CALL FOR SUBMISSION
再現可能な論文誌J. Wakateを作ったので投稿してほしい件について
Group2
遠藤優 黒木健 酒井俊輔 杉本竜太 田原沙絵子
ちゃんとノート取ってないから再現できない気がするんですよね
この結果を再現できないのは、あなたのせい
偉い先生
研究員Sさん
研究員Sさん
いやいや、この論文間違ってる...
いや、それまずいでしょ
論文誌を変えれば�サイエンスが変わる�
We’re the next generation
再現可能な論文誌�J. Wakate
再現可能にするシステム
再現可能にするガイドライン
2. 再現可能にするシステム
黒木
Paper as Code方式=コードで出せない結果は結果にあらず
コード
生データ
論文出力
査読・�リバイズ
発表
(やったことある人向け)�要するにKaggle
3. Guideline for authors
田原
心構え
心構え
PIがラボメンバーの再現性担保の
責任を負います
コードやデータの管理方法の指導をしっかり行いましょう
再現性の取れない結果は認められません!
投稿ガイドライン
実行ログ・versionの記録を必ず残しましょう
環境の記録を取りましょう
コードの整理は定期的に行いましょう
コードとデータは公開を義務とします
再現可能な整理されたコードを残しましょう
4. Why you should submit to J. Wakate
遠藤
Be a researcher.
研究者という地位に就きたい・名誉がほしい
この世の森羅万象を明らかにしたい
研究者を目指す理由は違っても、
「再現性の担保」は必要不可欠
Save science, save humanity
For 社会
・研究不正の防止
・業績至上主義からの脱却
For 科学
自身含め研究者が研究を発展させやすい
現象の解明に貢献する
ヒーロー!
「科学の信頼性」を守る
ヒーロー!
その後...
再現性の鬼に!
俺はなる!!
J. Wakateに投稿する!
この結果の圧倒的再現度!!
すごい...すごすぎる!!
偉い先生
Sさん
研究員S、学生S…
この分野のホープだ!
圧倒的成長ができたのは
J. Wakateのおかげ!
君も今すぐJ. Wakateに投稿だ!
Journal
of
Wakate
成長したなぁ...(感涙)
FIN
投稿ガイドライン
Sakai
論文投稿ガイドライン
・公開されてから放置されている解析ツールは極力使用しないこと。
・更新がされていないツールでも評判の良く、長年使用されているものは可
・綺麗に整理したコードをgitに残すこと。 (プログラムの構造もしっかり)
・バージョン管理はしっかりする。
・几帳面で行うというポリシーを持つこと。
section2
section2_シャムボードこぴぺ
解析をするときのルール
2. ディレクトリの名前と構造からデータの由来がわかるようにする。
3. ディレクトリの構造を統一する。
4. ログを残す
5. ブログや他人を当てにしない(高評価のstack overflowスレッドは例外)
6. マニュアルを読む
7. コードをgitに残す
8. 中間ファイルは全てでなく、ある程度解析の時間がかかる区間ごとに保存する。
9. 実験ノートとデータを紐付ける
10. 公開されてから三年経たず、更新されていないソフトウェアは信頼できない
section3
→ この論文に載るためには再現性を取れるような指導をしなければならない
→ 結果優先主義が緩和される
→ PIもラボメンバーも再現性が取れることを重視して働きかける
→ 再現性に問題がある論文は論外というスタンスになる
論文誌として強くなるには