NT UE1 -
Bioénergétique
15/10/2024
Camille DESCHAMPS, L2 SF
Arthur Baudin, D1
Noor Tassoumt, P2
Milia POYET, P2
PHYSIOLOGIE
ÉNERGÉTIQUE
Petit QCM de début
Dans quel cas les protéines sont-elles mobilisées comme source d'énergie chez l'humain ?
A) Après 24 heures de jeûne.
�B) Lors d'une activité physique modérée.
�C) Lors d'un jeûne prolongé ou en cas de dénutrition.
�D) Après une prise alimentaire riche en glucides.
�E) Lors d'une hypoglycémie.
Petit QCM de début
Dans quel cas les protéines sont-elles mobilisées comme source d'énergie chez l'humain ?
A) Après 24 heures de jeûne. Faux : Ce sont les lipides.
�B) Lors d'une activité physique modérée. Faux : Ce sont les glucides.
�C) Lors d'un jeûne prolongé ou en cas de dénutrition. Vrai
D) Après une prise alimentaire riche en glucides. Faux
E) Lors d'une hypoglycémie. Faux :Ça serait en priorité les glucides.
Les fluxs thermiques, qu’est-ce que c’est ?
Correction:
Quelles sont les différentes formes d'énergie qu’on retrouve chez l’homme?
Les réserves énergétiques de l’organisme?
Quelles sont les différentes formes de stockage énergétique (3) ?
Quelles sont les différentes zones de stockages et d’utilisation de l'énergie?
Les muscles (tous).
3 Zones de stockage préférentielle : Le foie (Glycogène et lipides).
Le tissu adipeux (lipides).
Les ressources seront transportées via la :
Circulation sanguine
Jusqu’au zones d’utilisations: Les cellules.
Les réserves énergétiques de l’organisme?
Quelles sont les différentes formes de stockage énergétique (3) ?
Quelles sont les différentes zones de stockages et d’utilisation de l'énergie?
Les muscles (tous).
3 Zones de stockage préférentielle : Le foie (Glycogène et lipides).
Le tissu adipeux (lipides).
Les ressources seront transportées via la :
Circulation sanguine
Jusqu’au zones d’utilisations: Les cellules.
Ordre de mobilisation des ressources énergétiques
ATTENTION: Il ne faut pas confondre l’ordre de mobilisation avec la taille des réserves énergétiques qui sont dans l’ordre croissant :
Glucide < Protéine < Lipide.
Les filières énergétiques ?
Les filières énergétiques?
Dépenses énergétiques Minimales vs Contingentes
Vie végétative de repos (60%).
Dépenses énergétiques minimales Transports ioniques (20%).
(Elles sont OBLIGATOIRES pour vivre)
Renouvellement des structures (20%).
VS
Thermorégulation.
Digestion.
Dépenses énergétiques contingentes Croissance.
(Elles sont FACULTATIVES) L’exercice.
Quelques définitions clés :
………………………. : Ensemble des transformations chimiques et biologiques qui s'accomplissent dans l'organisme.
……………………….. : Ensemble des processus de dégradation des composés organiques, avec dégagement d'énergie et élimination des déchets. Ceci permet de produire de l'énergie utilisable par l’organisme avec une perte d'énergie sous forme de chaleur.
……………………. : Ensemble des processus de synthèse des composés organiques, avec consommation d'énergie et consommation de substrats. Ceci permet de reconstituer les réserves énergétiques.
Quelques définitions clés:
Le métabolisme : Ensemble des transformations chimiques et biologiques qui s'accomplissent dans l'organisme.
Le catabolisme : Ensemble des processus de dégradation des composés organiques, avec dégagement d'énergie et élimination des déchets. Ceci permet de produire de l'énergie utilisable par l’organisme avec une perte d'énergie sous forme de chaleur.
L’anabolisme : Ensemble des processus de synthèse des composés organiques, avec consommation d'énergie et consommation de substrats. Ceci permet de reconstituer les réserves énergétiques.
Petit moyen mémo: ABCD, Anabolisme = Bâtir, Catabolisme = Détruire
La mitochondrie…
Mais tout d’abord une grande question, c’est quoi la mitochondrie?
La mitochondrie : caractéristiques générales :
Aperçu du rôle de la mitochondrie dans la respiration cellulaire :
Glucose (C6)
2 Pyruvates(C3) + 2 ATP
Glycolyse en anaérobie dans le cytoplasme.
CO2 + H2O + ATP + NADH +FADH2
Cycle de Krebs (aérobie/anaérobie) dans la matrice mitochondriale.
Phosphorylation oxydative dans la membrane interne de la mitochondrie (aérobie strict).
