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O que é o darwinismo?

Ernst Mayr (Universidade Harvard)

Conjunto de cinco teorias principais:

Mudança perpétua
Descendência comum
Multiplicação de espécies
Gradualismo
Seleção natural

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Fundamentos básicos de análises filogenéticas

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Atividade prática computacional:

Análise do Gene COI em Populações de Peixes

Objetivo: Analisar sequências do gene COI de diferentes populações de uma espécie de peixe para identificar variações genéticas e inferir processos microevolutivos, como seleção natural e migração.

Coleta de sequências:

Banco de dados: Acesso o NCBI Genbank
Busca: Pesquise por sequências do gene COI de uma espécie específica de peixe, como Gadus morhua (Bacalhau do Atlântico), Serrasalmus rhombeus (Piranha), Thunnus albacares (Atum) e Pomatomus saltatrix (Anchova)
Filtragem: Selecione sequências provenientes de diferentes localidades geográficas.

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Síntese Moderna da Evolução (ou Neodarwinismo)

Processo: Microevolução

(Mudanças no conteúdo gênico de uma população através das gerações. Variação genética e mudança dentro da espécie)

Deriva Genética

(flutuação aleatória na frequência de alelos de uma geração para próxima)

Mutação

(Geram novos alelos)

Migração

(Movimento de indivíduos entre populações diferentes.

Introduz e remove alelos)

Seleção Natural

(Certos fenótipos têm mais sucesso reprodutivo do que outros)

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Análises filogenéticas

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Comparação da diversidade genética usando o gene COI

Em 2003, um fragmento padronizado de 658 pb do gene da subunidade I da citocromo C oxidase mitocondrial (cox1 ou COI) foi proposto como um marcador universal para identificação de espécies – para ser usado como um “código de barras de DNA” marcando qualquer táxon animal.

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Barcode of Life Data Systems (BOLD)

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Análises filogenéticas: fluxo de análises de dados

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Desafio da aula de hoje: Reconstruir computacionalmente a árvore da vida

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