NMR metoda pro analýzu včelího metabolismu a včelích produktů
Doc. Ing. Jaroslav Havlík, Ph.D.
havlik@af.czu.cz
NMR = nukleární magnetická rezonance
4
Courtesy: Agilent
Steady state
Excitation after RF pulse
Relaxation
5
Courtesy: Agilent
Steady state
Excitation after RF pulse
Relaxation
1. NMR analýza pro pochopení vztahů mezi zimními a letními včelami
Letní včely žijí 15 až 38 dní a jsou v úlu od března do pozdního srpna
Zimní včely žijí 140 až 320 dní a jsou v úlu od srpna do jara
Winter bees diminish & population of summer bees grow
Transition 2
Transition 1
Summer bee
Winter bee
Spring
Summer
Autumn
Winter
Actively collecting food,
Colony growth
Brood rearing
begins
Overwintering
Summer bees & winter bees
Co-existing
Winter bees begin to emerge
Fluri et al., 1982; Mattila et al., 2001; Doke et al., 2015
Mar
Apr
May
Jun
Jul
Aug
Sep
Oct
Nov
Dec
Jan
Feb
Vitellogenin, Juvenile hormone
Immunity
Stress resistance
Antioxidant function
Nutrient status
V NMR spektrech metanolových extraktů včelích těl bylo identifikováno celkem 36 metabolitů: Bylo nalezeno 13 aminokyselin, 4 karboxylové kyseliny, 5 aminů, 3 sloučeniny obsahující cholin, 3 nukleosidy, 2 nukleotidy, 2 monosacharidy, 2 disacharidy, 1 nukleobáze a S-methyl-L-cysteinsulfoxide (SMCSO)
PCA
Zasazení metabolitů do známých metabolických drah dlouhověkosti
2. NMR analýza pro pochopení vztahů mezi zimními a letními včelami
Cílem této studie bylo
1.AMP, 2.NAD+, 3.Inosine, 4.Adenine, 5.Histidine, 6.Uridine, 7.Phenylalanine, 8.Sucrose, 9.Glucose, 10.Trehalose, 11.sn-glycero-3-phosphocholine, 12.Fructose, 13.Proline, 14.O-phosphocholine, 15.unknown, 16.unknown, 17.Choline, 18.β-alanine, 19.Dimethylsulfone, 20.Malonate, 21.Putrescine, 22.Creatine, 23.Lysine, 24.Asparagine, 25. unknown, 26.unknown, 27.Glutamine, 28.Succinate, 29.Suberate, 30.Acetate, 31.Alanine, 32.Threonine, 33.Valine, 34.Isoleucine, 35.Leucine, 36.Glycine
Apis mellifera
Co se děje ve včelím těle
A NMR spectrum of honey bee’s body
By Metaboanalyst.ca
Log transformation, Auto scaling
Distance measure: Euclidean
Clustering algorithm: Ward
Group averages
Metabolite↓
Month
Nov
Dec
Jan
Feb
May
Jun
Jul
Apr
Oct
Mar
Aug
Sep
January
February
March
April
May
June
July
August
September
October
November
December
Beta-alanine
Hierarchická klastrová analýza
Transition1
N=18
Summer
N=12
Transition2
N=18
Winter
N=18
Unit: mg/honey bee, ± SE
Sacharidy
Dynamika metabolitů v průběhu roku
Transition1
N=18
Summer
N=12
Transition2
N=18
Winter
N=18
Transition1
N=18
Summer
N=12
Transition2
N=18
Winter
N=18
Unit: mg/honey bee, ± SE
Esenciální aminokyseliny
Ostatní
Transition1
N=18
Summer
N=12
Transition2
N=18
Winter
N=18
Unit: mg/honey bee, ± SE
Honey bee vitellogenin model
Harwood et al 2017
GPC: sn-glycero-3-phosphocholine
Cho: Choline, PCho: O-phosphocholine
PC: Phsphatidylcholine
Phosphatidylcholine biosynthesis
Iorio et al 2005
Cholin
Transition1
N=18
Summer
N=12
Transition2
N=18
Winter
N=18
Unit: mg/honey bee, ± SE
Transition1
N=18
Summer
N=12
Transition2
N=18
Winter
N=18
Nukleosidy a nukleotidy
S-methyl L-cystein sulfoxide (SMCSO)
3. NMR metoda pro určení botanického původu medu
?
Botanický původ – PCA, OPLS-DA
PCA – řepka, akát,
PC1 18,5 % variace
PCA – řepka, akát, medovice,
PC1 26,6 % variace
OPLS-DA řepka, akát,
Q² = 0,59 a R² = 0,75
Rozdíly řepkový a akátový med
Komponentní zátěže (loadings) řepkového a akátového medu z OPLS-DA analýzy promítnuté do auto-normalizovaného NMR spektra, *nejistá identifikace
Akátový med
Řepkový med
Závěr
Okamžik zrození včely