MÔ HÌNH MÁY HỌC TIÊN ĐOÁN
SỐC DENGUE Ở TRẺ EM
Nguyễn Ngọc Rạng , Lâm Thị Huệ, Phạm Văn Hưng , Bùi Quang Nghĩa, ĐHYD Cần Thơ
MỞ ĐẦU
+ Tiên đoán sốc sớm, can thiệp kịp thời giảm tử vong và biến chứng
+ Mô hình truyền thống: hạn chế
+ Mô hình máy học (Machine learning): tiên đoán tốt hơn
1- Thu thập dữ liệu
2- Chuẩn bị dữ liệu, phân chia 2 sets
3- Chọn mô hình MC KNN, RF, NB, NNA, SVM…
4- Huấn luyện mô hình Cross-validation
5- Đánh giá mô hình AUROC, Accuracy, F1 score…
6- Tinh chỉnh tham số (hyperparameter tuning)
7- Đưa ra dự đoán
CÁC BƯỚC XÂY DỰNG MÔ HÌNH MÁY HỌC
CHUẨN BỊ DỮ LIỆU (PREPROCESSING)
+ Xử lý dữ liệu thiếu (Missing Data)
+ Xử lý dữ liệu nhiễu (trị ngoại lai)
+ Chuẩn hóa (Normalization/Standardization) center, scale
+ Cấu trúc dữ liệu
+ Chia dữ liệu (Data Splitting): tập huấn luyện và tập kiểm tra
+ Lưu dữ liệu : csv, rda…
Accuracy
Recall
Precision
PHÂN CHIA 2 TẬP: HUẤN LUYỆN VÀ KIỂM TRA
CHỌN MÔ HÌNH MÁY HỌC
RANDOM FOREST NEURON NETWORK XGBOOST, ADABOOST
CHỌN MÔ HÌNH MÁY HỌC
HUẤN LUYỆN MÔ HÌNH ( R )
HUẤN LUYỆN MÔ HÌNH (PYTHON)
HUẤN LUYỆN MÔ HÌNH
TINH CHỈNH MÔ HÌNH
ĐÁNH GIÁ MÔ HÌNH
CÁC CHỈ SỐ ĐÁNH GIÁ HIỆU SUẤT
ĐƯỜNG CONG ROC
Bảng 1. Đặc điểm cơ bản 2 nhóm sốc và không sốc
KẾT QUẢ
Bảng 2. Hiệu suất các mô hình máy học ở tập kiểm tra (test set)
KẾT QUẢ
Bảng 3. Hiệu suất các mô hình máy học ở tập huấn luyện (training set)
KẾT QUẢ
Đặc trưng quan trọng (Feature importance)
KẾT QUẢ
Biểu đồ Nomogram
Albumin (100) +AST (50) + Platelet (55)= 205 points ( Sốc: 80%)
KẾT QUẢ
Calibrate biểu đồ nomogram
KẾT QUẢ
BÀN LUẬN
Phân tích gộp có 18 YT liên quan đến sốc dengue
Tuổi, giới nữ, TC thần kinh, nôn ói, đau bụng, gan to, XHTH , HCT, hạ albumin, hạ protein, dịch ổ bụng, dịch màng phổi, giảm tiểu cầu, AST, ALT, APTT, ALT, fibrinogen, tái nhiễm, DEN-2
Huy NT et al. Factors associated with DSS: a systematic review and meta- analysis. PLoS Negl Trop Dis. 2013
BÀN LUẬN
HẠN CHẾ
“Mô hình dựa vào máy học có khả tiên đoán tốt HCSD ở trẻ em điều trị nội trú. Biểu đồ trực quan gồm 5 YTNC (albumin, APTT, fibrinogen, AST, tiểu cầu) giúp cho các nhà lâm sàng phát hiện sốc SXH sớm”
KẾT LUẬN
Xin cảm ơn