récapitulatif des 3 manip total

	A	B	C	D	E	F	G	H	I	J	K	L	M	N	O	P
1	Manip 1
2	Manip 1
3	Jour	Concentration en CIP (µg/mL)	Nombres de clones repiqués	Nombre d'antibiogrammes réalisés	Profil gardé congelé	Scanne	Position dans le souchier	Nom			Niveau des transcrits mexF	nfxC	CMI		Mutations
4	Jour	Concentration en CIP (µg/mL)	Nombres de clones repiqués	Nombre d'antibiogrammes réalisés	Profil gardé congelé	Scanne	Position dans le souchier	Souchier	renommé	origine	Niveau des transcrits mexF	nfxC	CIP	IMP	MexT	MexS
5	-	-	-	1	1	+	1	PA14	PA14	PA14	1	souche de réf	0.12	1	wt	wt
6	-	-	-	-	-				PA14-31	PA14-31	55	témoin +			wt	Δ 1 pb 282
7	1	0.03		3 ATBg	3	+	2	PA14-M31	AJ1 3 (1)	PA14-M31	491.7	+	2	2	wt	Δ10 pb 65-75
8	1					+	3	PA14-M32	AJ1 3 (2)	PA14-M32	373.97	+	2	2
9	1					+	4	PA14-M33	AJ1 3 (3)	PA14-M33	509.14	+	2	2	wt	ND
10	1	0.06		4 ATBg	4	+	10	PA14-M61	AJ1 6 (1)	PA14-M61	626.7	+	2	2	wt	Δ13 pb 857-869
11	1					+	11	PA14-M62	AJ1 6 (2)	PA14-M62	553.74	+	2	2
12	1					+	12	PA14-M63	AJ1 6 (3)	PA14-M63	409.43	+	2	2
13	1					+	13	PA14-M64	AJ1 6 (4)	PA14-M64	419.2	+	2	2
14	1	0.12		3 ATBg	3	+	19	PA14-M121	AJ1 12 (1)	PA14-M121	280.8	+	2	2	wt	A823T--> G275C
15	1					+	20	PA14-M122	AJ1 12 (2)	PA14-M122	391.52	+	2	2
16	1					+	21	PA14-M123	AJ1 12 (3)	PA14-M123	386.36	+	2	2
17	2	0.03		3 ATBg	3	+	5	PA14-M34	AJ2 3 (1)	PA14-M34	170.97	+	0.25	2	wt	C994T-->R332W
18	2					+	6	PA14-M35	AJ2 3 (2)	PA14-M35	55.46	+	2	2
19	2					+	7	PA14-M36	AJ2 3 (3)	PA14-M36	188.62	+	2	2
20	2	0.06		3 ATBg	3	+	14	PA14-M65	AJ2 6 (1)	PA14-M65	505.45	+	2	2	wt	Δ13 pb 74-86
21	2					+	15	PA14-M66	AJ2 6 (2)	PA14-M66	466.86	+	2	2	wt	Δ13 pb 74-86
22	2					+	16	PA14-M67	AJ2 6 (3)	PA14-M67	447.85	+	2	2
23
24	Manip 2
25	Manip 2
26	Jour	Concentration en CIP (µg/mL)	Nombres de clones repiqués	Nombre d'antibiogrammes réalisés	Profil gardé congelé	Scanne	Position dans le souchier	Nom			Niveau des transcrits mexF	nfxC	CMI		Mutations
27	Jour	Concentration en CIP (µg/mL)	Nombres de clones repiqués	Nombre d'antibiogrammes réalisés	Profil gardé congelé	Scanne	Position dans le souchier	Souchier	renommé	origine	Niveau des transcrits mexF	nfxC	CIP	IMP	MexT	MexS
28	1	0.03	9	1 ATBg	1	+	46	Manip 1 (25) Jour 1 cip 0,03 µg/ml (1/100)	BJ1 3 (2)	M1 25	-	-	4	4
29	1	0.06	1	1ATBg	1	+	36	23 J1 1/100 cip 0,06	BJ1 6 (1)	J1 23	1.67	-
30	1	0.12	1	1 ATBg	1	+	28	1 J1 cipro 0,12	BJ1 12 (1)	J1 1	1.43	-
31	2	0,03 (1/100)	4	-	0
32	2	0,03 (1/1000)	3	3 ATBg	2	+	35	22 J2 cip 0,03 1/1000	BJ2 3 (4)	J2 22	241.94	+	2	2
33	2	0,03 (1/1000)	3	3 ATBg	2	+	40	33 J2 cipro 0,03 1/1000	BJ2 3 (5)	J2 33	60.28	+	2	2	wt	C398A-->A133D
