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用資料找出

下一次最值得補查的地方

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臺灣保育哺乳類資料缺口與補查優先度決策地圖

我們不是在找哪裡沒有動物;

我們在找哪些地方仍沒有被充分看見。

CMGI vNext|Phase 1

稜鏡實驗室|臺南市立家齊高中

圖片:Abu0804(CC BY-SA 3.0)|資料定位:本研究 Phase 1 data lock

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02 / 研究動機

一張紀錄地圖,為什麼不夠?

公開資料中的「沒有看到」,可能有兩種完全不同的原因。

A

真的沒有相關紀錄

資料尚未收錄,或該區目前確實少有可查到的公開紀錄。

B

原本就很少有人觀察

可達性、季節、調查資源與來源偏誤,都可能讓同一個地方留白。

所以,我們不直接把資料空白翻譯成「沒有動物」。

臺灣穿山甲|Manis pentadactyla pentadactyla

資料:TBIA;本研究整理|圖片:Licheng Shih(CC BY 4.0)

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研究問題 / RESEARCH QUESTION

我們真正想回答的是:下一次,應該先去哪裡補查?

不是預測動物存在,而是把不均勻的觀察證據轉成可驗證的補查順序。

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→

→

01

看見多少

觀察覆蓋度(Observation Coverage)

先判斷每一格有多少觀察基礎。

02

不知道多少

觀察努力校正缺口(Effort-adjusted Gap)

在相近觀察條件下,比較觀察值與期望值。

03

去哪裡補查

保育哺乳類補查優先度指數(CMGI)

讓高潛力且高缺口的地方優先被看見。

SEE → KNOW → DECIDE

研究定位:公開出現紀錄(Occurrence Records)的資料缺口;不等同族群量或棲地存在機率

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資料 / DATA

五類資料與空間骨架,各自回答不同問題

從物種紀錄、分類標準到棲地與可近性資訊,統一放進 5 km 空間框架中分析。

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公開成果皆依資料授權與敏感物種保護規範處理,對外僅呈現聚合網格,不公開原始精準點位。

資料與空間骨架:TBIA、TaiCOL、5 km 陸域網格、保護區/國土利用、步道/道路|系統角色不等於直接計分

資料/空間來源

系統角色

實際用途

TBIA

主物種紀錄來源

年度分布、紀錄密度、時間缺口與物種出現紀錄分析

TaiCOL

物種分類與名稱標準

統一學名、中文名與 taxonID,避免跨資料來源名稱不一致

5 km 陸域網格

統一空間分析單位

將不同來源資料聚合至相同尺度,兼顧分析一致性與敏感物種位置保護

保護區/國土利用

棲地與保育環境資訊

提供棲地潛力、保育相關性與空間背景資訊;支援 Potential 相關分析

步道/道路

補查可近性資訊

協助判斷實地補查的可達性、調查入口與現場條件,作為補查決策輔助資訊

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資料處理 / DATA PIPELINE

先建立完整臺灣,再把紀錄放進固定 5 km 網格

原始點位無法直接比較;固定分析母體,才能保留真正的零紀錄格。

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→

→

→

→

RAW

1,600,520

原始哺乳類紀錄

CLEAN

1,577,040

座標與分析範圍 QA 後

DEDUPE

1,577,037

確定性去重後

GRID

1,712

固定 5 km 陸域網格

AGGREGATE

8,560

5 個年層的格網單元

為什麼先建完整網格?

若只從有紀錄的點位開始,中央山脈與低紀錄區會從分析中消失。

public-safe aggregate

輸出只有 5 km 網格、年層與統計摘要;不公開原始精準點位。

資料:CMGI vNext Phase 1 ingestion and deduplication QA;固定 5 km 分析母體

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方法一 / METHOD 1

Observation Coverage:先問每個網格「被看了多少」

Mᵢ 是全部哺乳類紀錄數;它是 observation effort proxy,不是實際調查時數。

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先做什麼

先數每一格的全部哺乳類紀錄 Mᵢ。數量越多,代表這格被觀察、回報或被資料系統捕捉的機會通常越高。

Eᵢ = log(1 + Mᵢ)

Coverageᵢ = scale₀₋₁(Eᵢ)

