1 of 56

Wikidata

Minerva María Romero Pérez

Laboratorio de Bioinformación

2 of 56

Contenido

  1. Objetivo
  2. Introducción a Wikidata
  3. Procedimiento para bases de datos:
    1. Curación Bioregistry
    2. Curación NAR
    3. Curación Bases de datos de Twitter
  4. Procedimiento en Wikidata:

3 of 56

Objetivo

  • Curar las bases de datos de
    • Bioregistry en Wikidata
    • Nar en Wikidata
    • Twitter en Wikidata
    • las fuentes en Wikidata
  • Crear consultas y visualizaciones de los registros

4 of 56

Introducción a Wikidata

5 of 56

De Jeblad - Trabajo propio, CC BY-SA 3.0, https://commons.wikimedia.org/w/index.php?curid=23471203

6 of 56

De User:Charlie_Kritschmar_(WMDE), User:Lahi - Localización, basado en File:Datamodel in Wikidata.svg, CC0, https://commons.wikimedia.org/w/index.php?curid=62564375

7 of 56

  • Una etiqueta es como el título de una página que describe de qué trata el artículo. Debe ser lo más corto posible (ej.: Tierra y no Planeta Tierra).
  • Las etiquetas no tienen que ser únicas, ya que están desambiguadas por las descripciones.
  • Usa el nombre más común (ej.: gato, no Felis catus) y utiliza mayúscula inicial solo para nombres propios (como Londres, Júpiter o Hillary Clinton, pero no para ciudad, planeta o política).

8 of 56

Descripción. Usada para desambiguar etiquetas al proporcionar más detalles sobre el elemento.

  • Breve; las descripciones no son frases.
  • Trata de ser tan preciso y neutral como sea posible; evita usar información que pueda cambiar con el tiempo o que sea considerada controvertida o sesgada.
  • Las descripciones no deben empezar con artículos como el, la, un o una.

Alias. Un nombre alternativo para un elemento, como el apodo de una persona o el nombre científico de un animal

  • Aunque un elemento solo puede tener una etiqueta y una descripción por idioma, puede tener múltiples alias.
  • Asegúrate de poner mayúscula inicial solo a los nombres propios.

9 of 56

Declaraciones. Lo que sabemos sobre conceptos, temas y objetos. Está compuesta por una categoría de datos, mostrada a la izquierda (propiedades) y una entrada coincidente para esa categoría, a la derecha (valores).

Propiedades (P##)

  • Normalmente tienen un nombre único y distintivo
  • Limitan y definen qué clase de valores de datos pueden agregarse al elemento. Por ejemplo, la propiedad «fecha de descubrimiento» requiere un valor de fecha y no aceptará un valor como «azul» o «Francia».

10 of 56

Referencia. (o fuente) Describe el origen de una declaración en Wikidata.

  • Las referencias no son «siempre» necesarias. No es necesario incluir fuentes de valores que sean de conocimiento común, por ejemplo, que el presidente de un país es un ser humano.
  • Las referencias son como mini declaraciones porque también consisten en pares de propiedad-valor.

Tipos de fuentes de referencia

  1. URL: un enlace a una página web.
  2. De artículo de Wikidata: Esto generalmente se hace cuando la referencia es un libro, papel u otro trabajo que debe tener su propio artículo de Wikidata.

11 of 56

Wikidata:Bases de Datos Biociencias

Un wikiproyecto es un grupo de editores que desean trabajar como un equipo para mejorar Wikidata.

12 of 56

Procedimiento para bases de datos biológicas

13 of 56

Procedimiento

Curación Bioregistry

14 of 56

Nombre de la base de datos

Descripción

link página principal

15 of 56

Curation Bioregistry

  1. ingresar a la liga de Curación en esta se encuentran los registros de Bioregistry que no están en Wikidata

16 of 56

Protocolo de curación Bioregistry

  1. Abrir la hoja de Airtable curación_bioregistry
  2. Abrir el Link de la base de datos

17 of 56

Protocolo de curación Bioregistry

  • Revisar que está registrado en Hypothes.is
    1. Si aparece el link de Wikidata, revisar que la información esté bien.
    2. Si no aparece realizar la búsqueda de la base de datos en Wikidata.
      1. Si se encuentra revisar que la información esté bien y agregarla a Hypothes.is.
      2. Si no se encuentra crearla y agregarla a Hypothes.is.

