NCBI kullanarak Galaxy’e Veri Yükleme
Hazırlayanlar: Halit Kemal Aydın, Şahin Öztürk, Tolga Leyla
Tools bölümünde “Get Data” ya tıklayarak “NCBI Accession Download” seçeneğine tıklarız.
NCBI tabanlı veri yükleme sayfasına ulaşırız. Yüklenmek istenen verinin ID si yazmak için ilk seçeneği “Direct Entry” yaparız.
“Direct entry” seçeneğini seçtikten sonra, NCBI’dan yüklemek istediğimiz verinin/genin ID’sini “ID list” kısmına yazarız. Burada“İnsan Isı Şok Protein Genleri” ID’si kullanılmıştır.
ID’yi girdikten sonra galaxy veriyi önce tanımlamaya sonra indirmeye ve ardından yüklemeye başlayacaktır.
Tüm işlemler gerçekleştikten sonra 2 dosya inecektir. Bunlardan ilki olan “Log” dosyası bize hangi ID ye sahip verinin indirildiğini ayrıca indirme sonucunda bir hata olup olmadığı bilgisini verir.
İkincisi olan “Downloading Files” dosyası yani indirilenler dosyasının içinde ise yüklemek istediğimiz veri dosyası bulunur. Göz ikonuna tıklayarak veriyi görüntüleyebilirsiniz.