•

① 先數 Mᵢ:全部哺乳類紀錄

這是每一格「被看多少」的共同起點。

•

② 再算 Eᵢ = log(1 + Mᵢ)

壓縮熱門地點長尾,避免少數超大量紀錄主宰尺度。

•

③ 最後轉成 0–1 相對覆蓋度

0 接近低觀察基礎;1 接近相對高觀察基礎。

0

1

低觀察基礎

相對高觀察基礎

方法界線:observation effort proxy,不是實際調查時數或相機陷阱日|下一步:用準二項平均模型(Model F)估計 μᵢ

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方法銜接 / METHOD BRIDGE

從「被看多少」到「應該看到多少」

先建立觀察基礎,再用準二項平均模型(Model F|最終採用)估計期望值,最後與實際紀錄比較。

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→

→

→

→

被看多少

Mᵢ

全部哺乳類紀錄�這裡被看多少

建立基礎

Eᵢ

log(1 + Mᵢ)�壓縮並標準化

準二項平均模型

(Model F)

μᵢ

在相近觀察基礎下�估計合理期望

實際看到

Yᵢ

實際保育類紀錄�這裡看到多少

比較

μᵢ − Yᵢ

期望高於實際時�形成正短缺

三個符號,一句話記住

Mᵢ 是觀察基礎;μᵢ 是模型期望;Yᵢ 是實際觀察。

台上講法

先看多少 → 再算應有多少 → 最後看實際少了多少。

直覺橋接:Mᵢ → 建立觀察基礎 → 準二項平均模型(Model F)估計 μᵢ → 與實際 Yᵢ 比較

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方法二 / METHOD 2

準二項平均模型(Model F|最終採用):在相近觀察基礎下估計期望 μᵢ

本研究最終採用的期望值估計模型;回答「應該看到多少紀錄」,不是預測物種是否存在。

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先抓住它的唯一任務

以每格的觀察基礎與模型變數估計期望值 μᵢ;接著才把 μᵢ 與實際 Yᵢ 比較,形成努力校正後的短缺。

•

工作:估計 μᵢ

在相近觀察基礎下,估應看到多少保育類紀錄。

•

平均結構

準二項平均模型(Model F|最終採用)

Quasi-Binomial Mean Model

•

離散修正

Grouped Pearson overdispersion correction.

•

基準對照

負二項迴歸模型(Model A|基準比較)

候選比較後不進入正式 CMGI 計算鏈

Mᵢ → 準二項平均模型 → 合理期望

Quasi-Binomial Mean Model|Grouped Pearson Overdispersion Correction

Mᵢ

第 i 格的觀察努力代理

μᵢ

準二項平均模型(Model F)估計的合理期望

Yᵢ

第 i 格的實際保育類紀錄

φ

群組 Pearson 過度離散修正

準二項平均模型(Model F)已選定|負二項迴歸模型(Model A)作基準比較|Predictive validity not established

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方法二 / METHOD 2

一格看懂:期望 6、實際 2,為何形成正短缺?

有觀察基礎時,若實際 Yᵢ 低於期望 μᵢ,就形成 effort-adjusted positive shortfall。

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完整故事|Mᵢ = 120 → μᵢ = 6.0 → Yᵢ = 2

→

→

① 這格被看多少

Mᵢ = 120

已有 120 筆全部哺乳類紀錄

② 模型認為應有多少

μᵢ = 6.0

理論上應有 6 筆保育類紀錄

③ 實際看到多少

Yᵢ = 2

實際只有 2 筆保育類紀錄

6.0 − 2 = 4:期望高於實際

→ 正短缺(effort-adjusted positive shortfall)