18 of 56

Protocolo de curación Bioregistry

  • Agregar la Propiedad asociada de Wikidata solo si tiene una propiedad asociada al elemento que estamos registrando hay que agregarlo y además poner la propiedad en Airtable pues se pide en el registro de github.
  • Copiar la URL de Wikidata y pegarla en Airtable en la columna url Wikidata
  • Llenar las columnas de “nombre del curador” y “reportar en Bioregistry”.

19 of 56

  1. Airtable

2. Registro en Bioregistry

3. Wikidata

4. Revisión de Wikidata

20 of 56

Procedimiento

Curación Nar

21 of 56

Nombre

Número

url

Fuente

Categorías

Contacto

Autores

22 of 56

Protocolo de curacion NAR

  • Abrir la hoja de Airtable curación NAR
  • Abrir el Link de la base de datos si lo tiene, si no entonces entrar a la página de NAR, buscar el registro y agregarlo en Artable en la columna “url NAR”

Revisar que la URL este limpia, es decir, que termine con el número del registro

23 of 56

Protocolo de curación NAR

  1. Entrar a la URL de la página oficial de la base de datos.
    1. Si no se puede abrir la página o hay algún error en esta reportarlo en Airtable
    2. Si se puede abrir revisar que está registrado en Hypothes.is
  2. Buscar La base de datos en Wikidata
  3. Agregar el link de Wikidata y NAR a Hypothes.is
  4. Agregar el link de Wikidata al Aritable y llenar la columna de curador

24 of 56

  • Airtable

2. NAR

3. Wikidata

4. Revision de Wikidata

5. Hypothes.is

25 of 56

Procedimiento

Curación Bases de datos de Twitter

Tablero BioDBS

26 of 56

Nombre en Twitter

Miembros que son bases de datos

tweets más recientes

27 of 56

Protocolo de curación Twitter

  • Abrir el tablero de Twitter
  • Abrir la lista de miembros y seleccionar una base de datos.
  • Abrir la página de usuario de la base de datos, buscar la URL de la página oficial de la base de datos

28 of 56

Protocolo de curación Twitter

  • Abrir el ver si ya está registrada la base de datos en Hypothes.is
  • Agregar toda la información necesaria a Hypothes.is como se muestra a continuación

29 of 56

  • Twitter

2. Usuario

de Twitter

4. Wikidata

5. Revisión de Wikidata

3. Base de datos

30 of 56

BIODBs OFF

Cuando abrimos la URL de las fuentes de bases de datos y no se puede abrir o aparece un error. Se busca en internet la base de datos para rectificar que no aparezca y esto se registra.

La única razón por la que no se registra en Wikidata es porque la URL no sirva.

En Hypothes.is se pone la nota: (Nota: la URL de narid es incorrecta)

31 of 56

BIODBs OFF

Si la base de datos no activa la encontramos en Wikidata, entonces lo que hacemos es:

  • Ponemos la página web con fecha de fin y la referencia de Internet Archive

32 of 56

Procedimiento en Wikidata

33 of 56

Búsqueda de elemento en Wikidata

Siempre se tiene que tener en cuenta que antes de crear un nuevo elemento, este elemento no se encuentre en Wikidata, buscando el elemento que queremos con todos sus nombres posibles.

Base de datos

Identificador

Identificador

Manual

Anotaciones de base de datos

Artículo

34 of 56

Creación de elemento en Wikidata

Si no se encontró el elemento entonces procedemos a agregarlo, para esto se tienen distintas formas de crear elementos en Wikidata.

En cualquiera de las siguientes maneras que se verán se necesita ingresar con su usuario y contraseña, si no cuenta con una en esta liga pude generarlo.

