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|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 | L99A binders | |||||||||||||||||||||||||
2 | These compounds are known to bind to T4 lysozme L99A: | |||||||||||||||||||||||||
3 | ||||||||||||||||||||||||||
4 | name | smiles | zincid | dTM (cels) | kd (µM) | pdb | refs | |||||||||||||||||||
5 | (2-thienylthio)acetone | CC(=O)CSc1cccs1 | ZINC000000156217 | 1.1 | Su et al., 2001 | |||||||||||||||||||||
6 | 1-ethyl-2-hydro-1,2-azaborine | CCN1BC=CC=C1 | ZINC000198032079 | 3HH5 | Liu et al., 2009 | |||||||||||||||||||||
7 | 1-ethyl-2-methylcyclopentene | CCC1=C(C)CCC1 | ZINC000002575437 | 1.2 | Su et al., 2001 | |||||||||||||||||||||
8 | 1-methylpyrrole | Cn1cccc1 | ZINC000001692446 | 2.2 | 544 | 2OU0 | Mobley et al., 2007 | |||||||||||||||||||
9 | 1-phenyl-1-propyne | CC#Cc1ccccc1 | ZINC000001845841 | 3 | Morton et al., 1995 | |||||||||||||||||||||
10 | 1,2-benzenedithiol | Sc1ccccc1S | ZINC000000388565 | 2.5 | n.a. | Mobley et al., 2007 | ||||||||||||||||||||
11 | 1,2-benzisoxazole | c1noc2ccccc12 | ZINC000004521187 | 0.4 | Morton et al., 1995 | |||||||||||||||||||||
12 | 1,2-dichlorobenzene | Clc1ccccc1Cl | ZINC000000388506 | 2.9 | 20 | 2OTY | Mobley et al., 2007 | |||||||||||||||||||
13 | 1,2-dihydro-1,2-azaborine | B1C=CC=CN1 | ZINC000198032072 | 197 | 3HH3 | Lee et al., 2016 | Liu et al., 2009 | |||||||||||||||||||
14 | 2-(methylthio)thiophene | CSc1cccs1 | ZINC000000160928 | 3.3 | Su et al., 2001 | |||||||||||||||||||||
15 | 2-ethoxyphenol | CCOc1ccccc1O | ZINC000000404747 | 1.2 | 2RB1 | Graves et al., 2008 | ||||||||||||||||||||
16 | 2-ethylfuran | CCc1ccco1 | ZINC000002037726 | 1.9 | Morton et al., 1995 | |||||||||||||||||||||
17 | 2-ethyltoluene | CCc1ccccc1C | ZINC000001598717 | 1.1 | 505.1 | Morton et al., 1995 | ||||||||||||||||||||
18 | 2-iodopropane | CC(C)I | ZINC000002012814 | 1.1 | Morton et al., 1995 | |||||||||||||||||||||
19 | 2-iodotoluene | Cc1ccccc1I | ZINC000001672846 | 1.9 | Morton et al., 1995 | |||||||||||||||||||||
20 | 2-methylbenzofuran | Cc1cc2ccccc2o1 | ZINC000002013344 | 1.1 | Morton et al., 1995 | |||||||||||||||||||||
21 | 2,3-benzofuran | c2cc1ccccc1o2 | ZINC000001591814 | 3 | 112.4 | 182L | Morton et al., 1995 | |||||||||||||||||||
22 | 2,6-difluorobenzylbromide | Fc1cccc(F)c1CBr | ZINC000002242587 | 1.6 | 2RB0 | Graves et al., 2008 | ||||||||||||||||||||
23 | 3-ethyltoluene | CCc1cccc(C)c1 | ZINC000001699560 | 1.1 | 198 | Morton et al., 1995 | ||||||||||||||||||||
24 | 3-iodotoluene | Cc1cccc(c1)I | ZINC000001672847 | 2 | Morton et al., 1995 | |||||||||||||||||||||