這不是「少了 4 隻動物」;而是模型期望與公開紀錄之間的相對短缺訊號。

示意:Observed < Expected → 努力校正正短缺提高

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解讀原則 / INTERPRETATION

同樣是 0 筆,觀察基礎不同,意義就不同

先看 Mᵢ 是否足以比較,再看 Yᵢ 是否低於模型期望 μᵢ。

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GRID A

Yᵢ = 0|保育類

Mᵢ = 1|全部哺乳類

證據不足:先不排名

只看過 1 筆全部哺乳類紀錄,0 筆保育類不足以支持缺口判讀。

GRID B

Yᵢ = 0|保育類

Mᵢ = 300|全部哺乳類

可比較:再看 μᵢ

已有 300 筆全部哺乳類紀錄,0 筆保育類才有比較意義。

同樣是 Yᵢ = 0,Mᵢ 不同,證據強度就不同:先判斷可比較,再談缺口高低。

判讀規則:Evidence Status 先於 Gap Ranking;觀察門檻目前仍為 provisional

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決策指標 / DECISION INDEX

CMGI vNext=100 × Potential × Gap

只有潛力與資料缺口同時偏高,網格才會進入較前面的補查順序。

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潛力分數(Potential Score)

0.44H + 0.31I + 0.25C

H

棲地代理(Habitat Proxy)

已接

I

多物種交集(Multi-species Intersection)

已接

C

保育相關性(Conservation Relevance)

已接

A

調查可行性(Survey Feasibility)

決策輔助

缺口分數(Gap Score)

0.40D + 0.25T + 0.20S + 0.15Q

D

努力校正正短缺|準二項平均模型(Model F)

已鎖定

T

時間缺口(Temporal Gap)

已接

S

來源偏誤缺口(Source Bias Gap)

已接

Q

連續性缺口(Continuity Gap)

已接

CMGI vNext = 100 × Potential Score × Gap Score

調查可行性資訊已接入系統,作為決策輔助、不直接計分;CMGI vNext 僅作補查排序。

CMGI vNext 計分結構|準二項平均模型(Model F)驗證結果|步道/道路等可近性資訊作補查決策輔助、不直接計分

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模型驗證 / MODEL VALIDATION

準二項平均模型的三組驗證:誤差與校準是否穩定?

分別以時間、縣市與空間區塊切分資料,檢查模型離開原始資料後是否仍維持合理表現。

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驗證誤差(RMSE)

越低代表 Observed 與 Expected 的整體誤差越小

觀察值/期望值(Observed / Expected)

O/E Calibration|O/E = Observed / Expected

模型驗證完成 ≠ CMGI 已具有預測效度

這三組驗證支持準二項平均模型(Model F)作為期望值估計工具;但 CMGI 的回溯辨識力仍未達完整預測效度門檻,因此目前用途仍是補查優先排序與決策支援,而不是物種存在或移動方向預測。

準二項平均模型(Model F)validation|Temporal OOS/County-block CV/Spatial-block CV|Expected estimation only

時間外樣本|未參與建模的時間資料

縣市區塊|檢查離開原地理區域後的表現

空間區塊|降低鄰近樣本相似造成的樂觀偏誤

時間外樣本

Temporal OOS

275.50

縣市區塊

County-block CV

233.43

空間區塊

Spatial-block CV

254.48

0

100

200

300

0.990

1.000

1.020

1.040

1.060

1.080

1.090

時間外樣本

縣市區塊

空間區塊

1.077 (+7.7%)

1.017 (+1.7%)

1.033 (+3.3%)

O/E = 1.000|理想校準位置

RMSE 衡量 holdout 中期望值與實際值的整體誤差;絕對數值仍需配合資料尺度與其他驗證指標解讀。

O/E = 1:量級一致|> 1:Observed 略高|< 1:Observed 略低

三組 O/E 均接近 1,整體量級沒有明顯系統性偏離。

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驗證 / VALIDATION

完整驗證摘要:模型驗證完成,CMGI 回溯辨識仍有限

工程可重現性、準二項平均模型(Model F)選定與三組切分驗證均已完成;CMGI 回溯辨識仍未達預測效度門檻。

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工程驗證|完成

137 PASS

自動化測試

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位元一致成果

科學結論|功能成立,預測效度有限

準二項平均模型(Model F)經時間與空間切分驗證;CMGI 回溯辨識力未達門檻。

目前僅作補查優先排序,不作物種存在機率預測。

準二項平均模型(Model F)validation:Temporal/County-block/Spatial-block|CMGI retrospective limitation retained

項目

方法/驗證

結果

定位

準二項平均模型

(Model F)

Quasi-Binomial Mean Model

+ Grouped Pearson Overdispersion

最終採用 · violations 0

模型驗證完成

負二項迴歸模型

(Model A)