34	2	0.03	15 clones dont 2 vers CS50	13 ATBg	5	+	29	5 J2 cip 0,03	BJ2 3 (5)	J1 5	498.29	+
35	2					+	30	6 J2 cip 0,03	BJ2 3 (1)	J2 6	88.02	+	1ou2	2
36	2					+	33	14 J2 cipro 0,03 vers CS50	BJ2 3 (2)	J2 14	82.38	+	1	2
37	2					+	34	20 J2 cip 0,03	BJ2 3 (3)	J2 20	453.2	+	2	2
38	2					+	49	Manip 1 (17) J2 Cip 0,03 vers CS50	BJ2 3 (4)	M1 17	45.95	+	1	2	wt	C398A-->A133D
39	2	0.06		2 ATBg	0	-
40	2	0,06 (1/1000)		1 ATBg	0	-
41	2	0.12	1	1 clone TM vers Cip	1	+	31	11 J2 cipro 0,12 TM ↔ CS50	BJ2 12 (1)	J2 11	3.48	-	-	-
42	2	0,12 (1/1000)	4	4 ATBg	1	+	58	J2 0,12 (1/1000) (3) Manip 1	BJ2 12 (2)	M1 3 J2	0.11	-	2	1
43	2	0,12 (1/1000)	9	2 ATBg	2	+	48	Manip 1 (22) J2 cip 0,12 (1/1000)	BJ2 12 (3)	M1 22	1.08	-	2	1
44	2	0,12 (1/1000)	9	2 ATBg	2	+	47	Manip 1 (19) J2 cip 0,12 (1/1000)	BJ2 12 (4)	M1 19	357.04	+	4	4
45	3	0.03	6	1 ATBg	1	+	52	Manip 1 (18) J3 Cip 0,03	BJ3 3 (1)	M1 18	426.56	+	4	4
46	3	0.03	1	1ATBg	1	+	60	J3 0,03 vert (1) Manip 1	BJ3 3 (2)	M1 1 J3	289.63	+	2	4
47	3	0,03 (1/1000)		3 ATBg	2	+	38	26 J3 0,03 1/1000	BJ3 3 (3)	J3 26	426.71	+	2	2
48	3	0,03 (1/1000)		3 ATBg	2	+	39	27 J3 cip 0,03 1/1000	BJ3 3 (4)	J3 27	98.75	+	1	2	wt	C398A-->A133D
49	3	0.06		3 ATBg	0
50	3	0,06 (1/100)	1	1 ATBg	1	+	37	24 J3 cip 0,06 1/100	BJ3 6 (1)	J3 24	279.04	+	2	2	wt	C272A--> A91D
51	3	0,06 (1/1000)		2 ATBg	0
52	3	0.12	1	1 ATBg	1	+	32	12 J3 cip 0,12	BJ3 12 (1)	J3 12	1.61	-	-	-
53	3	0,12 (1/100)	1	1 ATBg	1	+	51	Manip 1 (27) J3 Cip 0,12 (1/100)	BJ3 12 (2)	M1 27	39.66	+	4	8	wt	ΔA275
54	3	0,12 (1/1000)	5	1 ATBg	1	+	50	Manip 1 (24) J3 Cip 0,12 (1/1000)	BJ3 12 (3)	M1 24	300.96	+	4	4
55	4	0.03	4	4 ATBg	1	+	57	Manip 1 (14) J4 Cip 0,03	BJ4 3 (1)	M1 14	380.8	+	4	4
56	4	0.06	8	8 ATBg	2	+	55	Manip 1 (7) J4 Cip 0,06	BJ4 6 (1)	M1 7	283.14	+	4	4	wt	(+T318
57	4	0.06	8	8 ATBg	2	+	54	Manip 1 (13) J4 Cip 0,06	BJ4 6 (2)	M1 13	306.72	+	4	4	wt	ΔC270
58	4	0.12	8	5 ATBg	4	+	53	Manip 1 J4 (1) Cip 0,12	BJ4 12 (1)	M1 (1) J4	247.27	+	32	4
59	4						44	M1 (2) P petites
60	4					+	56	M1 (2) G grosses
61	4					+	61	J4 0,12 (3) Manip 1	BJ4 12 (2)	M1 3 J4	1.18	-	8	1
62	4					+	59	Manip 1 (4) J4 0,12 à recongeler	BJ4 12 (3)	M1 4	1.25	-	8	1
63
64	Manip 3
65	Manip 3
66	Jour	Concentration en CIP (µg/mL)	Nombres de clones repiqués	Nombre d'antibiogrammes réalisés	Profil gardé congelé	Scanne	Position dans le souchier	Nom			Niveau des transcrits mexF	nfxC	CMI		Mutations
67	Jour	Concentration en CIP (µg/mL)	Nombres de clones repiqués	Nombre d'antibiogrammes réalisés	Profil gardé congelé	Scanne	Position dans le souchier	Souchier	renommé	origine	Niveau des transcrits mexF	nfxC	CIP	IMP	MexT	MexS
68	1	0	1	1 ATBg	1	+	63	Manip 2 J1* PA14 sans AB	CJ1 0 (1)	M2 63	456.49	+	4	4	wt	Δ14 pb 725-738
