AGAGGTTC | ||||||||||||||||||||||||||
95 | CA_A11_200U_IgG | 7-446 | AATTGCGG | 5-398 | CACTGGGC | ||||||||||||||||||||||||||
96 | |||||||||||||||||||||||||||||||
97 | Jane | Dennis | MNase-seq | sensitivity_pool_su24 | PE50 or greater | any PE | 750M | complete | sensitivity_10A_AE_5 | 7-239 | CGTGGATT | 5-287 | CTAAGAGT | ||||||||||||||||||
98 | sensitivity_10A_AE_200 | 7-240 | GTAGATGC | 5-288 | TGTTGCTC | ||||||||||||||||||||||||||
99 | sensitivity_10A_A6_5 | 7-241 | TACCGCTC | 5-289 | CGTCACTG | ||||||||||||||||||||||||||
100 | sensitivity_10A_A6_200 | 7-242 | CGAACCAC | 5-290 | TCAATCTT |