Negative Binomial Regression

比較完成

基準比較

Temporal OOS

時間外樣本驗證

RMSE 275.50 · O/E 1.077

完成

County-block CV

縣市區塊驗證

RMSE 233.43 · O/E 1.017

完成

Spatial-block CV

空間區塊驗證

RMSE 254.48 · O/E 1.033

完成

CMGI 回溯辨識力

2020–2024 holdout

整體未達預測效度門檻

補查排序/決策支援

第一層|工程與準二項平均模型(Model F)驗證

第二層|CMGI 回溯辨識力

通過工程驗證,不等於通過科學預測驗證。

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展示 / WEBGIS DEMO

網站把模型變成一張可操作、可追問的決策地圖

正式站可切換年層與圖層;選取 5 km 網格後,右側直接呈現分數、Observed vs. Expected、主要缺口與補查建議。

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觀眾會看到三件事

01

切換年層與圖層

比較不同時期的觀察覆蓋度(Observation Coverage)與 CMGI。

02

點選一個 5 km 網格

查看資料狀態(Data Status)、觀察值與期望值(Observed vs. Expected)。

03

追問為什麼優先

看到主要缺口、可說與不可說的範圍,以及建議的現地補查方法。

正式站實際截圖|1600 × 900

Production WebGIS:wild-traces.vercel.app/map|2020–2024|CMGI vNext|selected grid

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研究結論 / FROM DATA TO PARTICIPATION

CMGI 不是答案,而是一個讓保育更容易被參與的起點

這不是經權威機構認證的標準模型,而是本研究首次公開的探索性補查優先度指標;目前尚未建立完整預測效度。

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CMGI vNext|exploratory prioritization|public-safe 5 km grids|ARK: ark:/35232/d1livqy0

1|零散紀錄

2|物種 × 年份

3|環境圖層

4|5 km 聚合網格

5|候選補查區

2005 2015 2024

棲地 · 保護區

一筆紀錄,只是一個點;

