A | B | C | D | E | F | G | H | I | J | K | L | M | N | O | P | Q | R | S | T | U | V | W | X | Y | Z | AA | AB | AC | |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 | ID | Parental cell line | Parental cell line source | CRISPRi/CRISPRa | Clonal population (Y/N) | Clone name | Construct name | IGI Plasmid code | Addgene Plasmid code | Depositing Lab | Cells made by | Growth media | Other notes | Name for Distribution | |||||||||||||||
2 | 1 | Jurkat E6.1 | Berkeley TC facility | CRISPRi | Y | NH7 | pHR-EF1a-dCas9-BFP-KRAB | IGI-P0152 | Not yet deposited | Jacob Corn | Benjamin Gowen | RPMI, 10% FCS, Pen-Strep, Sodium Pyruvate | Cas9 is HA-tagged | Jurkat CRISPRi | |||||||||||||||
3 | 2 | Jurkat E6.1 | Berkeley TC facility | CRISPRa | Y | RF20 | Lenti dCas9-VP64-2A-GFP | IGI-P0216 | Addgene 61422 | Jacob Corn | Benjamin Gowen | RPMI, 10% FCS, Pen-Strep, Sodium Pyruvate | Jurkat CRISPRa (VP64) | ||||||||||||||||
4 | 3 | HuT78 | Art Weiss, UCSF | CRISPRa | Y | AMB.6 | Lenti dCas9-VP64-2A-GFP | IGI-P0216 | Addgene 61422 | Jacob Corn | Mandy Boontanrart | RPMI, 10% FCS, Pen-Strep, Sodium Pyruvate | HuT78 CRISPRa (VP64) | ||||||||||||||||
5 | 4 | HCT116 | Berkeley TC facility | CRISPRi | Y | HCT116-C6 | pHR-EF1a-dCas9-BFP-KRAB-NLS | IGI-P0220 | Not yet deposited | Jacob Corn | Jin Rui Liang | DMEM Hi-Glucose with Glutamine, 10% FBS, Pen-Strep | Cas9 is HA-tagged | HCT116 CRISPRi | |||||||||||||||
6 | 5 | LK2 | AZ (?) | CRISPRi | Y | c16 | pSFFV-HA-dCas9KRAB-BFP | IGI-P0021 | Addgene 46911 | Jacob Corn | PeiChun Lin | RPMI, 10% FCS, Pen-Strep, Sodium Pyruvate | Cas9 is HA-tagged | LK2 CRISPRi | |||||||||||||||
7 | 6 | 3T3-L1 | Berkeley TC facility | CRISPRi | Y | Clone 23 | pHR-EF1a-dCas9-BFP-KRAB-NLS | IGI-P0220 | Not yet deposited | Jacob Corn | Hong Ma | DMEM Hi-Glucose with Glutamine, 10% FBS, Pen-Strep | Cas9 is HA-tagged. Cells must be kept below 60% confluent and be passaged every 3 days. | 3T3-L1 CRISPRi | |||||||||||||||
8 | 7 | K562 | Berkeley TC facility | CRISPRi | Y | K1e | pHR-hEF1a-dCas9-mcherry-KRAB-mPGK-Hyg | pCR1063 | Not yet deposited | Jacob Corn | Chris Richardson | RPMI, 10% FCS, Pen-Strep, Sodium Pyruvate | K562 CRISPRi | ||||||||||||||||
9 | |||||||||||||||||||||||||||||
10 | |||||||||||||||||||||||||||||
11 | |||||||||||||||||||||||||||||
12 | |||||||||||||||||||||||||||||
13 | |||||||||||||||||||||||||||||
14 | |||||||||||||||||||||||||||||
15 | |||||||||||||||||||||||||||||
16 | |||||||||||||||||||||||||||||
17 | |||||||||||||||||||||||||||||
18 | |||||||||||||||||||||||||||||
19 | |||||||||||||||||||||||||||||
20 | |||||||||||||||||||||||||||||
21 | |||||||||||||||||||||||||||||
22 | |||||||||||||||||||||||||||||