Transforme ton ADP en ATP avec un super QCM
Réponse QCM
La mitochondrie
Un p’tit rappel la mitochondrie :
La phosphorylation se déroule sur la membranes interne grâce à quatre complexes (= chaîne de transporteurs d’électrons) et le co-transporteur (= ATP-synthase).
Chaîne respiratoire
La chaîne de transporteurs d'électrons :
(complexes 1, 2, 3, 4), va utiliser les équivalents réduits de l’ATP comme substrats.
C’est-a-direeeee ????
Elle va utiliser du NADH réduit, dans le complexe 1, pour donner du NAD+ oxydé.
Rappel oxydoréduction !
Réduit = capte 1 ou plusieurs électrons.
Oxydé = donne 1 ou plusieurs électrons .
Le complexe 2 fait pareil avec le FADH² qui devient du FADH+.
Gradient de proton
Le sens du gradient est : de l’espace membranaire VERS la matrice mitochondriale
= il va y avoir une concentration en H+ beaucoup plus importante dans l’espace inter-membranaire comparé à la matrice mitochondriale.
J’ai un bac+3 en paint
ATP synthase
Régulation de la respiration mitochondriale
???
???
???
???
???
???
???
Régulation de la respiration mitochondriale
!! La ce sont les 2 états extrêmes, mais il existe plein d’états intermediaries !!
Bilan de la respiration mitochondriale
Concernant les agents découplants :
Réponse QCM
Les agents découplants
Les agents découplants servent à dissocier, désolidariser, décorréler le gradient de concentration grâce à la synthèse d’une molécule d’ATP.
Pour cela l’agent découplant augmente la conductance de la membrane interne de la mitochondrie aux ions H+ = il fait passer des ions H+ à l'intérieur.
Les agents découplants
=> Les agents découplants permettent aux ions H+ de rentrer dans la matrice mitochondriale, sans passé par le complexe ATP synthase.
=> Il contourne le système de création de l’ATP en important des ions = diminution de la production ATP.
Les agents découplants
Les agents découplants ont besoin d’ions H+ importés par la respiration cellulaire. Ainsi cela va la stimuler fortement, car les ions libérés par la respiration ne vont pas être transformés en ATP, pourtant c’est elle qui fait le rétrocontrôle de la respiration.
Protéine UCP
Petit point UCP :
UCP = uncoupling proteins
UCP 1 = graisse brune (trouvée surtout chez le nouveau né).
UCP 2 = cerveau et hypothalamus (contrôle le métabolisme basal).
UCP 3 = muscles squelettiques.
La production de ses protéines est stimulée par :
2 exemples de ROS
…………………: peut être transformé en radical …………………………….(= très réactif).
Quand il va réagir avec d’autres molécules il peut former du …………………… …………………….(= substance active de l’eau oxygénée).
Ce n’est alors plus un radical, mais il possède une conformation électronique qui lui confère une réactivité biologique spécifique.
………………..: les dérivés de l’azote peuvent réagir avec l’oxygène pour former des ions …. …………………….(très oxydants).
=> C’est environ ….% de l'oxygène consommé qui est transformé en ROS
( ↗ avec la consommation en O2).
=> !!! ROS peuvent endommager les glucides, les protéines, les lipides et même l’ADN = ……………………………………… cellulaire ou …………. cellulaire.
2 exemples de ROS
OXYGÈNE : peut être transformé en radical superoxyde (= très réactif).
Quand il va réagir avec d’autres molécules, il peut former du peroxyde d'hydrogène (= substance active de l’eau oxygénée).
Ce n’est alors plus un radical, mais il possède une conformation électronique qui lui confère une réactivité biologique spécifique.
………………..: les dérivés de l’azote peuvent réagir avec l’oxygène pour former des ions …. …………………….(très oxydants).
=> c’est environ ….% de l'oxygène consommé qui est transformé en ROS ( ↗ avec la consommation en O2).
=> !!! ROS peuvent endommager les glucides, les prot, les lipides et même l’ADN = ……………………………………… cellulaire ou …………. cellulaire.
2 exemples de ROS
OXYGÈNE : peut être transformé en radical superoxyde (= très réactif).
Quand il va réagir avec d’autres molécules il peut former du peroxyde d'hydrogène (= substance active de l’eau oxygénée).
Ce n’est alors plus un radical, mais il possède une conformation électronique qui lui confère une réactivité biologique spécifique.
AZOTE : les dérivés de l’azote peuvent réagir avec l’oxygène pour former des ions de peroxynitrite (très oxydants).
=> C’est environ ….% de l'oxygène consommé qui est transformé en ROS ( ↗ avec la consommation en O2).
