ラップアップ
プロジェクト名（担当者）
課題
対応
今後
TogoID - EnsemblPlants など（TogoID group）
課題
対応
問題
今後
TogoID-config (DBCLS)
TogoVar開発とJVar連携 (片山・藤澤・開発メンバ)
RDF-config (西澤・片山)
複数のconfigを組み合わせたSPARQLの生成
rdf-config --config config/nbrc config/pgdbj
--join nbrc:taxid=pgdbj:taxon
--query nbrc:Culture nbrc:label pgdbj:Group pgdbj:identifier pgdbj:description nbrc:taxid pgdbj:taxon
TogoDX-TPP/連携検索システム（平川、藤澤、守屋、信定）
課題
対応
確認
今後
Ortholog/Geneの課題について情報共有（藤澤、平川、櫛田、千葉、KNApSAcK RDF/TogoDX-TPP開発メンバー）
課題
対応
今後
Ponpon API（山中）
MetaStanza (片山・川島・守屋・PENQE・えにしテック)
LODチャレンジ2021 データ活用部門 優秀賞 授賞式 (2022-03-13) で発表
→ 発表スライド
全体連絡
今月のSPARQL
募集中
TODO
以下はSPARQLthon113のコピー
（書き換えたら全体連絡のスライドより前の方にスライドを移動してください）
SPARQL support（守屋）
判断できない（けど別にいいや）
Endpoint browser
SRA Search連携（仲里、大田、大石、藤澤）
課題
対応
今後
SPARQL-GA（石井・守屋・片山）
DEFINE sql:select-option "order"
PREFIX rdfs: <http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#>
PREFIX ncbigene: <http://identifiers.org/ncbigene/>
PREFIX dct: <http://purl.org/dc/terms/>
PREFIX obo: <http://purl.obolibrary.org/obo/>
SELECT DISTINCT ?gene ?type ?refseq
WHERE {
?gene obo:so_part_of ?refseq .
?gene dct:identifier "BRCA1" .
?gene rdfs:seeAlso ncbigene:672 .
?gene rdfs:subClassOf ?type .
}
十数秒
DEFINE sql:select-option "order"
PREFIX rdfs: <http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#>
PREFIX ncbigene: <http://identifiers.org/ncbigene/>
PREFIX dct: <http://purl.org/dc/terms/>
PREFIX obo: <http://purl.obolibrary.org/obo/>
SELECT DISTINCT ?gene ?type ?refseq
WHERE {
?gene rdfs:seeAlso ncbigene:672 .
?gene rdfs:subClassOf ?type .
?gene obo:so_part_of ?refseq .
?gene dct:identifier "BRCA1" .
}
１秒以下
RDF-config（片山・西澤）
課題
対応
TogoDX-SPARQList（守屋・片山）
課題
対応
今後
jPOSTbd RDF コンバータ（田中・守屋）
課題
今日の作業
今後
Ponpon API（山中）
SRA Search連携（仲里、大田、大石、藤澤）
課題
対応
今後
SARS-CoV-2可視化（片山、中川、藤澤）
課題
対応
今後
MetaboBank（藤澤、長崎、福島）
TogoStanza（えにしテック・DBCLS）
MetaStanza（PENQE・DBCLS）
RDF-config（片山・西澤）
課題
対応