#3igCILIA project
(Scroll down for Portuguese version)
[En] My name is Andreia Pinto and I am a Thoracic Research assistant at the Royal Brompton Hospital in London.
This questionnaire is part of a wider project that intends to use artificial intelligence to help in the diagnose of a disease called Primary ciliary dyskinesia (PCD). I am extremely grateful for your help allow us to work towards improving our diagnostic methods and potentially benefit patients in the future. PCD is a genetic multisystemic disease that affects structures called cilia that are a cell component found throughout the human body. Cilia are hair like structures that stick out from the cell surface, and many of them move/beat in a very special way making them essential for health. In PCD, as a consequence of abnormal cilia movement there can be all sorts of health problems, such as; lung damage, infertility, hydrocephaly (build-up of fluid within the brain), and so on. To better understand what is wrong in these cases where cilia are malfunctioning, some kinetic (cilia movement) tests can be performed and the structure of the cilia examined. Luckily, the structure of the cilia is highly conserved meaning they have a very well-defined structure (see the schematic representation https://en.wikipedia.org/wiki/Cilium#/media/File:Eukaryotic_cilium_diagram_en.svg; and for more information about cilia role please check YouTube video https://www.youtube.com/watch?v=HMB6flEaZwI), a cilium has around 200nm diameter (much thinner than a single hair) and all its components must be present for it to work properly, like a small piece of machinery.
The images you will be looking at in this survey are images acquired with an electron microscope, a very powerful microscope that allows us to visualize and analyse very small events. These images will be black and white, and the aim here is to analyse inter-human subjectiveness, as people will have different opinions of each image.
Please look carefully at the image of the normal healthy cilium shown on the first screen and quickly go through the 100 cilia presented. There are no incorrect answers. For each image you pick either NORMAL (if the cilium resembles the example and has apparently all its components in place), ABNORMAL (if something seems wrong, disregarding of what it is) or USELESS (when a cilia is so fuzzy, dirty, lacking contrast, or any other reason that prevent you to analyse its structure, making it useless for analyses).
Just be quick and let your brain show you the answer, like a game, intuition is more important than scrutiny
Any questions regarding the #3igCILIA project, or any will to know the outcome of this work, or even simple interest about the AI project, just please contact me via e-mail: a.pinto@rbht.nhs.uk .

Before you start, please notice that this questionnaire is anonymous and there is no way to track your answers back to you, I will only ask a couple of epidemiologic questions for future analysis,

This will take you between 10-15 minutes

Thank you and have fun!

[Pt] O meu nome é Andreia Pinto e sou investigadora no  Hospital Royal Bompton em Londres.
Este questionário faz parte de um projecto que tem como objectivo utilizar a Inteligência artificial como facilitadora para o diagnóstico da Discinésia Ciliar Primaria (DCP). A DCP é uma doenca genética multissistémica caracterizada por afectar os cílios do organismo. O cílio é um componente da célula e apresenta-se como uma protusão da mesma, quase como um pelo. O cílio pode ser móvel ou imóvel, e quando móvel, fá-lo num batimento muito regular e específico, sendo isso  característica fundamental da função do cílio. As consequências desta falta de função podem levar a vários tipos de falhas em sistemas do corpo humano, como os pulmões, sistema reprodutivo, cérebro, entre outros. Para melhor perceber o que se passa com estes cílios, vários estudos de cinética ciliar e estrutura podem ser realizados. Dando especial foco ao facto do cílio conter uma estrutura muito conservada, a sua análise torna-se sistemática e classificável (clique no link para ver a estrutura do cílio num esquema detalhado:  https://en.wikipedia.org/wiki/Cilium#/media/File:Eukaryotic_cilium_diagram_en.svg  e para mais informações sobre a dinâmica e função do cílio clique no seguinte link de Youtube https://www.youtube.com/watch?v=HMB6flEaZwI), O cílio tem cerca de 200nm de diâmetro, significa que é 5000 vezes mais fino que um fio de cabelo, e todos os seus componentes internos devem estar perfeitamente ordenados, para que se possa movimentar de forma eficiente, como se fosse uma pequena máquina.
As images que irá classificar sao imagens de cílios em corte perpendicular, e foram obtidas utilizando um microscópio de alta resolucão, um microscópio electrónico. Este microscópio permite-nos analisar estruturas muito pequenas não visíveis a olho nu. As images são a preto e branco e o objetivo é poder avaliar a subjetividade inter-humana.
Veja por favor com atencão o cílio normal na primeira página e de seguida classifique os seguintes 100  cílios. Não existem respostas incorretas.
As categorias em que deverá classificar são NORMAL (se o cílio se parecer com o exemplo, e todos os seus componentes estiverem organizados), ABNORMAL (se algo nao parece bem, independentemente do que for), USELESS (todos os cilios em que for impossível or duvidoso avaliar a sua estrutura interna)
Recomendo que seja rápido(a) e que deixe o seu cerebro mostrar-lhe a resposta, tal como se se tratasse de um jogo, sendo que a intuição vai ser mais importante que o escrutínio
Qualquer questão relacionada com o projecto #3igCILIA ou qualquer desejo de saber o resultado deste trabalho. Ou apenas simples interesse sobre o projecto da Inteligência artificial, o meu email de contacto é: a.pinto@rbht.nhs.uk.
Este questionário e anónimo e não haverá maneira de o identificar pelas suas respostas, vão ser colocadas apenas algumas questões epidemiológicas para posterior análise.

Espera-se que este questionário tenha a duracão de 10-15min.

Muito obrigada!

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Are you a scientist / é cientista ou a trabalhar na ciência? *
If you answer No to the previous question, briefly describe your area of work / se respondeu Não à pergunta anterior, descreva sucintamente a sua área de trabalho
If you are working in science, have you ever worked with PCD or Cilia? / se esta a trabalhar na ciência, alguma vez trabalhou em DCP ou cílios?
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The Cilium/ O Cilio     EM[look carefully to all the components, all cilia must have 9x eight shaped structures (Microtubular doublets in red) forming a ring, each with 2 hook like protrusions (the dynein arms, yellow and green for the external and internal), in the center 2 circles must be identified (central pair, in blue).]     PT[olhe atentamente para todos os componentes, todos os cílios devem conter 9 estruturas em forma de oito (dupletos marcados a vermelho) formando um anel, e de cada um destes "oitos" devem sair duas protuberâncias em forma de gancho (braços de dineína internos e externos a verde e amarelo respectivamente), no centro devem estar duas circunferências (par central, a azul).
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