=> !!! ROS peuvent endommager les glucides, les prot, les lipides et même l’ADN = ……………………………………… cellulaire ou …………. cellulaire.
2 exemples de ROS
OXYGÈNE : peut être transformé en radical superoxyde (= très réactif).
Quand il va réagir avec d’autre molécule il peut former du peroxyde d'hydrogène (= substance active de l’eau oxygénée).
Ce n’est alors plus un radical, mais il possède une conformation électronique qui lui confère une réactivité biologique spécifique.
AZOTE : les dérivées de l’azote peuvent réagir avec l’oxygène pour former des ions de peroxynitrite (très oxydant).
=> C’est environ 3% de l'oxygène consommé qui est transformé en ROS ( ↗ avec la consommation en O2).
=> !!! ROS peuvent endommager les glucides, les prot, les lipides et même l’ADN = dysfonctionnement cellulaire ou mort cellulaire.
L’équilibre est ESSENTIEL entre les pro et les anti-oxydants.
=> hypERproduction de ROS ou hypOproduction d’antioxydant = stress oxydant.
=> hypOproduction de ROS ou hypERproduction d’antioxydant = stress réducteur.
THERMORÉGULATION (important +++ cette année)
Réponse QCM
Homéothermes = êtres vivants à sang chaud.
=> Au niveau du noyau thermique (=centre du corps) la température va être plus ou moins constante (de 37°C pour l’Homme).
=> Possible grâce à un phénomène d'homéostasie = la THERMORÉGULATION
Réponse QCM
B. FAUX : L’organisme peut être présenté comme un noyau thermique central, et une enveloppe thermique qui produit la chaleur.
C’est l’inverse !!
Le noyau thermique est producteur de chaleur => grâce aux muscles squelettiques, aux viscères et au système nerveux central.
Et la peau et les graisses, forme l’enveloppe thermique, elle est la pour retenir au maximum la chaleur à l'intérieur du noyau thermique. Ils ont un pouvoir isolant variable.
Réponse QCM
C. VRAI : Les échanges thermiques dépendent du gradient thermique entre le noyau et l'extérieur.
Les échanges de température entre le corps et son environnement dépendent de la différence de température entre les 2.
Cad : S'il fait 10°C, et que notre corps est à sa température de 37°C, il va y avoir un gradient thermique vers l'extérieur du corps = une perte de chaleur dans le noyau thermique.
Les échanges dépendent aussi du pouvoir isolant de la peau
(son état, sa localisation, …).
Réponse QCM
D. VRAI : L'hypothalamus joue un rôle central dans ce processus en régulant l'équilibre entre la production et la dissipation de chaleur.
L’hypothalamus c’est le centre de contrôle de la thermorégulation.
PRODUCTION de chaleur = thermogenèse (avec des sources externes et interne)
PERTE de chaleur = thermolyse =obligatoire ou adaptative .
Ligne bleu = consommation en O²
Ligne rouge = température centrale
De 22 à 28°C = zone de neutralité thermique.
Comment lutter contre le froid ?
2 options
Limiter les pertes
Augmenter la production
Limiter la THERMOLYSE
Diminuer le volume du noyau
= diminuer les échanges thermiques
Vasoconstriction réflexe périphérique
Plus grand noyau central :
↘ débit sanguin
Frissons
Production de 5 fois plus d’énergie que le métabolisme basal.
↗ du tonus sympathique
Réflexe = piloérection et vaso-constriction
différée = UCP et thermogenèse sans frisson .
Rappel (ou découverte) système nerveux végétatif
Le système nerveux végétatif a 2 branches :
=> Système nerveux végétatif ……………………………….. ou ………………………………
=> Système nerveux ………………………………..
Les 2 ont des actions ……………………………………. sur les organes.
Le système nerveux vegetatif va être responsable des actions ……………………….réflexes de la thermorégulation. Il régit la ……………………et la…………………………………. .
Il est aussi responsable des actions …………… ………… (plusieurs h après), avec la synthèse de ………………………………………… qui donnent la thermogenèse sans frisson.
Rappel (ou découverte) système nerveux végétatif
Le système nerveux végétatif a 2 branches :
=> Système nerveux végétatif orthosympathique ou sympathique.
=> Système nerveux parasympathique.
Les 2 ont des actions antagonistes sur les organes.
Le système nerveux vegetatif va etre responsable des actions ……………………….réflexes de la thermorégulation. Il régit la ……………………et la………………………………….
Il est aussi responsable des actions …………… ………… (plusieurs h après), avec la synthèse de ………………………………………… qui donnent la thermogenèse sans frisson.
