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BIODBSx2

Bases de datos de

Biobases de datos

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2

LABORATORIO BIOINFORMACION

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3

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Bioinformación

2021

Layla Michán

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https://orcid.org/0000-0002-5798-662X

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Intro

Ejemplos

DBSx2

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Resumen

Una buena forma de entender los BIOdatos es abordándolos desde un enfoque multidisciplinario, por un equipo constituido por biólogos, computólogos, matemáticos, y actuarios que estudiamos

Las bases de datos de ciencias de la vida, las ontologías y las herramientas asociadas (BiodDBS) para descubrir los detalles sobre ellas.

Uno de los temas centrales de este proyecto es entender y usar las bases de datos de bases de datos, lo que constituye el objeto de estudio del proyecto BIODBSX2

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Intro

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Bases de datos de

Biobases de datos

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Bases de datos de

Biobases de datos

⛲️Cuáles fuentes de bases de datos de biociencias hemos reunido

⛲️Qué tecnología usan

⛲️Cuántos registros tienen

⛲️Cómo clasifican las bases de datos

⛲️Cuántas están inactivas

⛲️Cuáles están en @wikidata

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Bases de datos de

Biobases de datos

⛲️#BIODBSx2 En Twitter

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Bases de datos de

Biobases de datos

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Uniprot

  1. Wikidata
  2. Database commons
  3. Scicrunch
  4. Biotools
  5. Bioregistry
  6. Nucleic Acid Research Database
  7. Re3data

11

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Biodiversity Heritage Library (BHL)

  • Wikidata
  • Database commons‼️❌
  • Scicrunch
  • Biotools ❌
  • Bioregistry ❌
  • Re3data ❌

12

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Fuentes

13

Mayo 2022

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The 2022 NAR DB

& online molecular biology DB

Daniel J. Rigden, &

Xose M. Fernández

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NAR Database 2022

15

15 categorías

42 subcategorías

Total 57

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Registro NARdb

Nombre

Número

url

Fuente

Categorías

Contacto

Autores

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Clasificación NAR

17

115

106

88

86

78

76

72

64

63

58

58

57

51

51

45

41

35

34

31

31

31

29

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28

24

24

23

23

23

22

21

21

21

20

20

20

20

20

17

14

14

14

14

12

8

8

8

5

3

3

2

2

2

1

1

Suma total

1787

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Curación tipo de base

18

1

2

3

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19

https://ngdc.cncb.ac.cn/databasecommons/help

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Wikidata

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Bioregistry

21

Deprecated

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Bioregistry

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Bioregistry

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https://bioregistry.io/summary

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Bioregistry

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https://bioregistry.io/summary

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Bioregistry

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https://bioregistry.io/summary

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Bioregistry

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https://bioregistry.io/related

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ARTICULO VISUALIZACIÓN DE LAS FUENTES DE BASES DE DATOS

LABORATORIO DE BIOINFORMACIÓN

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Biodatos

Bioinformación

Bioconocimiento

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PORTAL, MATERIALES Y RECURSOS EN CONSTRUCCIÓN Y ACTUALIZACIÓN CONSTANTE

Dada la rápida evolución de los recursos electrónicos y como consecuencia de la importancia de la inmediatez de la información científica este portal está en constante actualización.

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AGRADECIMIENTOS

Este documento es causa y efecto de mi práctica académica, es producto de los procesos de enseñanza-aprendizaje compartido con mis alumnos, disertación con mis colegas y experimentación compartida con mis colaboradores, a todos ellos agradezco su colaboración. Cualquier error, omisión o inexactitud es solo mi responsabilidad.

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Esta obra está bajo una Licencia Creative Commons Atribución 4.0 Internacional.

Layla Michán. 2021.