1 of 51

LA FÍSICA DE LA VIDA

Determinació experimental de l’estructura de l’ADN

Nom: Ivet Güell Peruchet

Tutor: Anicet Cosialls Manonelles

Curs: 2022/2023

2 of 51

OBJECTIUS PRÀCTICS:

  1. Modelitzar l’experiment realitzat per Rosalind Franklin mitjançant una molla de bolígraf en lloc de l’ADN i llum làser en lloc de raigs X.
  2. Realitzar 6 experiències relacionades amb els fenòmens de la llum.
  3. Determinar experimentalment la fotografia 51.

OBJECTIUS TEÒRICS:

  1. Estudiar conceptes relacionats amb fenòmens ondulatoris.
  2. Visibilitzar la figura de Rosalind Franklin.
  3. Conèixer la historia de l’ADN.

3 of 51

ROSALIND FRANKLIN

4 of 51

  • Neix el 25 de juliol del 1920 a Londres
  • Quarta de cinc germans
  • Ingresa a Cambridge (18anys) per estudiar Química al “Newman College”
  • 1924 inicia “Yellow Ship” a càrrec de Ronals Norris
  • Tècnica de cristal·lografia al “Laboratorie central des services chimiques de l’État” a París

5 of 51

LA CRISTAL· LOGRAFIA I LA GRAN TROBALLA

6 of 51

Sal sòdica d’ADN timó de cabra

William Thomas Astbury (1898-1961)

ADN cabra

ADN llevat

ADN d’arenque

Cristal·lografia

CRISTAL· LOGRAFIA

7 of 51

Maurice Hugh Frederick Wilkins (1916-2004)

CRISTAL· LOGRAFIA

8 of 51

ADN B ↔ ADN A

CRISTAL· LOGRAFIA

75% hidratació

92% hidratació

9 of 51

Fotografia de difracció de raigs X de tres fibres (18-30 μm de gruix) de NaADN (75%) mostrant la forma cristal·lina A de l'àcid nucleic. La foto va ser presa per Franklin i Gosling després d' una llarga exposició (116 h)

Cristal·lografia

CRISTAL· LOGRAFIA

10 of 51

CRISTAL· LOGRAFIA

  • L'ió Mg2+ no pot jugar el rol de neutralitzar la repulsió electrostàtica entre fosfats negatius veïns.

  • L'ADN està fortament hidratat

  • La gran afinitat de l’ADN (fosfats hidrofílics) han d'estar a l'exterior, no a l'interior de la molècula.

James Watson i Francis Crick

11 of 51

CRISTAL· LOGRAFIA

Pauling, Corey i Branson

Bragg Kendrew i Perutz

Estructura de l’ADN actual

GRUPS FOSFATS

12 of 51

Cristal·lografia

CRISTAL· LOGRAFIA

13 of 51

  • El polímer ADN es troba arreglat en forma d'hèlixs.

  • Els fosfats es troben en l’exterior de l’hèlix a uns 10 Å del seu eix

  • Les bases es disposen cap a l'interior de l'hèlix, són paral·leles i uniformement separades en 3.4 Å entre si (com una pila de plats).

  • El pas de l'hèlix és d'uns 34 Å i, per tant, comprèn uns 10 nucleòtids per volta.

CRISTAL· LOGRAFIA

14 of 51

CRISTAL· LOGRAFIA

15 of 51

CRISTAL· LOGRAFIA

16 of 51

17 of 51

PART PRÀCTICA 1

EXPERIÈNCIES

18 of 51

  • 1. Observar del patró de difracció d’una escletxa.
  • 2. Observar del patró de difracció de la xarxa de difracció.
  • 3. Observar del patró de difracció formant un angle mitjançant dues xarxes de difracció superposades.
  • 4. Determinar experimental de la longitud d’ona de la llum d’un làser.
  • 5. Estimar experimental del diàmetre d’un cabell i del filferro de la molla del bolígraf.

