Защита

Анализ базы данных АНО «Благотворительная больница»

Кураторы:

Сергей Иевков

Матвей Славенко

Команда:

Екатерина Фокина

Евгений Потапенко

Мария Фирулёва

Лилия Голубникова

Цели и задачи

Цель: статистический анализ БД АНО “Благотворительная больница” с целью выявления паттернов популяции бездомных пациентов, а также поиск взаимосвязей между заболеваниями (хроническими, социально-значимыми) и бездомностью.

Задачи:

• сформировать портрет бездомного;
• выявить ключевые показатели, которые лучше всего отражены в БД и которые играют ключевую роль, и выполнить статистический анализ;
• определить, как место ночлега влияет на наличие каких-либо заболеваний и состояний, связанных со здоровьем;
• найти взаимосвязь между точками приёма и ключевыми характеристиками пациентов;
• проанализировать когорту ВИЧ+ пациентов.

2

Подходы

• анализ показателей по пациентам
• динамический анализ посещений
• описательная статистика
• поиск корреляций с помощью критерия Хи-квадрат, с поправками на множественные сравнения
• использование языковых моделей машинного обучения для парсинга врачебных диагнозов

3

Содержание

4

• Портрет бездомного

​

• Категории бездомности по месту ночлега и поиск ассоциаций

​

• Места приёма пациентов и поиск ассоциаций

​

• Анализ пациентов по нозологическим группам МКБ-10

​

• Анализ пациентов с социально-значимыми инфекциями

Портрет бездомного пациента Благотворительной больницы

5

мужчина 0.78

возраст

45-59 лет 0.41

есть

Паспорт 0.51

СНИЛС 0.22

ОМС 0.43

алкогольная зависимость 0.24

ВИЧ: 0.06

туберкулёз: 0.04

гепатит B: 0.26

гепатит С: 0.09

сифилис: 0.01

диабет: 0.01

среднее число посещений в год: 2,4

высшее образование 0.23

средне-специальное 0.43

состоит в браке 0.21

домашний: 0.18

скрытый бездомный: 0.46

уличный: 0.36

придёт на стоянку: 0.62

болезни костно-мышечной системы, органов пищеварения, дыхательной системы 0.11

болезни системы кровообращения на 0.12

травмы, отравления на 0.14

гражданин РФ 0.93

никотиновая

зависимость 0.24

Пациент АНО “Благотворительная больница”

!Здесь и далее следует учитывать, что о большинстве пациентов ББ информация отсутствует!

Возрастные группы и гендерный состав

​

​

6

325 женщин

1155 мужчин

153 Нет данных

Наличие документов / гражданства у бездомных

7

Документы

Гражданство

93% - российское гражданство

Паспорт

СНИЛС

ОМС

Образование и семейное положение

8

Семейное положение

Образование

Информация об образовании есть только о 1,5% посетителей. Из них у 30 человек средне-специальное, среднее образование.

Семейное положение: также информация только о 1,5%. Основная часть - не состоит в браке.

Место в социуме: социальный анамнез

9

ДА

Отказ от ответа

Места лишения свободы

Воспитанник детского дома

Отказ от ответа

НЕТ

ДА

НЕТ

Категории бездомности по месту ночлега и поиск ассоциаций

10

Категории бездомности по месту ночлега

Домашний:

• квартира/дом в собственности
• длительная аренда жилья (более 1 года)
• квартира/дом в собственности
• краткосрочная аренда жилья (общежитие/хостел, менее 1 года)

Условные бездомные/скрытая:

• медицинское учреждение (стационар)
• низкопороговые приюты для бездомных (ночные, пункты обогрева)
• постоянные приюты для бездомных (24/7)
• транзитное и поддерживаемое проживание (ДНП, менее 1 года)
• рабочий дом
• кризисный центр для женщин
• работа с проживанием (цех, сторожка, охрана)

Уличные/видимая бездомность:

• в публичных местах или на улице
• подвалы, парадные, чердаки
• вокзал
• временное сооружение (шалаш, навес, гараж)
• непригодное жилье (заброшка)

11

Оценка улучшений условий жизни по месту проживания

12

Наблюдения: количество пациентов, чье место проживания стало лучше, составляет всего:

43 (2.6%) .