35 of 56

Creación de elemento en Wikidata

En cualquiera de los tres casos se tiene que agregar la siguiente información para que esté bien curado, estas son las propiedades más importantes:

  1. Etiqueta que es el nombre
  2. Descripción en inglés (si se puede traducirlo al español, si está complicado dejarlo para algún experto en el tema)
  3. Instancia de Según lo que se tenga se pone Base de datos biológica, base de datos médica, ontología o herramienta
  4. Tema principal de la obra que temas está tratando, esta se encuentra en la descripción de la base, en acerca de o a veces en el mismo nombre.
  5. Página web oficia Esta es la página que tenemos registrada en Airtable y siempre recordar poner el calificativo de idioma de la obra o del nombre
  6. Descrito en Agregar los elementos que tenemos como fuentes.
  7. Si el elemento tiene más propiedades, agregarlas o seguir la plantilla
  8. Nombre de usuario en Twitter Agregar el nombre de usuario de Twitter si es que se tiene.

36 of 56

Creación de elemento en Wikidata

  1. Entrar en crear un elemento nuevo
  1. Crear un elemento desde la página de Wikidata.

37 of 56

Creación de elemento en Wikidata

Poner “en” que es inglés

Nombre de la base de datos o elemento a registrar

Pequeña descripción de la base de datos

Otros nombres con los que se le conoce o se puede encontrar

38 of 56

Creación de elemento en Wikidata

39 of 56

Creación de elemento en Wikidata

Agregar las declaraciones relacionadas con las propiedades más importantes que tenemos

Si se encuentra en alguna otra wiki, agregarlo

40 of 56

Creación de elemento en Wikidata

Poner la propiedad que se va a usar puede agregarse con palabras o con el identificador P#

41 of 56

Creación de elemento en Wikidata

Valor correspondiente a la propiedad

Cuando estemos seguros de la información darle en publicar

42 of 56

Creación de elemento en Wikidata

Al poner la fuente agregamos la referencia que va a ser la URL del registro en la fuente

43 of 56

Creación de elemento en Wikidata

Ejemplo de como quedan las declaraciones del registro y estas son las más importantes

44 of 56

Creación de elemento en Wikidata

Agregar el registro en Español

45 of 56

Creación de elemento en Wikidata

  • Ingresar al formulario de información básica o completa para registrar la base de datos

Asegurarse de completar las propiedades más importantes, además de las que son obligatorias. Un buen ejemplo es https://www.wikidata.org/wiki/Q172266 y https://www.wikidata.org/wiki/Q905695

NOTA: esta forma de añadir es tardada porque no se crea rápido

46 of 56

Creación de elementos en Wikidata

  1. Se pueden agregar elementos en lotes con la herramienta QuickStatements se tiene la guía de como agregarlos en Help:QuickStatements y también en el proyecto de Bases de Datos Biociencias con la plantilla siguiente:

Se puede poner en una hoja de cálculo, copiarla y pegarla en QuickStatements de esta forma podemos agregar muchos registros.

47 of 56

Curación con Quick statements

Es una herramienta que puede editar elementos de Wikidata, basándose en conjuntos simples de comandos de texto. La herramienta puede añadir y eliminar declaraciones, etiquetas, descripciones y alias; así como añadir declaraciones con calificadores opcionales y fuentes. La secuencia de comando puede ser escrita en la ventana de importación o creada en una hoja de cálculo o un editor de texto, y pegada en la ventana.

48 of 56

Curación con Open Refine

Open Refine es una poderosa herramienta para trabajar con datos desordenados: limpiarlos; transformándolo de un formato a otro; y ampliándolo con servicios web y datos externos.

Esta herramienta nos ayudará a curar las bases de datos más fácilmente, esta se instala en la computadora y es necesario tener instalado Java y contar con acceso a la web.

Se puede instalar en distintos sistemas operativos y se tiene la guía de como hacerlo.

