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1 | Task # | Deliverable | GitHub Tickets | Task | Estimated People Time | GSP? | Completion Date Goal | Sprint Start | Sprint End | Contigenent Upon Task #? | Status | Responsible- Person that does the work | Accountable- Who makes the decisions / guides the person accountable | Consulted - Who has an opinion/ input | Informed- who wants to know when things happen | Blockers | Notes | ||||||||||||||||||
2 | 1 | 1 | #372 -done #140 - done #382 - added to sprint 12-13 #374 - in sprint #375 in sprint #156 - added to sprint 12-13 #157 - added to sprint 12-13 | Update slot values (description, examples, clarification) based on existing user feedback | 10 days | Yes | Dec 23rd | 1 | 1 | Overdue | Montana, Mark | Montana | Mark, Sujay | How? Pycharm? Schema directly? | |||||||||||||||||||||
3 | 7 | 1 | #814 | Develop sandbox instance of submission portal for workshops | Feb 25th | 5 | Complete | Matt | Kitware | Wouldn't care about data portal parts. Data doesn't need to persist. Max 2months. Get another instance set up on spin. Setting up on SPIN and NERSC (Shane or Shreyas) | Pretty much done. Matt working on ORCID relationship & admin permissions. Moving forward we will need a "delete this X days after last edit" and a way for others to do it / a script. Add on tasks. not required for this squad | ||||||||||||||||||||||||
4 | 9 | 1 | #384 | Align validation with expected values | Yes | Jan 27th | 2 | 3 | 1 | Overdue | Mark | Mark | Montana | Mark requested he capability for LinkML, currently not there. | |||||||||||||||||||||
5 | 16 | 1 | #29-done, issues/15 | Update JGI metadata terms on the submission portal | Yes | Jan 13th | 1 | 2 | Overdue | Montana, Mark | Montana | Montana will provide Mark with what needs updated & Mark will make the changes & updates | Issue 29 PR submitted | ||||||||||||||||||||||
6 | 19 | 3 | #836 | Update NMDC Submission portal to match schema slot updates | Yes | March 8th | 5 | 6 | Mike? | Kitware | Montana, Mark, Patrick | ||||||||||||||||||||||||
7 | 17 | 1 | Determine HOW to accomplish the sandbox portal | Dec 23rd | 1 | 1 | Complete | Montana | Kitware | Discuss Wednesday at sync | Get another instance set up on spin? Setting up on SPIN and NERSC (Shane or Shreyas). Or, provide a "template" for workshops to identify / skip study information part (relates to multiple submissions to one project) | Get another instance set up on spin? Setting up on SPIN and NERSC (Shane or Shreyas). | |||||||||||||||||||||||
8 | 18 | 1 | Set up another SPIN instance for a submission portal sandbox for workshops and general 'play' | Dec 23rd | 1 | 1 | Complete | Shreyas | Montana | Kitware | data-sandbox.microbiomedata.org | ||||||||||||||||||||||||
9 | 2 | 2 | #30 | Determine/design method of 'how to enable multiple data harmonizer sheets' | 3 days | Dec 23rd | 1 | 1 | Complete | Patrick K. | Montana | Mark | Working meeting or 2 W/ Mark | This is ONLY the decision on HOW we will do this | |||||||||||||||||||||
10 | 3 | 2 | #831 | Develop method of "how to enable multiple data harmonizer sheets" | Yes | Feb 17th | 3 | 4 | 2 | Complete | Patrick K. | Patrick K. | Mark, Montana, Chris | Mike / Kitware | This will be for all data submission methods and sample types | Patrick has created a way of import/export into excel to support multiple tabs | |||||||||||||||||||
11 | 6 | 2 | #834 | Design & impliment submission portal display with multiple sheets & new tab view for study and data | Yes | Feb 17th | 1 | 4 | 2,3 | Complete | Faiza/Mike/ Kitware | Montana | Jeff will set up with Faiza when we're ready, 1-2 week notice | Mike vacation 2/12-2/17. Goal is to be ready in dev by 2/10 | Goal to complete by 10th | ||||||||||||||||||||
12 | 5 | 2 | Test multiple data harmonizer sheets & template generation | 2 days | Yes | Feb 25th | 5 | 5 | 2,3,6 | Complete | Julia, Champions | Montana | Julia to add tickets by Feb 28th | ||||||||||||||||||||||
13 | 19 | 2 | Impliment user feedback & deploy to production | Yes | March 8th | 6 | 6 | 5, 6 | Complete | Mike / Kitware / Patrick | Montana | ||||||||||||||||||||||||
14 | 20 | Add "In progress" and "Submitted: Pending Review" metadata/submission status to NMDC schema for submission portal | Yes | March 24th | 6 | 7 | Complete | Mike, Mark | Mark | Montana | 2nd priority to March 8th feedback updates. Will start when that's done. | ||||||||||||||||||||||||
15 | 21 | Deploy task 20 status to production submission portal & sandbox | Yes | April 7th | 7 | 8 | 20 | Complete | Mike | Mark | Montana | ||||||||||||||||||||||||
16 | 10 | 3 | https://github.com/microbiomedata/nmdc-server/issues/835 | Incorporate "status" column into submisson portal | No | TBD | 13 | Paused | Kitware | Currently in dev, need more status and to finalize | |||||||||||||||||||||||||
17 | 13 | 3 | #31 | Identify possible "metadata status" values | 1 day | No | Dec 23rd | 1 | 1 | Paused | Montana | Montana | Chris, | Mark | https://docs.google.com/spreadsheets/d/18tN1_KlQFHq1FFaBTT3zzusEn57tkidAfj-3nC5wDfM/edit?usp=sharing | Make sure status is in the NMDC schema and Kitware will use the schema to inform the submission portal. NOT just copy the text | |||||||||||||||||||
19 | 14 | 3 | #32 | Design and describe "multiple submission per study" | No | TBD | Paused | Montana/Faiza? | Montana | Pushed back due date as Mike/ Kitware priority is the submisson portal tabs/ redesign for multiple DH sheets. | |||||||||||||||||||||||||
20 | 15 | 3 | https://github.com/microbiomedata/nmdc-server/issues/959 | Impliment "copying a study" or "multiple submissions per study" for additional submission | No | TBD | 12, 10, 4, 17 | In Progress | Kitware | Patrick could help. Create a "workshop template / study" and everyone starts with this instead of messing with permissions. Would need a public template. Permission stuff. Clone, or "add samples" or something to add more rows / new samples. | |||||||||||||||||||||||||
21 | 8 | 4 | Create ETL script for converting NMDC submitted metadata into user facility accepted format | Yes | Feb 25th | 3 | 5 | 10 | In Progress | Sujay | Montana | Montana needs to read / review documentation | Files here: https://drive.google.com/drive/folders/14k-ZCLdZwMNwPpcuwD5J8uBhP1EYUeei?usp=share_link | ||||||||||||||||||||||
22 | 11 | 4 | Automate metadata transformation for user facilities | TBD | March 25th | 5 | 7 | 8 | Paused | Elais | Sujay | Mark | Montana | Not GSP priority | |||||||||||||||||||||
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