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Principios FAIR

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LABORATORIO BIOINFORMACION

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Laboratorio Bioinformación

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Contenido

  1. Introducción
  2. Principios FAIR
  3. Tipos de FAIR

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Resumen

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BIObits

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Manejo de información científica

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Manejo datos investigación

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Principios FAIR

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Wilkinson, M. D., Dumontier, M., Aalbersberg, I. J., Appleton, G., Axton, M., Baak, A., Blomberg, N., Boiten, J. W., da Silva Santos, L. B., Bourne, P. E., Bouwman, J., Brookes, A. J., Clark, T., Crosas, M., Dillo, I., Dumon, O., Edmunds, S., Evelo, C. T., Finkers, R., Gonzalez-Beltran, A., … Mons, B. (2016). The FAIR Guiding Principles for scientific data management and stewardship. Scientific data, 3, 160018. https://doi.org/10.1038/sdata.2016.18

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FAIR para datos y metadatos

Los principios FAIR se pueden aplicar a distintos objetos producto de investigación

  1. Datos
  2. Metadatos
  3. Sofware
  4. Bases de datos
  5. Vocabularios
  6. Colecciones biológicas
  7. Materiales de entrenamiento

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Proyectos Bioinformación FIR

¿Siguen los principios FAIR?

  1. Bases de datos en biociencias
  2. Estadísticas de Biobases de datos
  3. Fuentes de Biobases de datos

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FAIR para datos y metadatos

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Dimitrova, M., Meyer, R., Buttigieg, P. L., Georgiev, T., Zhelezov, G., Demirov, S., Smith, V., & Penev, L. (2021). A streamlined workflow for conversion, peer review, and publication of genomics metadata as omics data papers. GigaScience, 10(5), giab034. https://doi.org/10.1093/gigascience/giab034

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Flujo de metadatos

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Dimitrova, M., Meyer, R., Buttigieg, P. L., Georgiev, T., Zhelezov, G., Demirov, S., Smith, V., & Penev, L. (2021). A streamlined workflow for conversion, peer review, and publication of genomics metadata as omics data papers. GigaScience, 10(5), giab034. https://doi.org/10.1093/gigascience/giab034

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FAIR Vocabularios

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Cox, S., Gonzalez-Beltran, A. N., Magagna, B., & Marinescu, M. C. (2021). Ten simple rules for making a vocabulary FAIR. PLoS computational biology, 17(6), e1009041. https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1009041

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FAIR Ecosistemas

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Koers, H., Bangert, D., Hermans, E., van Horik, R., de Jong, M., & Mokrane, M. (2020). Recommendations for Services in a FAIR Data Ecosystem. Patterns (New York, N.Y.), 1(5), 100058. https://doi.org/10.1016/j.patter.2020.100058

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FAIR Colecciones de Historia Natural

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Alex Hardisty, Paul Brack, Carole Goble, Laurence Livermore, Ben Scott, Quentin Groom, Stuart Owen, Stian Soiland-Reyes; La refinería de datos de especímenes: un marco de flujo de trabajo canónico y un enfoque de objetos digitales FAIR para acelerar la movilización digital de las colecciones de historia natural. Inteligencia de datos 2022; 4 (2): 320–341. doi: https://doi.org/10.1162/dint_a_00134

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FAIR Materiales de entrenamiento

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Garcia L, Batut B, Burke ML, Kuzak M, Psomopoulos F, Arcila R, et al. (2020) Ten simple rules for making training materials FAIR. PLoS Comput Biol 16(5): e1007854. https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1007854

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FAIR Materiales de entrenamiento

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Garcia L, Batut B, Burke ML, Kuzak M, Psomopoulos F, Arcila R, et al. (2020) Ten simple rules for making training materials FAIR. PLoS Comput Biol 16(5): e1007854. https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1007854

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FAIR Materiales de entrenamiento

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Garcia L, Batut B, Burke ML, Kuzak M, Psomopoulos F, Arcila R, et al. (2020) Ten simple rules for making training materials FAIR. PLoS Comput Biol 16(5): e1007854. https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1007854

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Revisión de las bases de datos para herpetología y los principios FAIR

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PORTAL, MATERIALES Y RECURSOS EN CONSTRUCCIÓN Y ACTUALIZACIÓN CONSTANTE

Dada la rápida evolución de los recursos electrónicos y como consecuencia de la importancia de la inmediatez de la información científica este portal está en constante actualización.

AGRADECIMIENTOS

Este documento es causa y efecto de mi práctica académica, es producto de los procesos de enseñanza-aprendizaje compartido con mis alumnos, disertación con mis colegas y experimentación compartida con mis colaboradores, a todos ellos agradezco su colaboración. Cualquier error, omisión o inexactitud es solo mi responsabilidad.

Esta obra está bajo una Licencia Creative Commons Atribución 4.0 Internacional.

Layla Michán. 2021.