49 of 56

Revisión de Wikidata

  1. Corroborar que en la instancia aparezca la instancia descrita en el proyecto de Bases de Datos Biociencias.
  2. Agregar la propiedad de descrito en y que contenga las fuentes registradas en el proyecto de Bases de Datos Biociencias con refrencia URL

50 of 56

Procedimiento en Wikidata

Búsqueda del elemento

Creación del elemento

Revisión de la información

51 of 56

Elementos repetidos en Wikidata

Al buscar el elemento que vamos a agregar, si encontramos dos registros de este se tiene que:

  1. Corroborar que si son el mismo, entrar a la página oficial de cada uno y revisar, e investigar sobre ambos
  2. Ver que en la descripción sean iguales o no tenga alguno descripción para que no aparezca un error al unirlos.
  • Entrar a Special:MergeItems poner la identificación (Q###) y revisar que si sé allá unido bien y ver que información se quedó en el registro

52 of 56

Consultas en Wikidata

En el proyecto de Bases de Datos Biociencias tenemos las consultas principales que se han hecho

53 of 56

Consultas en Wikidata

question

url

source

license

lista de todas las dbs biológicas y médicas

CC-BY-SA

lista de todas las dbs biológicas y médicas con etiqueta en ingles

CC-BY-SA

Bases de datos Biológicas con descripción, imagen y Wikipedia

CC-BY-SA

Esta consulta obtiene todas las bases de datos en Wikidata que tienen una propiedad de Wikidata asociada y alguna otra información interesante que la acompaña

CC-BY-SA

Bases de datos bibliográficas en Biociencias

CC-BY-SA

Lista de patrocinadores de las bases de datos biológicas

CC-BY-SA

Gráfico de burbujas sobre los tipos de licencia que utilizan las bases de datos biológicas

CC-BY-SA

lista de todas las bases de datos en NAR Molecular Biology Database Collection con referencias

CC-BY-SA

lista de todas las categorías y subcategorías de NAR en Wikidata

CC-BY-SA

Consulta que enumera todas las bases de datos que tienen el predicado "descrito por la fuente" que apunta al Bioregistry

CC-BY-SA

Lista de todas las bases de datos con Twitter y pagina principal

CC-BY-SA

Lista de todas las bases de datos que tienen Twitter

CC-BY-SA

Gráfico de burbujas que tienen descrito por la fuente de las bases de datos

CC-BY-SA

Consulta que muestra el link de la referencia de las bases de datos NAR

CC-BY-SA

54 of 56

Consultas Biológicas en Wikidata

question

url

source

license

tema

lista de todas las dbs biológicas y médicas

CC-BY-SA

Biodatabases

Bases de datos Biológicas con descripción, imagen y Wikipedia

CC-BY-SA

Biodatabases

Esta consulta obtiene todas las bases de datos en Wikidata que tienen una propiedad de Wikidata asociada y alguna otra información interesante que la acompaña

CC-BY-SA

Biodatabases

Bases de datos bibliográficas en Biociencias

CC-BY-SA

Biodatabases

Lista de financiadores de bases de datos biológicas

CC-BY-SA

Biodatabases

Gráfico de burbujas sobre los tipos de licencia que utilizan las bases de datos biológicas

CC-BY-SA

Biodatabases

lista de todas las bases de datos en NAR Molecular Biology Database Collection

CC-BY-SA

Biodatabases

Consulta que enumera todas las bases de datos que tienen el predicado "descrito por la fuente" que apunta al Bioregistry

CC-BY-SA

Biodatabases

Lista de todas las bases de datos con Twitter y pagina principal

CC-BY-SA

Biodatabases

Obtenga todas las indicaciones de medicamentos y su base de datos de origen

CC-BY-SA

Biodatabases

Copyright de todas las bases de datos biológicas de ELIXIR

CC0

Biodatabases

Obtenga información de localización subcelular de Gene Ontology, con códigos de evidencia y referencias para Reelin

CC-BY-SA

Ontology

Obtenga información sobre la localización subcelular de Gene Ontology y referencias para proteínas

CC-BY-SA

Ontology

Recuperar todos los genes y miARN maduros que están implicados en la "regulación de la respuesta inmunitaria" (GO:0050776)

CC-BY-SA

Ontology

Obtener genes con asociación GWAS con asma y cuyo producto genético se localiza en la membrana donde la localización GO se basa en un código de evidencia que no es IEA

CC-BY-SA

Ontology

Recupere todos los genes humanos que están involucrados en cualquier respuesta inmune (como se indica en GO) Y están regulados por hsa-miR-211-5p.

