1 of 6

БІОІНФОРМАТИКА

2 of 6

Біоінформатика - сукупність методів і підходів, що включають в себе:

  • математичні методи комп'ютерного аналізу в порівняльній геноміки (геномна біоінформатика)
  • розробку алгоритмів і програм для передбачення просторової структури білків (структурна біоінформатика)
  • дослідження стратегій, відповідних обчислювальних методологій, а також загальне управління інформаційної складності біологічних систем

3 of 6

Біоинформатика

Обчислювальна геноміка

Робота з генетичними послідовностями

Анотація генів

Популяційна біоінформатика

Еволюційна біоінформатика

Робота з базами даних

Метаболоміка

Транскріптоміка

Структурна біоінформатика

Обчислювальна геноміка

4 of 6

Мета курсу полягає в навчанні студентів основам аналізу експериментальних даних молекулярної біології: сіквенування послідовностей (теоретичний огляд), пошук послідовностей у базах даних різного типу, проведення BLAST, проведення вирівнювання послідовностей різного типу т.д.

Ознайомлення студентів з такими методами біоінформатики як: методи організації інформації, методами обчислювальної математики і особливо використанню існуючого програмного забезпечення. Курс покликаний готувати фахівців в галузі “комп'ютерної біології”, який займається отриманням біологічно осмислених результатів при дослідженні вмісту банків даних.

5 of 6

Завдання курсу:

1) введення студентів в курс сучасного стану науки у зв'язку із стрімким наростанням молекулярно-біологічних і молекулярно-генетичних даних, пов'язаного з масовою розшифровкою повних геномних послідовностей;

2) ознайомити студентів з основними банками та базами даних та засобами для роботи з ними;

3) ознайомити студентів з сучасним підходом до передбачення функцій генів і пошук структурних і функціональних особливостей геномів на основі порівняння багатьох геномів;

4) побудова на основі одержаних з баз даних послідовностей дерев філогенезу на основі математичних розрахунків моделей еволюції. Вивчення основних алгоритмів побудови дерев філогенезу.

6 of 6

  • Вирівнювання послідовностей;
  • Побудова множинних вирівнювань;
  • Передбачення сайтів зв'язування;
  • Зіставлення нуклеотидних і амінокислотних послідовностей;
  • Передбачення просторових структур білків;
  • Порівняльний аналіз геномів;
  • Пошук пропущених генів і т.д;
  • Побудова філогенетичних дерев.

При вивчанні курсу студенти вирішують наступні завдання