Rappel (ou découverte) système nerveux végétatif
Le système nerveux végétatif a 2 branches :
=> Système nerveux végétatif orthosympathique ou sympathique.
=> Système nerveux parasympathique.
Les 2 ont des actions antagonistes sur les organes.
Le système nerveux vegetatif va etre responsable des actions immédiates réflexes de la thermorégulation. Il régit la piloérection et la vasoconstriction.
Il est aussi responsable des actions différées adaptatives (plusieurs h après), avec la synthèse de protéines découplantes qui donnent la thermogenèse sans frisson.
Bioénergétique
Les généralités :
NOTIONS DE :
Métabolisme
?
?
Les généralités :
NOTIONS DE :
Métabolisme
Catabolisme
Anabolisme
Ensemble des transformations ayant lieu dans un système biologique.
Dégradation enzymatique des nutriments riches en énergie
= libération de l'énergie afin de la conserver en ATP par exemple.
Création de molécules complexes à partir de précurseurs simples
= utilisation de l’énergie chimique .
Les généralités :
Et au milieu de tout ça :
Les substrats énergétiques alternent entre catabolisme et anabolisme.
En parlant de l’ATP
Liaison phosphoester
Liaisons anhydrides d’acides phosphoriques
En parlant de l’ATP
ΔG = -31 KJ/mol pour :
ATP => ADP
ADP => AMP
Pourquoi ?
ΔG = -31 KJ/mol pour :
ATP => ADP
ADP => AMP
3 raisons :
Autres substrats énergétiques :
Les composés phosphorylés dits riches en énergie ont un ΔG plus négatif que -25 KJ/mol soit 7,3 Kcal/mol.
Mais alors la formation de l’ATP ?
On utilise donc la catalyse d’un composé PLUS ÉNERGÉTIQUE, ici la créatine-phosphate.
La respiration cellulaire
La respiration cellulaire :
3 étapes :
1- Production de l’acétyl-CoA dans le cytosol.
2- Oxydation de l’acétyl-CoA dans la mitochondrie.
3- Phosphorylation oxydative.
Le cycle de krebs
Questionnaire de positionnement :
Réponse QCM
VRAI : Il faut tout d’abord former de l’acétyl-CoA.
Explication
Petit point ✨explications✨
Réponse QCM
B. Le cycle de krebs peut être appelé cycle de l’acide citrique.
VRAI : C’est ici une référence au premier intermédiaire obtenu par le cycle : le citrate (ou acide citrique donc).
Explication
Petit point ✨explications✨
ΔG = -32 KJ/mol
IRRÉVERSIBLE
Réponse QCM
C. La deuxième réaction du cycle est une déshydratation.
FAUX : Il s’agit d’une isomérisation.
Explication
Petit point ✨explications✨
Petit point important
L’aconitase :
Première étape à laquelle on peut bloquer le cycle, avec :
Le fluoroacétate
Fluorocitrate
= bloque l’aconitase
ATTENTION :
Citrate synthase
Réponse QCM
D. C’est lors de la 3e réaction du cycle que la première molécule de CO2 est évacuée.
VRAI : Exactement.
Explication
Petit point ✨explications✨
3/ Décarboxylation oxydative
Réponse QCM
E. Lors de la 4e réaction du cycle, le coenzyme-A est à nouveau ajouté.
VRAI : Cf le petit point explication.
4e réaction : décarboxylation oxydative
Petit point ✨explications✨
α-cétoglutarate déshydrogénase
pyruvate déshydrogénase
≃
Enzymes analogues répétés le long de la chaîne :
Coenzymes :
Explication
2e positionnement
Réponse QCM
FAUX : C’est le passage du succinyl-CoA en succinate qui libère une molécule riche en énergie.
Explication
Petit point ✨explications✨
Explication
IMPORTANT :
⚠️Seule réaction du cycle qui peut produire de l’ATP ⚠️
ΔG = 0, donc aucune dépense énergétique pour aller vers l’un ou l’autre.
Nucléoside di-phosphate kinase
Réponse QCM
B. La 6e réaction du cycle est une réaction stéréospécifique.
VRAI : Cela veut dire que le produit créé sera toujours dans la même configuration, ici toujours en position trans.
Explication
Petit point ✨explications✨
Petite particularité, cette enzyme est la seule à être fixée à la membrane interne de la mitochondrie
Réponse QCM
C. La réaction catalysée par la fumarase produira du fumarate.
FAUX : Cette réaction part du fumarate pour aller vers le L-malate.
Explication
Petit point ✨explications✨
Activité à nouveau stéréospécifique, production uniquement de L-Malate
Réponse QCM
D. La 8e réaction du cycle implique un transporteur NADH.
VRAI : C’est le dernier du cycle qui en comptabilise 3 au total.