CC-BY-SA

Ontology

Obtener anotaciones GO para genes FA

CC-BY-SA

Ontology

Obtenga todas las proteínas con anotaciones GO que son una subclase de "actividad del receptor de señalización", donde el método de determinación es un tipo de afirmación manual y la evidencia es un artículo científico que se publicó desde 2014

CC-BY-SA

Ontology

Recuperar ortólogos de genes FA-core

CC-BY-SA

Ontology

Obtenga toda la información sobre ontologías génicas y referencias para proteínas, pero solo muestre afirmaciones en las que la referencia sea un artículo de revista publicado en Nature, Cell o Science.

CC-BY-SA

Ontology

Encuentre medicamentos que traten una enfermedad y muestre un enlace para cada referencia de apoyo

CC-BY-SA

Diseases

El fármaco interactúa con la proteína codificada por el gen con asociación a la enfermedad. Mostrando metformina

CC-BY-SA

Diseases

Encontrar medicamentos para el cáncer que se dirijan a genes relacionados con la proliferación celular, donde un medicamento interactúa físicamente con el producto de un gen que se sabe que está genéticamente asociado a una enfermedad.

CC-BY-SA

Diseases

Obtener genes con asociación GWAS con asma y cuyo producto genético se localiza en la membrana donde la localización GO se basa en un código de evidencia no IEA con asociación GWAS con cualquier enfermedad respiratoria

CC-BY-SA

Diseases

Obtener genes con asociación GWAS con asma y cuyo producto genético se localiza en la membrana donde la localización GO se basa en un código de evidencia que no es IEA con asociación GWAS con cualquier enfermedad respiratoria y mostrar exposiciones químicas asociadas

CC-BY-SA

Diseases

Obtener genes con asociación de GWAS con asma y cuyo producto genético se localiza en la membrana donde la localización de GO se basa en un código de evidencia que no es de IEA con asociación de GWAS con cualquier enfermedad respiratoria y muestra exposiciones y vías químicas asociadas

CC-BY-SA

Diseases

Consigue el artículo que tiene el ID de ontología de enfermedad "DOID:8577"

CC-BY-SA

Diseases

Consigue todos los artículos con un ID de ontología de enfermedades

CC-BY-SA

Diseases

Obtenga todos los reclamos de asociación genética que vinculan el gen con la enfermedad, junto con el método de determinación (GWAS, TAS, etc.)

CC-BY-SA

Diseases

Lista donde el tipo de elemento es 'problema de salud' o subtipo o sub-subtipo/etc.

CC-BY-SA

Obtenga todos los reclamos de "medicamento utilizado para el tratamiento de enfermedades" con una columna que indica si existe una referencia para el reclamo.

CC-BY-SA

Diseases

Obtener etiqueta, sinónimos, descripción de una lista seleccionada de enfermedades como DOID

CC-BY-SA

Diseases

Contar etiquetas de lenguaje para enfermedades

CC-BY-SA

Diseases

Obtenga todas las afirmaciones de "asociación genética" (P2293) que vinculan el gen con la enfermedad, ¿cuántas son de GWAS en comparación con otros métodos?

CC-BY-SA

Diseases

Obtener todas las propiedades y sus recuentos de uso en elementos que son enfermedades

CC-BY-SA

Diseases

Obtenga todas las propiedades y sus recuentos de uso para declaraciones donde los valores son enfermedades

CC-BY-SA

Diseases

Artículos científicos que tengan como tema el virus del Zika o la fiebre y que se utilicen como referencia en otro artículo

CC-BY-SA

Diseases

Número de publicaciones sobre el virus del Zika que tienen declaraciones de autor (P50) pero sin declaración de cadena de nombre de autor (P2093)

CC-BY-SA

Diseases

Cronología de la cantidad de artículos para publicaciones sobre el virus del Zika

CC-BY-SA

Diseases

Declaraciones relacionadas con el virus del Zika (Q202864)

CC-BY-SA

Diseases

Obtener artículos con "Zika" en la etiqueta del artículo

CC-BY-SA

Diseases

Ensayos clínicos para la fiebre Zika

CC-BY-SA

Diseases

Autores de Zika más comunes

CC-BY-SA

Diseases

Lista de enfermedades con dolor como síntoma

CC-BY-SA

Diseases

Listar enfermedades con dolor crónico como síntoma

CC-BY-SA

Diseases

Listar enfermedades con dolor primario crónico como síntoma

CC-BY-SA

Diseases

Enumere las enfermedades que tienen la fatiga como síntoma.

