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1 | BMC Bioinformatics Facility Hands-on Sessions schedule 2025-2026 | |||||||||||||||||||||||||||
2 | Session count | Status | Level | Topic | Date | Location | Time | Presenters | Slides | Zoom link | ||||||||||||||||||
3 | 001 | Delivered | Computer tools helpful to analyze data | How to interact with a computer: a brief practical introduction to UNIX commands | Wednesday, October 22, 2025 | Oddi 103 | 13:00 - 14:00 | Adrian | https://tinyurl.com/hos2501 | https://eu01web.zoom.us/my/adrian.hi | ||||||||||||||||||
4 | 002 | Delivered | Programming environments: plain text editors, RStudio & Jupyter lab | Wednesday, November 5, 2025 | Oddi 103 | 13:00 - 14:00 | Adrian | https://tinyurl.com/hos2502 | https://eu01web.zoom.us/my/adrian.hi | |||||||||||||||||||
5 | 003 | Delivered | Introduction to a high performance computing environment | Wednesday, November 19, 2025 | Oddi 103 | 13:00 - 14:00 | Adrian | https://tinyurl.com/hos25003 | https://eu01web.zoom.us/my/adrian.hi | |||||||||||||||||||
6 | 004 | Delivered | Pipelines that can be run on your laptop | Transcriptome quantification with kallisto | Wednesday, December 3, 2025 | Oddi 103 | 13:00 - 14:00 | Adrian | https://tinyurl.com/hos2504 | https://eu01web.zoom.us/my/adrian.hi | ||||||||||||||||||
7 | 005 | Delivered | Differential gene expression calling using DESeq2 | Wednesday, December 17, 2025 | Oddi 103 | 13:00 - 14:00 | Adrian | https://tinyurl.com/hos2505 | https://eu01web.zoom.us/my/adrian.hi | |||||||||||||||||||
8 | 006 | Delivered | Gene expression data visualization | Wednesday, January 14, 2026 | Læknagarður 229 | 13:00 - 14:00 | Adrian | https://tinyurl.com/hos26s06 | https://eu01web.zoom.us/my/adrian.hi | |||||||||||||||||||
9 | 007 | Delivered | Gene set functional enrichment analysis | Wednesday, January 28, 2026 | Læknagarður 229 | 13:00 - 15:00 | Adrian | https://tinyurl.com/hos26s07 | https://eu01web.zoom.us/my/adrian.hi | |||||||||||||||||||
10 | 008 | Announced | Pipelines that partially require an HPC environment | Single-cell transcriptome analysis | Wednesday, February 11, 2026 | Askja 129 | 13:00 - 15:00 | Adrian | TBA | https://eu01web.zoom.us/my/adrian.hi | ||||||||||||||||||
11 | 009 | Scheduled | Trajectory inference in single-cell transcriptomics | Wednesday, February 25, 2026 | Læknagarður 229a | 13:00 - 15:00 | Adrian | TBA | https://eu01web.zoom.us/my/adrian.hi | |||||||||||||||||||
12 | 010 | Scheduled | RNA velocity of single cells | Wednesday, March 11, 2026 | Læknagarður 229a | 13:00 - 15:00 | Adrian | TBA | https://eu01web.zoom.us/my/adrian.hi | |||||||||||||||||||
13 | 011 | Scheduled | Pipelines that require an HPC environment | Variant calling using freebayes | Wednesday, April 15, 2026 | Læknagarður 229a | 13:00 - 15:00 | Adrian | TBA | https://eu01web.zoom.us/my/adrian.hi | ||||||||||||||||||
14 | 012 | Scheduled | CUT & RUN data analysis | Wednesday, May 6, 2026 | Læknagarður 229a | 13:00 - 15:00 | Adrian | TBA | https://eu01web.zoom.us/my/adrian.hi | |||||||||||||||||||
15 | 013 | Scheduled | Transcriptome quantification using Nanopore sequencing data | Wednesday, May 27, 2026 | Læknagarður 229a | 13:00 - 15:00 | Adrian | TBA | https://eu01web.zoom.us/my/adrian.hi | |||||||||||||||||||
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