1 of 11

Бацили Чорного моря як джерело протитуберкульозних метаболітів

Зінченко О.Ю.

к.б.н., зав. кафедри мікробіології, вірусології та біотехнології, Васильєва Н.Ю.

к.б.н., доц. кафедри мікробіології, вірусології та біотехнології

2 of 11

Туберкульоз в Україні

1 місце за захворюваністю у Європі

Близько 40% - мультирезистентний

Погіршення ситуації під час війни

3 of 11

Мета

визначити здатність споротвірних бактерій, виділених з донних осадів Чорного моря,

до продукування антимікробних речовин з потенційною протитуберкульозною активністю

4 of 11

Матеріали та методи

Матеріал:

Досліджувані культури - 117 штамів споротвірних бактерій, виділених з глибини від 880 до 1537 м з різних ділянок Чорного моря.

Тест-штам Mycobacterium smegmatis mc2 155

Методи: MABA - мікропланшетний тест з Alamar blue (резазуринова проба), повногеномне секвенування (Illumina), біоінформатичний аналіз: ідентифікація штамів TYGS, визначення наявності біосинтетичних генних кластерів, відповідальних за продукування антимікробних речовин (база AntiSMASH).

5 of 11

Партнери

Dr. Jose Dominguez,

Institute Germans Trias I Pujol, University of Barcelona

Cynthia Chibani,

Kiel University

6 of 11

РЕЗУЛЬТАТИ ДОСЛІДЖЕНЬ

7 of 11

Результати дослідження

МАВА-тест

Пригнічення росту

тест-культури

8 of 11

Виявлені в геномах активних штамів BGC

Штам

Глибина, м

Кількість виявлених BGC

З них ідентифі-ковано

Сполуки з відомою �активністю щодо мікобактерій

Сполуки з �потенційною активністю

Shouchella clausii 07В

1499

3

3

​

фенгіцин, ліхенізин, �бацилібактин

Bacillus licheniformis 055А

888

13

6

​

фенгіцин, ліхенізин

Bacillus licheniformis 240С

1537

13

6

цвіттерміцин A

фенгіцин, ліхенізин

Bacillus viscosus 216C

1537

25

3

​

фенгіцин, ліхенізин, �пліпастатин

Bacillus pumilus 048D

1537

14

7

цвіттерміцин A

фенгіцин, ліхенізин, �бацилібактин

Bacillota 1220С

1537

6

6

бацилізин

бацилібактин

9 of 11

Результати дослідження

Теплова карта поширення кластерів біосинтезу відомих антимікробних метаболітів у геномах досліджених бактерій

10 of 11

ВИСНОВКИ

  • Досліджені культури були ідентифіковані як представники 19 видів, що належали до 9 родів.
  • За допомогою MABA-тесту виявлено 6 культур, метаболіти яких здатні пригнічувати ріст модельного організму Mycobacterium smegmatis mc2 155.
  • У геномах активних штамів ідентифіковано біосинтетичні генні кластери, що кодують два метаболіти з відомою активністю щодо мікобактерій (цвіттерміцин А та бацилізин) та кластери біосинтезу 4 сполук, які мають потеційну протитуберкульозну активність – фенгіцин, ліхенізин, бацилібактин, пліпастатин.
  • Загалом у геномах досліджених бактерій виявлено кластери біосинтезу 38 антимікробних сполук, серед яких 9 (дифіцидин, бацилізин, бацитрацин, субтилін, мерсацидин, плантазоцилін, боттроміцин А2, турінцин Н, цвіттерміцин А) мають відому активність щодо мікбактерій.
  • Ідентифіковано кластери біосинтезу 10 метаболітів з широким спектром антимікробної активності (фенгіцин, сурфактин, ліхенізин, пліпастатин, каліхеаміцин, кіджаміцин, латероцидин, синехобактин, петробактин, бацилібактин), що можуть мати потенційну активність щодо мікобактерій.
  • Найпоширенішими були кластери біосинтезу фенгіцину. Найбільшу кількість кластерів ідентифіковано у Priestia megaterium (20).

​

11 of 11