При этом количество пациентов, чье место проживания стало хуже, составило 55 (3.4%) .

57.5%

17.3%

12.8%

6.4%

2%

1.6%

0.8%

0.6%

0.6%

0.4%

Период: 1 год

Частота обращений: первичные и вторичные приемы

13

(распределение по месту ночлега)

Распространенность туберкулеза среди разных категорий бездомности

14

1 - на диспансерном учете/прием ПТХТ

2 - нет данных

3 - отрицает

4 - прервал прием ПТХТ

5 - снят с диспансерного учета

Вывод: у большинства пациентов диагноз туберкулез отсутствует. Для проведения дальнейшего эпидемиологического анализа рекомендуется расширить информированность по данному показателю.

Распространенность диабета среди разных категорий бездомности

15

17 человек с диабетом

(уровень глюкозы > 11.1)

Распространенность сахарного диабета в выборке БД: 13 600/100 тыс. населения.

Распространенность в РФ: 2945,2 /100 тыс. населения.

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4520328/

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4318300/

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7716851/

Вывод: отсутствие должного контроля гликемии в связи с ограниченным доступом к медицинской системе. Рекомендуется выполнить сплошное тестирование.

Тест выполнен для 7% пациентов.

Выявлена взаимосвязь между зависимостями и типами бездомности

16

p-value: 1.21e-08 0.02 0.087 0.097

Гипотеза: существует связь между типом бездомности и наличием зависимости.

Выводы:

Алкогольная зависимость связана с типом бездомности.

Тест Хи-квадрат

скорректированный

порог Р-значения: 0.0125

Выявлена взаимосвязь между алкоголизмом и тюремным заключением

17

Хи-квадрат

Гипотеза: существует связь между тюремным заключением и наличием зависимости.

Выводы:

Люди, которые были в местах лишения свободы, чаще страдают алкогольной зависимостью.

Выявлена зависимость*:

p-value = 9.08e-06

*Ограниченное количество данных

Места приёма пациентов и поиск ассоциаций

18

Места приёма пациентов

19

Места приёма пациентов разбиты на следующие категории:

​

• Стоянка
• Приют
• Удаленная консультация
• Пункт обогрева
• Медицинский центр

3

30

40

352

385

830

1334

Основная часть посещений - на стоянках.

Заболевания пациентов по местам приёма

(по сводной переменной МКБ-10)

20

удаленная консультация

стоянка

пункт обогрева

приют

ночной приют

нет данных

медицинский центр

Анализ пациентов по нозологическим рубрикам МКБ-10

21

22

Проблема:

Врачи и RStudio говорят на разных языках

Что пишет врач:

ChatGPT

Решение:

Парсинг колонки с трактовкой диагноза

Женя

Какую рубрику по МКБ он выбирает:

Как парсинг изменил эпидемиологическую картину

23

Заболевания пациентов по МКБ-10

24

(по сводной переменной МКБ-10)

Код МКБ-10

Какие нозологические группы в большей степени отягощены алкогольной зависимостью

25

Гипотеза: наличие связи между алкогольной зависимостью и заболеваниями по МКБ-10.

Необходимый уровень p-value с поправкой на множественное сравнение: 0.003

​

Тест Хи-квадрат

Выявлена зависимость между

• Болезнями системы кровообращения, I00-I99 (p-value = 0.002)
• Болезнями кожи и подкожной клетчатки, L00-L99 (p-value = 1.762e-05)
• Травмы, отравления и некоторые другие последствия воздействия внешних причин, S00-T98 (p-value = 0.0007)

Поиск взаимосвязи между нозологическими группами и категориями бездомности

(по сводной переменной МКБ-10)

26

Тест Хи-квадрат

Гипотеза: является ли распределение МКБ-10 среди разных категорий бездомности неслучайным(**).

Необходимый уровень p-value с поправкой на множественное сравнение: 0.003.

