Pré-Demande de prestation Single cell

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Ce formulaire n'est plus utilisé, merci de contacter la plateforme GENOMIC pour toute info : brigitte.izac@inserm.fr

Email *

Option 1

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Nom du responsable scientifique du projet (chef d'équipe ou équivalent) *

Appartenance *

Institut Cochin

Académique

Privé

Si hors Institut Cochin, précisez le nom de l'équipe et de son responsable, le nom et l'adresse de l'institut de recherche ou de la société

Résumé du projet en quelques lignes et question(s) biologique(s) posée(s) *

Connaissez-vous la technologie 10X Genomics? En quoi pensez-vous qu'elle apportera une réponse à votre question biologique? *

Avez-vous une expérience préalable en technologie Single Cell? *

Oui

Non

Ce projet est-il financé? *

Espèce ou référence à utiliser *

Nombre d'échantillons prévus *

Prévoyez-vous de travailler sur du matériel frais ou congelé?

Frais

Congelé

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Type d'échantillons *

cellules

noyaux

S'il s'agit de cellules, avez-vous besoin d'enrichir (trier) une sous-population?

oui

Non

Ne sais pas

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Si oui, quelle est la fréquence attendue de cette sous-population?

En cas d'étude des noyaux, à partir de quel tissu?

Envisagez-vous de nous sous-traiter la préparation des noyaux?

oui

Non

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Type de kits 10X Genomics envisagé

analyse transcriptomique simple (3' version 3.1)

CITE-Seq

Hashtag des échantillons

5' VDJ

ATAC Seq

Ne sais pas

Other:

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A quelle date envisagez-vous de commencer le projet? *

YYYY

L'analyse des données représente 80% du temps qui sera consacré au projet. GENOM'IC fournira une analyse standard issue de la suite CellRanger de 10X qui sera nécessairement ré-analysée par des outils statistiques plus adaptés au projet. Ces analyses nécessiteront une compétence en bio-informatique / bio-statistique au sein de l'équipe de recherche. Avez-vous cette compétence? *

oui

non

Quel type d'implication des plateformes envisagez-vous? *

Dans le cas d'une collaboration, la signature comme co-auteur d'un ou plusieurs ingénieurs des plateformes devra être envisagée

Prestation (pas de mise au point mais un test de validation, réunion projet uniquement si nécessaire...)

Collaboration (réunions de projet avant lancement puis en cours de projet, expériences de mise au point....)

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