EXPERIÈNCIES

OBJECTIUS

19 of 51

EXPERIÈNCIES

OBSERVACIÓ: PATRÓ DIFRACCIÓ D’UNA ESCLETXA

20 of 51

EXPERIÈNCIES

OBSERVACIÓ: PATRÓ DIFRACCIÓ D’UNA XARXA DE DIFRACCIÓ

21 of 51

EXPERIÈNCIES

OBSERVACIÓ: PATRÓ DIFRACCIÓ MITJANÇANT DUES XARXES SUPERPOSADES

22 of 51

EXPERIÈNCIES

23 of 51

EXPERIÈNCIES

DETERMINACIÓ: LONGITUD D’ONA D’UN LÀSER VERD I VERMELL

1

2

 

 

Diferència de camins:

Si A és un màxim:

24 of 51

EXPERIÈNCIES

DETERMINACIÓ: LONGITUD D’ONA D’UN LÀSER VERD I VERMELL

3

4

25 of 51

EXPERIÈNCIES

DETERMINACIÓ: LONGITUD D’ONA D’UN LÀSER VERD I VERMELL

26 of 51

EXPERIÈNCIES

DETERMINACIÓ: LONGITUD D’ONA D’UN LÀSER VERD I VERMELL

VERDA: (543 ± 30)nm VERMELLA: ( 630 ± 27)nm

27 of 51

EXPERIÈNCIES

DETERMINACIÓ: DIÀMETRE D’UN CABELL I DEL FILFERRO DE LA MOLLA

 

 

 

28 of 51

EXPERIÈNCIES

DETERMINACIÓ: DIÀMETRE CABELL

29 of 51

EXPERIÈNCIES

DETERMINACIÓ: DIÀMETRE DEL FILFERRO

30 of 51

PART PRÀCTICA 2

MODELITZACIÓ DE L’ESTRUCTURA DE L’ADN

31 of 51

MODELITZACIÓ

32 of 51

MODELITZACIÓ

33 of 51

MODELITZACIÓ

34 of 51

MODELITZACIÓ

 

 

 

α d P R

35 of 51

MODELITZACIÓ

36 of 51

MODELITZACIÓ

37 of 51

MODELITZACIÓ

38 of 51

MODELITZACIÓ

 

39 of 51

DETERMINACIÓ

40 of 51

DETERMINACIÓ EXPERIMENTAL DE LA FOTO 51

41 of 51

DETERMINACIÓ

42 of 51

DETERMINACIÓ

43 of 51

DETERMINACIÓ

44 of 51

CONCLUSIONS

  1. S’ha aconseguit modelitzar l'experiment realitzat per Rosalind Franklin utilitzant una molla de bolígraf en lloc d'ADN i llum làser en lloc de Raigs X. L’anàlisi del seu patró de difracció és compatible amb una estructura helicoidal.

  • A partir de les mesures realitzades sobre el patró de difracció de la molla, s’han pogut determinar els seus paràmetres físics amb les condicions corresponents, En són:

- Radi “R”: 0,40cm

  • Pas d’hèlix “P”: (0,97±0,22)cm

  • “d”: (0,94±0,16)cm

  • Angle α: 21º

3. S’ha pogut determinar experimentalment la fotografia 51 i les mesurades obtingudes han estat les següents: - Angle α: 36º - Pas d’hèlix P: 3,4nm - Radi “R”: 0,75nm.

45 of 51

CONCLUSIONS

4. S’ha intentat superposar dues molles de bolígraf per tal d’aproximar-se més a l’estructura real de l’ADN, però el patró de difracció obtingut és molt difícil d’interpretació, i no és compatible amb una estructura de doble hèlix. Caldria que hagués desaparegut el màxim de difracció corresponent a l’ordre m=4.

5. S’ha determinat experimentalment la longitud d’una llum làser vermella i verda amb l’obtenció de λvermell = ( 630 ± 27)nm i ( 543 ± 30)nm respectivament.

6. Ens hem pogut familiaritzar amb la física experimental relativa a diferents fenòmens ondulatoris de la llum com les interferències i difraccions. En són:

  • Els patrons de difracció generats a partir d’una escletxa o bé xarxa varien segons l’angle en que posicionem aquestes darreres.

  • El diàmetre d’un cabell és de: 1,0·10-4m

  • El diàmetre filferro 0,36 cm

7. S’ha intentat donar visibilitat la figura de Rosalind Franklin, que va tenir un paper destacat en el desenvolupament de la biologia molecular: el descobriment de l’estructura de l’ADN.

46 of 51

AGRAÏMENTS

47 of 51

REFERÈNCIES BIBLIOGRÀFIQUES

48 of 51

REFERÈNCIES BIBLIOGRÀFIQUES

49 of 51

REFERÈNCIES BIBLIOGRÀFIQUES

50 of 51

REFERÈNCIES BIBLIOGRÀFIQUES

51 of 51

GRÀCIES!