69	1	0.03	8	4 ATBg	3	+	62	PA140,03 J1 M2 (2)	CJ1 3 (1)	M2 62	186.24	+	2	8	wt	ND
70	1	0.03				+	64	J1 0,03 2 bis M2 3	CJ1 3 (2)	M2 64	504.73	+	4	4	wt	Δ13 pb 62-74
71	1	0,03 (1/1000)				+	65	Manip 2 J1 0,03 (1/1000) (1)	CJ1 3 (3)	M2 65	583.89	+	4	4	wt	(+C733
72	1	0.06	18	5 ATBg	2	+	8	PA14 J1 0,06 M2* vert 3,1	CJ1 6 (3)	M2 8	320.61	+	2	2	wt	Δ14 pb 353-366
73	1	0.06	18	5 ATBg	2	+	66	Manip 2 J1 0,06 (2) PA14	CJ1 6 (1)	M2 66	537.47	+	2	4	wt	Δ4 pb 124-127
74	1	0,06 (1/1000)	12	6 ATBg	1	+	67	Manip 2 J1 0,06 (1/1000) (1)	CJ1 6 (2)	M2 67	507.69	+	4	4	wt	Δ14 pb 809-822
75	1	0,12 (1/1000)	12	6 ATBg	2	+	68	Manip 2 J1 0,12 (1/1000) (2) PA14	CJ1 12 (1)	M2 68	362.46	+	4	4	wt	ΔA355
76	1	0,12 (1/1000)	12	6 ATBg	2	+	69	Manip 2 J1 0,12 (1/1000) (1) PA14	CJ1 12 (2)	M2 69	452.34	+	4	4	wt	ΔA355
77	2	0	8	2 ATBg	1	+	22	J2 PA14 (1) Ø M2	CJ2 0 (1)	M2 22	435.47	+	2	2
78	2	0.03	12	4 ATBg	1	+	23	J2 M2 PA14 0,03 (20)	CJ2 3 (1)	M2 23	345.32	+	2	2
79	2	0.06	16	7 ATBg	2	+	24	J2 PA14 0,06 (6) M2	CJ2 6 (1)	M2 24	395.07	+	2	2
80	2	0.06	16	7 ATBg	2	+	25	J2 PA14 0,06 (16) M2 vert	CJ2 6 (2)	M2 25	190.16	+	1	2
81	2	0.12	16	7 ATBg	2	+	27	J2 PA14 0,12 M2 (16)	CJ2 12 (2)	M2 27	488.34	+	4	4
82	2	0.12	6	3 ATBg	1	+	26	J2 PA14 0,12 (6)x M2 vert	CJ2 12 (1)	M2 26	1.95	-	2	1
83	3	0	2	1 ATBg	1	+	76	Manip 2 J3 PA14 0,00 1	CJ3 0 (1)	M2 76	1.35	-	0.25	2
84	3	0.03	8	3 ATBg	3	+	73	Manip 2 J3 PA14 0,03 5	CJ3 3 (3)	M2 73	480.61	+	2	4
85	3					+	72	Manip 2 J3 PA14 0,03 6	CJ3 3 (2)	M2 72	426.33	+	2	4	wt	Δ17 pb 230-246
86	3					+	71	Manip 2 J3 PA14 0,03 7	CJ3 3 (1)	M2 71	347.02	+	2	4
87	3	0.06	8	3 ATBg	3	+	74	Manip 2 J3 PA14 0,06 4	CJ3 6 (1)	M2 74	262.47	+	2	1 ou2
88	3	0.06				+	75	Manip 2 J3 PA14 0,06 3	CJ3 6 (2)	M2 75	431.83	+	2	4	wt	ND
89	3	0.06				+	77	PA14 0,06 J3 M2*2	CJ3 6 (3)	M2 77	2.03	-	2	1
90	3	0.12	8	3 ATBg	2	+	70	Manip 2 J3 PA14 0,12 10	CJ3 12 (1)	M2 70	514.07	+	4	4	wt	Δ2 pb 769-770
91	3	0.12	8	3 ATBg	2	+	78	PA14 0,12 J3 M2 * 8	CJ3 12 (2)	M2 78	815.51	+	32	4	wt	(+5 pb 907-911
92	4	0	6	3 ATBg	2	+	43	J4 5 M2	CJ4 0 (1)	M2 43	428.85	+	4	4
93	4	0	6	3 ATBg	2	+	45	J4 7 M2	CJ4 0 (2)	M2 45	225.36	+	2	4
94	4	0.03	18	7 ATBg	4	+	9	J4 0,03 M2 (1)	CJ4 3 (2)	M2 9	2.17	-	0.25	1
95	4	0.03				+	17	J4 0,03 M2 (3)	CJ4 3 (3)	M2 17	445.94	+	4	4	wt	ΔA914
96	4	0.03				+	18	J4 0,03 M2 (5)	CJ4 3 (4)	M2 18	274.6	+	2	2	wt	Δ6 pb 911-916
97	4	0.03				+	41	J4 1 M2 vert	CJ4 3 (1)	M2 41	1.61	-	0.12	1
98	4	0.06	6	3 ATBg	1	+	42	J4 4 M2	CJ4 6 (1)	M2 42	338.32	+	2	2	wt	(+9 pb 749-757
99	4	0.12	6	3 ATBg	3	+	81	J4 10 M2 vert	CJ4 12 (3)	M2 81	0.92	-	4	1
100	4					+	80	J4 9 M2 vert	CJ4 12 (2)	M2 80	1.05	-	2	1