CC-BY-SA

Diseases

Enumerar las enfermedades que tienen fiebre como síntoma.

CC-BY-SA

Diseases

Enumerar las enfermedades que tienen como síntoma la pérdida de memoria

CC-BY-SA

Diseases

Enumere las enfermedades que tienen arritmia cardíaca como síntoma.

CC-BY-SA

Diseases

Lista de enfermedades que tienen dolor de espalda como síntoma

CC-BY-SA

Diseases

Enumere las enfermedades que tienen dolor en el pecho como síntoma.

CC-BY-SA

Diseases

Lista de enfermedades que tienen dolor abdominal como síntoma

CC-BY-SA

Diseases

Enfermedades neurológicas ordenadas por prevalencia

CC-BY-SA

Diseases

Enumere las enfermedades que tienen mialgia como síntoma.

CC-BY-SA

Diseases

Enumere las enfermedades que tienen dolor neuropático como síntoma.

CC-BY-SA

Diseases

Lista de subtipos de dolor

CC-BY-SA

Diseases

Lista de subtipos de dolor crónico

CC-BY-SA

Diseases

Lista de subtipos de fiebre

CC-BY-SA

Diseases

Lista de subtipos de inflamación

CC-BY-SA

Diseases

Lista de subtipos de pérdida de memoria

CC-BY-SA

Diseases

Lista de subtipos de arritmia cardíaca

CC-BY-SA

Diseases

Lista de subtipos de náuseas

CC-BY-SA

Diseases

Lista de subtipos de confusión mental

CC-BY-SA

Diseases

Lista de subtipos de fatiga

CC-BY-SA

Diseases

Listar artículos sobre confusión mental

CC-BY-SA

Diseases

Lista de artículos sobre el dolor

CC-BY-SA

Diseases

Listar artículos sobre dolor crónico

CC-BY-SA

Diseases

Lista de subtipos de dolor de cabeza

CC-BY-SA

Diseases

Lista de artículos sobre dolor de cabeza

CC-BY-SA

Diseases

Listar artículos sobre dolor neuropático

CC-BY-SA

Diseases

Listar artículos sobre fatiga

CC-BY-SA

Diseases

Solicite todos los taxones que tengan al menos un gen y sean hijos del género Chlamydia

CC-BY-SA

Gene

Solicite todos los operones y sus genes para Listeria monocytogenes EGD-e

CC-BY-SA

Gene

Devolver recuentos de genes para cada genoma bacteriano en Wikidata

CC-BY-SA

Gene

Retrieve all genes that are involved in "regulation of immune response" AND that are regulated by an miRNA expressed in blood plasma or saliva

CC-BY-SA

Gene

Para estos genes implicados en la regulación de la respuesta inmunitaria, ¿existen fármacos que modulen la respuesta inmunitaria, dirigiéndose a uno de estos genes?

CC-BY-SA

Gene

Same query as the previous, but also retrieving small molecules interacting with these gene products.Misma consulta que la anterior, pero también recuperando pequeñas moléculas que interactúan con estos productos génicos.

CC-BY-SA

Gene

Obtener genes con asociación GWAS con asma

CC-BY-SA

Gene

Obtener genes con asociación GWAS con asma y cuyo producto génico esté localizado en la membrana

CC-BY-SA

Gene

¿Qué mutaciones compensatorias en los genes centrales de FA confieren resistencia a los fármacos quimioterapéuticos (p. ej., cisplatino)?

