Enquête sur les besoins de formation en bioinformatique des entreprises

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    Besoins de formation

    Linux initiation
    Linux avancé
    Integrated Genome Browser
    Cytoscape
    Suite bioinformatique EMBOSS
    PyMOL
    Text Parsing
    R studio
    Server and sting
    Grid computing
    Galaxy - Initiation
    Galaxy - Analyse métagénomique
    Galaxy - Analyse de données métaboliques
    Galaxy - Analyse ChiP-Seq
    Galaxy - Phylogénie
    Galaxy - Analyse RNAseq
    Galaxy - Analyse RNAseq De Novo
    Galaxy - Analyse microRNAsLan
    Galaxy - Analyse de données de type RAD par le pipeline Stacks
    Galaxy - Reads alignements and SNP calling
    Galaxy - RNAseq aligment and transcripts assemblies
    Galaxy - Intégration d’outils
    Initiation à l’environnement EMME : du format ISA-Tab et de se suite logicielle à l’analyse via Galaxy
    Mobyle
    Ressources et banques de données en ligne
    Ensembl/Biomart
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    R (débutant)
    R (avancé)
    Perl (débutant)
    Perl (avancé)
    Python (débutant)
    Python (avancé)
    Java (débutant)
    Java (avancé)
    C (débutant)
    C (avancé)
    C++ (débutant)
    C++ (avancé)
    SQL (débutant)
    SQL (avancé)
    noSQL (débutant)
    noSQL (avancé)
    Scripting sous linux (débutant)
    Scripting sous linux (avancé)
    MATLAB (débutant)
    MATLAB (avancé)
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    BioPerl (débutant)
    BioPerl (avancé)
    BioPython (débutant)
    BioPython (avancé)
    BioJava (débutant)
    BioJava (avancé)
    Package Ade4 pour R (débutant)
    Package Ade4 pour R (avancé)
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    Utilisation de Cluster (débutant)
    Utilisation de Cluster (avancé)
    Cloud pour la biologie (débutant)
    Cloud pour la biologie (avancé)
    Utilisation de Grille (débutant)
    Utilisation de Grille (avancé)
    Calculs sur GPU (débutant)
    Calculs sur GPU (avancé)
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    Statistiques ou Biostatistiques
    Initiation à la bioinformatique
    Annotation des génomes microbiens
    Comparaison et alignement de séquences
    Analyse avancée de séquences
    Alignement de reads et détection de variants
    Alignement de RNA-seq et assemblage de transcrits avec génome de référence
    De la puce à la régulation des gènes : utilisation de la littérature, des données de génomique comparative et analyse des promoteurs des gènes co-exprimés
    Analyse de données d’expression « Omiques » cas des Microarray & RNAseq
    Initiation à R dans le contexte de l’analyse de données transcriptomiques
    Fouille de données et analyses NGS avec le langage R
    Fouille de textes (data mining)
    Biologie intégrative ou Biologie des systèmes : Outils de fouille de données et de textes pour la reconstruction des réseaux biologiques
    Introduction aux systèmes dynamiques (réseaux d’interaction)
    Introduction aux ontologies
    Phylogénie moléculaire
    Recherche de motifs
    Modélisation et conception de bases de données
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