當年份、物種與環境圖層疊在一起,

動物的「觀察足跡」才逐漸浮現。

而是協助判斷「哪裡值得再去看看」

我們不是要用模型取代野外調查,而是希望讓更多人知道:下一次,可以往哪裡看。

不是預測「牠在哪裡」

​

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APPENDIX A1

資料清理 :每一筆排除都有可追溯原因

附錄用於回答資料量、排除規則與 retained corpus 的追問。

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01

原始紀錄

1,600,520

TBIA Mammalia raw

02

無效 WGS84

−8,218

座標不合法

03

分析範圍外

−15,262

不屬固定陸域母體

04

清理後

1,577,040

座標與範圍 QA 完成

05

完全重複

−3

確定性去重

06

最終保留

1,577,037

所有後續分析共用

RETAINED

CORPUS

保育類

248,859

其他哺乳類

1,328,178

資料快照:phase1-8acac05018ec|ARK: ark:/35232/d1livqy0

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APPENDIX A2

候選模型比較:準二項平均模型已選定,負二項迴歸模型作基準

選模結論與預測效度分開解讀:平均結構已鎖定,但 CMGI 回溯辨識力未通過。

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模型

結構

驗證結果

科學限制

狀態

準二項平均模型

Quasi-Binomial Mean Model

+ Grouped Pearson

Temporal/county/spatial

皆完成

回溯辨識力未通過

最終採用

負二項迴歸模型

Negative Binomial Regression

基準比較完成

不是最終模型

基準比較

其他候選

候選模型組合

比較完成

無更強證據取代準二項模型

archived

負二項迴歸模型(Model A)適合過度離散計數,僅作基準比較;Expected 由準二項平均模型(Model F)估計。

準二項平均模型(Model F)|最終採用|負二項迴歸模型(Model A)|基準比較|Predictive validity not established

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APPENDIX A3

門檻敏感度(Threshold Sensitivity):不要把暫定值藏起來

Minimum M 影響哪些網格可以進入 Observed vs. Expected 比較。

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Minimum M

比較目的

需要回報

風險

目前狀態

M ≥ 1

最大涵蓋

係數 / dispersion / n

證據太薄

待 validation

M ≥ 3

寬鬆門檻

係數 / dispersion / n

不穩定

待 validation

M ≥ 5

目前暫定

係數 / dispersion / n

需驗證

PROVISIONAL

M ≥ 10

中等嚴格

係數 / dispersion / n

樣本減少

待 validation

M ≥ 20

嚴格比較

係數 / dispersion / n

排除過多

待 validation

要比較的不是哪個門檻看起來最好看,而是排序穩定性、尾端行為與空間泛化。

M ≥ 5 僅為 provisional;正式選擇需由 sensitivity report 支持

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APPENDIX A4

缺口轉換已鎖定為 effort-adjusted positive shortfall

以準二項平均模型(Model F)的 Observed vs. Expected 形成主要缺口;用途是補查排序,不是顯著性檢定或存在預測。

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中文名稱(English Name)

核心想法

優點

風險

狀態

皮爾森殘差(Pearson Residual)

依模型變異調整差距

統計尺度一致

極端值敏感

比較

努力校正正短缺(Effort-adjusted Positive Shortfall)

由準二項平均模型(Model F)的

Observed vs. Expected 形成

直接支援補查排序

不等於存在機率

採用

穩定化短缺(Stabilized Shortfall)

加平滑常數抑制爆值

穩定尾端

平滑參數需解釋

比較

離差(Deviance)

比較模型似然差異

模型一致

一般觀眾難解讀

比較

低尾機率(Lower-tail Probability)

觀察值落在低尾的機率

直接量化罕見程度

依模型校準

比較

百分位(Percentile)

依殘差排序轉百分位

跨期比較方便

失去原始尺度

比較

CMGI vNext 使用準二項平均模型(Model F)的努力校正正短缺;模型驗證已完成,但 CMGI 回溯辨識仍有限。

Gap method:準二項平均模型(Model F)effort-adjusted positive shortfall|decision support only

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APPENDIX A5

完整資料血緣(Data Lineage):從 occurrence 到 CMGI

每一層都有可追溯輸入、固定規則、驗證輸出與公開安全界線。

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→

→

→

→

→

→

→

→

→

TBIA

clean

taxonomy

dedupe

5 km grid

period

coverage

準二項平均模型

(Model F)

gap

CMGI

研究資料邊界

不公開原始 occurrence 精準點位;不把 occurrence 當成個體數或真實豐度。公開面只展示 public-safe aggregate。

Data lineage:TBIA → public-safe aggregate → 準二項平均模型(Model F)→ gap → CMGI|ARK: ark:/35232/d1livqy0

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APPENDIX A7

參考資料(References)|資料與方法

主頁簡短標示來源;完整來源集中於附錄與每頁 speaker notes。

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01

野境有跡研究團隊. (2026). CMGI vNext Phase 1 data lock. ARK: ark:/35232/d1livqy0.

02

Taiwan Biodiversity Information Alliance. (n.d.). Occurrence API. https://tbiadata.tw/api/v1/occurrence

03

Taiwan Catalogue of Life. (n.d.). TaiCOL API. https://api.taicol.tw/v1

04

林業及自然保育署. (n.d.). 保育類野生動物名錄. https://data.gov.tw/

05

農業部資料開放平台. (n.d.). 保護區圖資. https://data.moa.gov.tw/

06

國土測繪中心. (n.d.). 行政區與土地利用資料. https://data.gov.tw/

註:準二項平均模型(Model F)已選定且三組驗證完成;CMGI 回溯辨識未通過,僅作補查排序與決策支援。

Appendix|References and method traceability|ARK: ark:/35232/d1livqy0

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APPENDIX A8

影像授權(Image Credits)

動物主視覺皆保留來源與授權,不使用無法追溯的 stock imagery。

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臺灣黑熊

Abu0804. Formosan black bear [Photograph]. Wikimedia Commons. CC BY-SA 3.0.

臺灣穿山甲

Licheng Shih. Manis pentadactyla pentadactyla [Photograph]. Wikimedia Commons. CC BY 4.0.

石虎

SilverSea Design / Chofy Lin. 石虎2 [Illustration]. Wikimedia Commons. CC BY 4.0.

Appendix|Image credits|點擊上方區塊前往野境有跡正式網站