23 | |||||||||||||||||||||||||||||
24 | |||||||||||||||||||||||||||||
25 | |||||||||||||||||||||||||||||
26 | |||||||||||||||||||||||||||||
27 | |||||||||||||||||||||||||||||
28 | |||||||||||||||||||||||||||||
29 | |||||||||||||||||||||||||||||
30 | |||||||||||||||||||||||||||||
31 | |||||||||||||||||||||||||||||
32 | |||||||||||||||||||||||||||||
33 | |||||||||||||||||||||||||||||
34 | |||||||||||||||||||||||||||||
35 | |||||||||||||||||||||||||||||
36 | |||||||||||||||||||||||||||||
37 | |||||||||||||||||||||||||||||
38 | |||||||||||||||||||||||||||||
39 | |||||||||||||||||||||||||||||
40 | |||||||||||||||||||||||||||||
41 | |||||||||||||||||||||||||||||
42 | |||||||||||||||||||||||||||||
43 | |||||||||||||||||||||||||||||
44 | |||||||||||||||||||||||||||||
45 | |||||||||||||||||||||||||||||
46 | |||||||||||||||||||||||||||||
47 | |||||||||||||||||||||||||||||
48 | |||||||||||||||||||||||||||||
49 | |||||||||||||||||||||||||||||
50 | |||||||||||||||||||||||||||||
51 | |||||||||||||||||||||||||||||
52 | |||||||||||||||||||||||||||||
53 | |||||||||||||||||||||||||||||
54 | |||||||||||||||||||||||||||||
55 | |||||||||||||||||||||||||||||
56 | |||||||||||||||||||||||||||||
57 | |||||||||||||||||||||||||||||
58 | |||||||||||||||||||||||||||||
59 | |||||||||||||||||||||||||||||
60 | |||||||||||||||||||||||||||||
61 | |||||||||||||||||||||||||||||
62 | |||||||||||||||||||||||||||||
63 | |||||||||||||||||||||||||||||
64 | |||||||||||||||||||||||||||||
65 | |||||||||||||||||||||||||||||
66 | |||||||||||||||||||||||||||||
67 | |||||||||||||||||||||||||||||
68 | |||||||||||||||||||||||||||||
69 | |||||||||||||||||||||||||||||
70 | |||||||||||||||||||||||||||||
71 | |||||||||||||||||||||||||||||
72 | |||||||||||||||||||||||||||||
73 | |||||||||||||||||||||||||||||
74 | |||||||||||||||||||||||||||||
75 | |||||||||||||||||||||||||||||
76 | |||||||||||||||||||||||||||||
77 | |||||||||||||||||||||||||||||
78 | |||||||||||||||||||||||||||||
79 | |||||||||||||||||||||||||||||
80 | |||||||||||||||||||||||||||||
81 | |||||||||||||||||||||||||||||
82 | |||||||||||||||||||||||||||||
83 | |||||||||||||||||||||||||||||
84 | |||||||||||||||||||||||||||||
85 | |||||||||||||||||||||||||||||
86 | |||||||||||||||||||||||||||||
87 | |||||||||||||||||||||||||||||
88 | |||||||||||||||||||||||||||||
89 | |||||||||||||||||||||||||||||
90 | |||||||||||||||||||||||||||||
91 | |||||||||||||||||||||||||||||
92 | |||||||||||||||||||||||||||||
93 | |||||||||||||||||||||||||||||
94 | |||||||||||||||||||||||||||||
95 | |||||||||||||||||||||||||||||
96 | |||||||||||||||||||||||||||||
97 | |||||||||||||||||||||||||||||
98 | |||||||||||||||||||||||||||||
99 | |||||||||||||||||||||||||||||
100 |