Explication
Petit point ✨explications✨
ΔG>0
Réponse QCM
E. Il existe 4 réactions irréversibles dans le cycle.
FAUX : Il n’en existe que 3, la première réaction et les deux décarboxylations oxydatives.
Explication
3/ Décarboxylation oxydative
BILAN :
Tout d’abord : Ne pas oublier qu’une molécule de glucose donnera 2 molécules de pyruvate, alors pour le bilan il faut compter deux fois le cycle.
On a donc :
Total de 12 ATP par tour = 24 ATP par molécule de glucose.
Les 4 réactions d’O.R = Énergie
PETIT PLUS :
Pensez à faire votre propre cycle en ajoutant et en vous aidant de ce diapo, SURTOUT à votre manière.
Si grosses difficultés, il paraît que certaines musiques restent en tête :
Chaîne respiratoire et
phosphorylation oxydative
QCM
Question 32 - A propos de la phosphorylation oxydative, quelle est, ou quelles sont, la ou les propositions exactes : Annale-2019.
QCM
Question 32 - A propos de la phosphorylation oxydative, quelle est, ou quelles sont, la ou les propositions exactes : Annale-2019.
La phosphorylation oxydative
-> Les électrons provenant des intermédiaires du cycle de krebs NADH et FADH2 vont s’écouler le long d’une chaîne d’enzymes.
-> Pendant ce transport la majeure partie de l’énergie des électrons est conservée sous forme de liaisons riches en énergie (le fameux ATP) : PHOSPHORYLATION OXYDATIVE
La phosphorylation oxydative
La génération de l’ATP par cette phosphorylation oxydative dépend d’un processus chimio-osmotique et peut-être divisée en deux étapes :
-> Conversion…
-> Etape…
La phosphorylation oxydative
Les électrons à haute énergie du NADH et FADH2 parcourent la chaîne respiratoire dans la membrane INTERNE de la mitochondrie.
-> Une partie de cette énergie libérée va être récupérée : gradient de protons.
C’est la dissipation du gradient de protons : l’énergie récupérée va servir à créer de l’ATP à partir d’ADP et de phosphate inorganique (Pi).
La phosphorylation oxydative
Les électrons peuvent être transférés par trois mécanismes :
Et il existe 5 types de transporteurs d’électrons (dont 4 insérés dans la membrane interne de la mitochondrie) :
QCM
A propos des transporteurs d’électrons, choisissez la ou les affirmations exactes :
QCM
A propos des transporteurs d’électrons, choisissez la ou les affirmations exactes :
COMPLEXE 1
NADH déshydrogénase :
COMPLEXE 2
Succinate Déshydrogénase :
COMPLEXE 3
Ubiquinone cytochrome c réductase :
COMPLEXE 4
Cytochrome oxydase :
Ordre des transporteurs d’électrons
QCM
Parmi les propositions suivantes, choisissez celles qui sont exactes :
QCM
Parmi les propositions suivantes, choisissez celles qui sont exactes :
GRADIENT DE PROTONS
ATP SYNTHASE
ATP SYNTHASE
L’ATP synthase a deux fonctions grâce à l’action de pomper les protons dans la matrice :
L’ATP synthase peut soit utiliser l’énergie de l’hydrolyse d’ATP en ADP et phosphate pour pomper les protons à travers la membrane mitochondriale interne dans l’espace intramembranaire.
Soit capter le flux de protons descendant, le gradient électrochimique de protons, pour synthétiser de l’ATP.
ATP SYNTHASE
Remarque : La variation d’énergie libre pour former de l’ATP par l’ATP synthase est proche de 0.
Ainsi, la formation de l’ATP est facilement réversible et la liaison de l’ATP avec l’enzyme est étroite mais non covalente !
Donc le gradient de protons n’a pas le rôle de former directement de l’ATP ! Elle permet d’induire des changements de conformation de F1 permettant la libération d’ATP.
C’est le passage de 3 protons H+ à travers F0 qui va permettre la libération de la molécule.
SITES CATALYTIQUES
- Le premier site est dans une conformation ouverte en O qui présente une faible affinité pour les substrats et pour l’ATP qui peut se détacher.
- Le second site est dans une conformation L qui lie ces substrats (ADP + Pi) mais n’induit pas la catalyse.
- Le troisième site est en conformation T et catalyse la synthèse d’ATP et le lie très fortement.
La force proton motrice permet le changement de conformation de :
T en O
de L en T
et de O en L
ATP SYNTHASE
Merci pour votre attention