CC-BY-SA

Gene

Cuente el número de genes en cada taxón por NCBI Tax ID, ordene por el conteo

CC-BY-SA

Gene

Obtener mapeo de artículos de Wikipedia a elementos de WikiData a ID de genes de Entrez

CC-BY-SA

Gene

Recuento de investigadores principales de ensayos clínicos por género

CC-BY-SA

Gene

Conoce todas las interacciones farmacológicas de Metadona

CC-BY-SA

Gene

Qué variante de qué gen predice un pronóstico positivo en el cáncer colorrectal

CC-BY-SA

Gene

Dada una identificación de variante, encuentre medicamentos que puedan dirigirse a la proteína correspondiente

CC-BY-SA

Gene

Dada una ID de variante, encuentre medicamentos que puedan dirigirse a una proteína en la misma vía

CC-BY-SA

Gene

Solicite todos los operones, sus reguladores y sus productos

CC-BY-SA

Gene

Enlace de sitio de wikipedia para el producto de un gen con nombre

CC-BY-SA

Gene

Solicite todos los organismos que se encuentran en el tracto urogenital femenino y que tienen un gen con producto indol

CC-BY-SA

Gene

Devuelva los recuentos de proteínas para cada genoma bacteriano en Wikidata

CC-BY-SA

Obtenga todos los miARN maduros en Wikidata

CC-BY-SA

Recuperar todos los miARN maduros y sus objetivos (nombres e ID del gen NCBI entrez)

CC-BY-SA

Procesos biológicos afectados por hsa-miR-211-5p

CC-BY-SA

Obtenga afirmaciones de "predictores terapéuticos positivos", filtrando las afirmaciones que son "discutidas por" cualquier cosa

CC-BY-SA

Lista de dosis diarias definidas, la unidad y vía de administración

CC-BY-SA

Responsables y Coordinadores de nodos ELIXIR

CC0

Lista de publicaciones del Human Cell Atlas

NA

CC0

Publicaciones

Listar artículos sobre sustancia P

CC-BY-SA

Artículos

Listar artículos sobre el receptor 5-HT

CC-BY-SA

Artículos

Lista de artículos publicados en revista: Clinical Breast Cancer

CC-BY-SA

Artículos

Artículos que describen los recursos de ELIXIR y sus autores

CC0

Artículos

Ensayos clínicos en la Universidad de Vanderbilt

CC-BY-SA

Ensayos clínicos

Ensayos clínicos con Julie McElrath como investigadora principal

CC-BY-SA

Ensayos clínicos

Ensayos clínicos financiados por el Instituto de Investigación de Resultados Centrados en el Paciente

CC-BY-SA

Ensayos clínicos

Condiciones médicas por recuento de ensayos clínicos

CC-BY-SA

Ensayos clínicos

Intervenciones de investigación por número de ensayos clínicos

CC-BY-SA

Ensayos clínicos

Sitios de investigación por número de ensayos clínicos

CC-BY-SA

Ensayos clínicos

Investigadores principales por número de ensayos clínicos

CC-BY-SA

Ensayos clínicos

Financiadores por número de ensayos clínicos

CC-BY-SA

Ensayos clínicos

Ensayos clínicos con investigador principal y su afiliación

CC-BY-SA

Ensayos clínicos

Ensayos clínicos donde el investigador principal tiene afiliación a la Universidad de Vanderbilt

CC-BY-SA

Ensayos clínicos

Cuadro de organizaciones por número de ensayos clínicos

CC-BY-SA

Ensayos clínicos

Ensayos clínicos donde el patrocinador fue Pfizer

CC-BY-SA

Ensayos clínicos

Ensayos clínicos en los que el investigador principal es una mujer

CC-BY-SA

Ensayos clínicos

Investigadores principales de ensayos clínicos por ocupación

CC-BY-SA

Ensayos clínicos

Listar todos los ensayos clínicos

CC-BY-SA

Ensayos clínicos

Contar todos los ensayos clínicos

CC-BY-SA

Ensayos clínicos

Propiedades más comunes aplicadas a los ensayos clínicos

CC-BY-SA

Ensayos clínicos

Recuento de declaraciones en registros de ensayos clínicos

CC-BY-SA

Ensayos clínicos

Recuento de registros de ensayos en Wikidata por registro de ensayos clínicos

CC-BY-SA

Ensayos clínicos

Estadísticas de ensayos clínicos en Wikidata

GNU GENERAL PUBLIC LICENSE

Ensayos clínicos

Ensayos clínicos ordenados por fecha

GNU GENERAL PUBLIC LICENSE

Ensayos clínicos

Mostrar un gráfico de ensayo clínico dividido por fase y ordenado por año

GNU GENERAL PUBLIC LICENSE

Ensayos clínicos

Número de casos y muertes por COVID-19 confirmados por la OMS en todo el mundo por fecha

