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Biología del color

Pigmentos

@Biocolores

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Biocolores

Bioinformación

Biocolores

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Biocolores

Wikidata

@Biocolores

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4

LABORATORIO DE BIOINFORMACIÓN

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Biocolores

Wikidata

@Biocolores

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Pigmentos biológicos

Cuál es la diferencia entre los siguientes términos:

  1. Colorante
  2. Tinte
  3. Pigmento

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Pigmentos biológicos

Taxones

  • Animales
  • Plantas
  • Hongos
  • Bacterias

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Pigmentación y diversidad de patrones de color en Odonata

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Definiciones de pigmentos biológicos

  • Una entidad molecular endógena que da como resultado el color de un organismo como consecuencia de la absorción selectiva de la luz (CheBI)
  • Cualquier materia colorante normal o anormal en PLANTAS; ANIMALES o microorganismos (MeSH)

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¿Cuántos pigmentos biológicos hay y cuales son?

@biocolores

Pregunta

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organic pigment

@biocolores

¿Pregunta?

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Pigmentos biológicos en MeSH

Pigmento

URL

Betalains

Flavonoids

Anthocyanins

Chlorophyll

Melanins

Pigmentos

Color en los seres vivos

@Biocolores

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Pigmentos biológicos

Pigmento

Cantidad

Tipos más comunes

Dónde se encuentran

Ejemplos de coloración típica

Clorofilas

Clorofilas

Plantas verdes, algas, cianobacterias, diatomeas

Verde

Carotenoides

1204 (1 nov 2020)41

Carotenos y xantofilas (por ejemplo, astaxantina)

Bacterias. Plantas verdes (enmascaradas por clorofila), vegetales como zanahorias, mangos, etc. Algunas aves, peces y crustáceos los absorben a través de sus dietas.

Naranjas, rojos, amarillos, rosas

Flavonoides

7000

(500 antocianinas)

Antocianinas, auronas, chalconas, flavonoles y proantocianidinas

Produce muchos colores en flores. Común en plantas como bayas, berenjenas y frutas cítricas. Presente en ciertos tés, vinos y chocolates.

Amarillo, rojo, azul, violeta

Betalaínas

Betacianinas y betaxantinas

Flores y hongos

Rojo a violeta, también amarillo a naranja

Melaninas

Eumelanina y Feomelanina

Mamíferos

Negro hasta el arenoso y el rojo

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P31

P279

@biocolores

?

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Pigmentos biológicos

DBS

Registros

Notas

PubChem

74

12

LipidBank

KEEG

6

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Antocianinas

DBS

Registros

Notas

74

LipidBank

KEEG

6

https://www.indexdatabase.de/db/i-single.php?id=214

ojo

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Antocianinas

MeSH

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Carotenoides

DBS

Registros

Notas

36

281

6

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Pigment* en MeSH

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Pigmentation Disorders en MeSH

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En las flores el azul es producido por la antocianina

Las flores con Antocianina las puedo registrar en Wikidata

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Células pigmentarias

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Gránulos de pigmento

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Pigmentos en Wikidata

Pigmentos en los seres vivos:

biological pigment

organic pigment

subject has role

subclass of

Son diferentes?

Cuál es el adecuado?

¿Cuál usar?

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Wikidata Pigmentos Biológicos

El inicio del proyecto

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Wikidata pigmentos biológicos Cómo curarlos y hacer consultas

Pigmentos

@EvoMRI

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Anotaciones en Wikidata de : Sea as a color palette: the ecology and evolution of fluorescence

Pigment name

Pigment type

Phylum/Organism

λExc(nm)

λEmi(nm)

Reference

Carotenoid

Arthropoda Malacostraca

530

580

[25]

Tryptophan derivative

Arthropoda Aracnida

360–370

445–490

[26]

Non-carotenoid

Chordata Aves

N/A

N/A

[27]

Pterins-like

Chordata Aves

UV

N/A

[28]

Pteridin

Chordata Actinopterygii

UV

450–490

[29]

Porphyrin

Mollusca Gastropod

UV

625

[30]

Dihydroisoquinolinone

Chordata Amphibia

390–430

450–470

[31]

Betalains

Plantae caryophyllales

463–474

509–512

[32]

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Anotaciones en Wikidata de : Sea as a color palette: the ecology and evolution of fluorescence

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Pigmentos biológicos en Wikidata

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Wikidata pigmentos biológicos (P279,Q910979) que tienen asignado un taxón (P703) y su referencia?

Pigmentos biológicos

@EvoMRI

Pigmentos biológicos

@EvoMRI

1131 4 de abril

1134 5 de abril

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Curando Wikidata Biocolores

Pigmentos biológicos (P279,Q910979)

Reportados en la literatura (P279, Q13442814)

Que tienen asignado un taxón (P703)

2. Generé un nuevo registro para un pigmento biológico faltante

https://www.wikidata.org/wiki/Q106382323

3. Completé los sinónimos de epicarpio

https://www.wikidata.org/wiki/Q2722705

1. Registre los pigmentos de este artículo

https://www.wikidata.org/wiki/Q104915449

Usé un servicio de ontologías

Flavedo

WoW!

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¿Qué animales tienen pigmentos azules en Wikidata?

Tiene pigmento azul en los cromatóforos de la piel

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¿Cuál pigmento tiene?

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Wikidata

  • Instancia de Taxón
  • Color Azul
  • Subclase de animal venenoso

https://www.wikidata.org/wiki/Q1123809

https://www.wikidata.org/wiki/Q131757

https://www.wikidata.org/wiki/Q743123

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Biología del color

Color en las flores

@Biocolores

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@infovestigacion

@infovestigacion

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Layla Michán 2021.