​

Выявлена зависимость**:

• Болезнь системы кровообращения, I00-I99 (p-value = 0.000284)

*Учитывали категорию “нет данных”

**Ограниченное количество данных

Анализ заболеваемости по МКБ-10 и категории бездомности

(по сводной переменной МКБ-10)

27

Таблица сопряженности

Анализ пациентов с социально-значимыми инфекциями

28

Социально-значимые инфекции

Гепатит В

Гепатит C

Сифилис

29

Соотношение данных анамнеза и экспресс-тестирования

Социально-значимые инфекции

ВИЧ

30

Протестировано 170 пациентов

Из 15 ВИЧ-положительных 2 не знали о своем статусе

Зафиксирован 1 случай сероконверсии

​

Из 87 ВИЧ-положительных (по данным анамнеза) пациентов только 36 принимают АРВТ

​

​

Результаты экспресс-тестирования

Социально-значимые инфекции

31

Распространенность ВИЧ-инфекции (суммарно по результатам экспресс-тестов и данных анамнеза) составила

​

​

​

​

случаев на 100 000 населения, что�в 7 раз выше, чем в среднем по России (Бонарь и др., 2021)

​

​

Распространенность ВИЧ-инфекции среди бездомных

Бонарь, Е. Д., П. Н. Морозько. "АНАЛИЗ СИТУАЦИИ ПО ВИЧ-ИНФЕКЦИИ В РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ В 2000-2020 ГГ." Актуальные вопросы общественного здоровья и здравоохранения на уровне субъекта Российской Федерации. 2021.

Какие заболевания по МКБ-10 в группах ВИЧ+ встречаются чаще?

32

Тест Хи-квадрат

Гипотеза: есть ли различия в соотношении ВИЧ+ и ВИЧ- в различных нозологических группах.

Необходимый уровень p-value с поправкой на множественное сравнение: 0.003

​

Выявлена зависимость:

• Некоторые инфекционные и паразитарные болезни, A00-B99 (p-value =3.678e-13)

​

Таблица сопряженности

Вывод: информация о статусе ВИЧ+ соответствует фактической в БД.

Эпидемиология в выборке ВИЧ+

33

Характеристика выборки ВИЧ+

34

Вывод: по таким параметрам, как тип бездомности и место приема, выборка ВИЧ+ пациентов воспроизводит картину общей популяции пациентов ББ.

По результатам Хи-теста значимых различий между ВИЧ+ и ВИЧ- по данным факторам (место приема, тип бездомности) - не выявлено .

Отягощенность зависимостями ВИЧ+ пациентов

35

Выводы

• Чаще всего за медицинской помощью в Больницу обращались мужчины: количество пациентов мужского пола в 3,5 раза выше, чем женского. Преобладающая возрастная группа – 45-59 лет, категория бездомности - условно бездомные. Среднее количество обращений в год 2,4.
• Наиболее частую причину для обращения за медицинской помощью составляют травмы (S00-T98), болезнь костно-мышечной системы и соединительной ткани (M0-M99), болезнь кожи и подкожной клетчатки (L55-L59), болезнь системы кровообращения (I00-I99), болезнь органов пищеварения (K00-K93), болезни органов дыхания (J00-J99).
• Алкогольная зависимость связана с типом бездомности. Также выявлена зависимость между алкогольной зависимостью и болезнью системы кровообращения (I00-I99), болезнью кожи и подкожной клетчатки (L55-L59).
• Выявлена зависимость между болезнью системы кровообращения (I00-I99) и категориями бездомности.
• Выявлено, что люди, которые были в местах лишения свободы, чаще страдают алкогольной зависимостью.
• Также стоит отметить высокую распространенность сахарного диабета, ВИЧ среди бездомных по сравнению с популяцией РФ.
• Условия жизни (категория бездомности) у большего процента участников в течение года ухудшилась.

​

​

36

Вклад участников

Евгений Потапенко

Екатерина Фокина

Интерпретация данных, �визуализация данных социально-значимых инфекций, статистические тесты

Чистка БД, �описательные статистики, визуализация данных, статистические тесты, пре- и постпроцессинг результатов парсинга

Лилия Голубникова

Организация работы в репозитории, визуализация данных по заболеваниям, статистические тесты

37

Спасибо за внимание!