CC-BY-SA

Coronavirus

Ensayos clínicos con la vacuna COVID-19

CC-BY-SA

Cuadrícula de imágenes de personas que han muerto por COVID-19 ordenadas por integridad de elementos de Wikidata

CC-BY-SA

Coronavirus

Cuadrícula de imágenes de personas que han sido diagnosticadas con COVID-19 ordenadas por integridad de elementos de Wikidata

CC-BY-SA

Coronavirus

Artículos de revistas científicas con COVIDWHO ID (P8150)

CC-BY-SA

Coronavirus

Artículos de revistas científicas con tema principal (P921) Sars-Cov-2, COVID-19 o la epidemia

CC-BY-SA

Coronavirus

Lista de Betacoronavirus (Q16532287)

CC-BY-SA

Coronavirus

Lista de vacunas candidatas contra el COVID-19 con fases de prueba

CC-BY-SA

Coronavirus

Mapa de organizaciones/empresas que desarrollan/fabrican una vacuna COVID-19 en ensayos

CC-BY-SA

Coronavirus

Enumere los kits de prueba de COVID-19

CC-BY-SA

Coronavirus

Todos los virus SARSr

CC-BY-SA

Coronavirus

Los siete coronavirus que infectan a los humanos

CC-BY-SA

Coronavirus

La lista completa de coronavirus

CC-BY-SA

Coronavirus

lista de las identificaciones de taxonomía de NCBI para los coronavirus

CC-BY-SA

Coronavirus

lista de los síntomas de COVID-19

CC-BY-SA

Coronavirus

Lista de los posibles efectos de COVID-19

CC-BY-SA

Coronavirus

¿Qué genomas se han medido para el virus SARS-CoV-2?

CC-BY-SA

Coronavirus

Lista de variantes de SARS-CoV-2

CC-BY-SA

Coronavirus

Lista de variantes de secuencia del SARS-CoV-2

CC-BY-SA

Coronavirus

Lista de los genes del SARS-CoV-2

CC-BY-SA

Coronavirus

Lista de proteínas SARS-CoV-2

CC-BY-SA

Coronavirus

lista de los complejos de proteínas SARS-CoV-2

CC-BY-SA

Coronavirus

lista de las estructuras PDB de las proteínas SARS-CoV-2

CC-BY-SA

Coronavirus

Listar todos los genes SARSr

CC-BY-SA

Coronavirus

Lista de todas las proteínas SARSr

CC-BY-SA

Coronavirus

Lista de todos los genes de coronavirus humanos

CC-BY-SA

Coronavirus

lista de todas las proteínas de coronavirus humanos

CC-BY-SA

Coronavirus

Lista de las interacciones entre las proteínas humanas y del SARS-CoV-2

CC-BY-SA

Coronavirus

Lista de las vías relacionadas con los coronavirus humanos

CC-BY-SA

Coronavirus

Listar artículos sobre anticuerpos contra coronavirus humanos

CC-BY-SA

Coronavirus

Lista de las vacunas COVID-19 y sus tipos

CC-BY-SA

Coronavirus

Lista de los ensayos clínicos con COVID-19 como tema principal

CC-BY-SA

Coronavirus

Cuente el número de ensayos clínicos para COVID-19 para cada fármaco/intervención

CC-BY-SA

Coronavirus

Artículos sobre el SARS-CoV-2

CC-BY-SA

Coronavirus

Artículos académicos sobre COVID-19 con "Wikipedia" en el título

unknown

Coronavirus

55 of 56

56 of 56

Agradecimientos

Bibliografía

Esta guía es producto del trabajo realizado durante mi servicio social en el Laboratorio de Bioinformación de la Facultad de Ciencias, UNAM y gracias al equipo del Laboratorio.