25 | 3-methylbenzylazide | Cc1cccc(CN=[N+]=[N-])c1 | ZINC000015443126 | 1.5 | 2RB2 | Graves et al., 2008 | ||||||||||||||||||||
26 | 3-phenyl-1-propanethiol | SCCCc1ccccc1 | ZINC000005138975 | 4.5 | Morton et al., 1995 | |||||||||||||||||||||
27 | 3-phenyl-1-propanol | OCCCc1ccccc1 | ZINC000001747839 | 1 | Morton et al., 1995 | |||||||||||||||||||||
28 | 4-(methylthio)nitrobenzene | CSc1ccc([N+](=O)[O-])cc1 | ZINC000000163356 | 1.3 | 2RAZ | Graves et al., 2008 | ||||||||||||||||||||
29 | 4-ethyltoluene | CCc1ccc(C)cc1 | ZINC000001699561 | 1.7 | 120 | Morton et al., 1995 | ||||||||||||||||||||
30 | 4-iodotoluene | Cc1ccc(I)cc1 | ZINC000001003750 | 1.3 | Morton et al., 1995 | |||||||||||||||||||||
31 | 6-methyl-1,5,heptadiene | C=CCCC=C(C)C | ZINC000002563375 | 2.8 | n.a. | Graves et al., 2008 | ||||||||||||||||||||
32 | allyl ethyl sulfide | CCSCC=C | ZINC000002166476 | 1.9 | Morton et al., 1995 | |||||||||||||||||||||
33 | allyl n-propylether | CCCOCC=C | ZINC000001601799 | 1.6 | Morton et al., 1995 | |||||||||||||||||||||
34 | allyl sulfide | C=CCSCC=C | ZINC000001531083 | 1.9 | Morton et al., 1995 | |||||||||||||||||||||
35 | anisole | COc1ccccc1 | ZINC000000897131 | 1.4 | Morton et al., 1995 | |||||||||||||||||||||
36 | b-et-1,2-azaborine | CCB1C=CC=CN1 | ZINC000584904740 | 172 | 5JWS | Lee et al., 2016 | ||||||||||||||||||||
37 | benzene | c1ccccc1 | ZINC000000967532 | 5.9 | 85 , 175 | 4W52, 3HH4, 181L | Lee et al., 2016 | Merski et al., 2014 | Liu et al., 2009 | Eriksson et al., 1992 | ||||||||||||||||
38 | benzyl mercaptan | SCc1ccccc1 | ZINC000003873647 | 2.1 | Morton et al., 1995 | |||||||||||||||||||||
39 | beta-chlorophenetole | ClCCOc1ccccc1 | ZINC000001587815 | 6.5 | 2RAY | Graves et al., 2008 | ||||||||||||||||||||
40 | bromoethane | CCBr | ZINC000013950913 | 2.4 | Morton et al., 1995 | |||||||||||||||||||||
41 | cis-3-hexenyl formate | CC/C=C\CCOC=O | ZINC000014438701 | 1.5 | n.a. | Graves et al., 2008 | ||||||||||||||||||||
42 | cyclohexene | C1CCC=CC1 | ZINC000013950911 | 1 | Morton et al., 1995 | |||||||||||||||||||||
43 | diethyl disulfide | CCSSCC | ZINC000001648264 | 3.5 | Morton et al., 1995 | |||||||||||||||||||||
44 | diisopropyl disulfide | CC(C)SSC(C)C | ZINC000001674078 | 0.7 | Morton et al., 1995 | |||||||||||||||||||||
45 | dipropyl disulfide | CCCSSCCC | ZINC000001531084 | 2 | Morton et al., 1995 | |||||||||||||||||||||
46 | ethylbenzene | CCc1ccccc1 | ZINC000000968270 | 85 , 68 | 4W54, 3HH6 | Lee et al., 2016 | Merski et al., 2014 | Liu et al., 2009 | Morton et al., 1995 | |||||||||||||||||
47 | fluorobenzene | Fc1ccccc1 | ZINC000000967759 | 5.9 | Morton et al., 1995 | |||||||||||||||||||||
48 | hexafluorobenzene | Fc1c(c(c(c(c1F)F)F)F)F | ZINC000001583743 | 1.5 | Morton et al., 1995 | |||||||||||||||||||||
49 | indene | C1C=Cc2ccccc21 | ZINC000001699888 | 1.2 | 193.4 | 183L | Morton et al., 1995 | |||||||||||||||||||
50 | indole | c2cc1ccccc1[nH]2 | ZINC000014516984 | 1.7 | 289.9 | 185L | Morton et al., 1995 | |||||||||||||||||||
51 | iodobenzene | Ic1ccccc1 | ZINC000001699878 | 2.6 | Morton et al., 1995 | |||||||||||||||||||||
52 | iodoethane | CCI | ZINC000013950914 | 1.6 | Morton et al., 1995 | |||||||||||||||||||||
53 | isobutylbenzene | CC(C)Cc1ccccc1 | ZINC000001615327 | 2.9 | 19.3 | 184L | Morton et al., 1995 | |||||||||||||||||||
54 | m-xylene | Cc1cccc(c1)C | ZINC000000968281 | 1.8 | 363.6 | Morton et al., 1995 | ||||||||||||||||||||
55 | methylcyclohexane | CC1CCCCC1 | ZINC000001699964 | 1.1 | Morton et al., 1995 | |||||||||||||||||||||
56 | n-butylbenzene | CCCCc1ccccc1 | ZINC000001586756 | 1.4 | 14 | 4W57,186L | Merski et al., 2014 | Morton et al., 1995 | ||||||||||||||||||
57 | n-hexylbenzene | CCCCCCc1ccccc1 | ZINC000001760823 | 0.5 | 4W59 | Merski et al., 2014 | Morton et al., 1995 | |||||||||||||||||||
58 | n-methylaniline | CNc1ccccc1 | ZINC000000901343 | 1 | 350 | 2OTZ | Mobley et al., 2007 | |||||||||||||||||||
59 | n-pentylbenzene | CCCCCc1ccccc1 | ZINC000001699444 | 4W58 | Merski et al., 2014 | Morton et al., 1995 | ||||||||||||||||||||
60 | n-propylbenzene | CCCc1ccccc1 | ZINC000001747837 | 6.2 | 18 | 4W55 | Merski et al., 2014 | Morton et al., 1995 | ||||||||||||||||||
61 | naphthalene | c2ccc1ccccc1c2 | ZINC000000967522 | 1 | Morton et al., 1995 | |||||||||||||||||||||
62 | nitrobenzene | O=[N+]([O-])c1ccccc1 | ZINC000000896426 | 0.7 | Morton et al., 1995 | |||||||||||||||||||||
63 | o-xylene | Cc1ccccc1C | ZINC000000968282 | 2.9 | 469.6 | 188L | Morton et al., 1995 | |||||||||||||||||||
64 | p-xylene | Cc1ccc(cc1)C | ZINC000000968254 | 2.4 | 421.9 | 187L | Morton et al., 1995 | |||||||||||||||||||
65 | phenylacetylene | C#Cc1ccccc1 | ZINC000001680639 | 0.7 | Morton et al., 1995 | |||||||||||||||||||||
66 | sec-butylbenzene | CCC(C)c1ccccc1 | ZINC000002041000 | 1.3 | 4W56 | Merski et al., 2014 | Morton et al., 1995 | |||||||||||||||||||
67 | styrene | C=Cc1ccccc1 | ZINC000000968269 | 2 | Morton et al., 1995 | |||||||||||||||||||||
68 | thianaphthene | c2cc1ccccc1s2 | ZINC000001679161 | 1.5 | Morton et al., 1995 | |||||||||||||||||||||
69 | thioanisole | CSc1ccccc1 | ZINC000001688763 | 1.4 | Morton et al., 1995 | |||||||||||||||||||||
70 | thiophene-2-thiol | Sc1cccs1 | ZINC000002169156 | 2.1 | Su et al., 2001 | |||||||||||||||||||||
71 | thiophenol | Sc1ccccc1 | ZINC000001867127 | 4.5 | Su et al., 2001 | |||||||||||||||||||||
72 | toluene | Cc1ccccc1 | ZINC000000967534 | 4.4 | 102 | 4W53 | Merski et al., 2014 | Morton et al., 1995 | ||||||||||||||||||
73 | ||||||||||||||||||||||||||
74 | ||||||||||||||||||||||||||
75 | ||||||||||||||||||||||||||
76 | ||||||||||||||||||||||||||
77 | L99A non-binders | |||||||||||||||||||||||||
78 | We have NOT been able to detect binding of these compounds to T4 lysozyme L99A at high concentrations, and we consider them non-binders. | |||||||||||||||||||||||||
79 | ||||||||||||||||||||||||||
80 | name | smiles | zincid | dTM (cels) | kd | pdb | ref | |||||||||||||||||||
81 | thieno[2,3-c]pyridine | c1cc2ccncc2s1 | ZINC966806 | -0.4 | Mobley et al., 2007 | |||||||||||||||||||||
82 | trichloromethane | ClC(Cl)Cl | ZINC8214524 | Morton et al., 1995 | ||||||||||||||||||||||
83 | methanol | CO | N.A. | Morton et al., 1995 | ||||||||||||||||||||||
84 | 2-bromoethan-1-ol | OCCBr | ZINC4978447 | Morton et al., 1995 | ||||||||||||||||||||||
85 | 2-iodoethan-1-ol | OCCI | ZINC13951488 | Morton et al., 1995 | ||||||||||||||||||||||
86 | ethanol | CCO | ZINC12358605 | Morton et al., 1995 | ||||||||||||||||||||||
87 | methanesulfinylmethane | CS(C)=O | ZINC5224188 | Morton et al., 1995 | ||||||||||||||||||||||
88 | propan-1-ol | CCCO | ZINC895969 | Morton et al., 1995 | ||||||||||||||||||||||
89 | furan | O1C=CC=C1 | ZINC2041074 | Morton et al., 1995 | ||||||||||||||||||||||
90 | 2-methylpropane | CC(C)C | ZINC8214586 | Morton et al., 1995 | ||||||||||||||||||||||
91 | pyridine | C1=CC=NC=C1 | ZINC895354 | Morton et al., 1995 | ||||||||||||||||||||||
92 | 1,1-diethylurea | CCN(CC)C(N)=O | ZINC409175 | Morton et al., 1995 | ||||||||||||||||||||||
93 | 1-azido-2,3,4,5,6-pentafluorobenzene | FC1=C(F)C(F)=C(N=[N+]=[N-])C(F)=C1F | ZINC13950912 | Morton et al., 1995 | ||||||||||||||||||||||
94 | pentafluoroaniline | NC1=C(F)C(F)=C(F)C(F)=C1F | ZINC2022414 | Morton et al., 1995 | ||||||||||||||||||||||
95 | 2-azido-1,3-difluorobenzene | FC1=CC=CC(F)=C1N=[N+]=[N-] | ZINC35854893 | Morton et al., 1995 | ||||||||||||||||||||||
96 | 1,2-diiodobenzene | IC1=C(I)C=CC=C1 | ZINC6827585 | Morton et al., 1995 | ||||||||||||||||||||||
97 | 1,4-diiodobenzene | IC1=CC=C(I)C=C1 | ZINC6827587 | Morton et al., 1995 | ||||||||||||||||||||||
98 | phenol | OC1=CC=CC=C1 | ZINC5133329 | Morton et al., 1995 | ||||||||||||||||||||||
99 | aniline | NC1=CC=CC=C1 | ZINC17886255 | Morton et al., 1995 | ||||||||||||||||||||||
100 | 2,5-dimethylfuran | CC1=CC=C(C)O1 | ZINC1693339 | Morton et al., 1995 | ||||||||||||||||||||||