Геномика: контрольная работа 2
(вопросы по лекциям о картировании чтений и об анализе экспрессии генов)
Email *
E-mail, еще раз: *
Фамилия И.О. *
Группа *
Из пары чтений прямое чтение (F) картируется на обратно-комплементарную цепь скаффолда, на какую цепь должно картироваться обратное чтение? *
2 points
Required
С уменьшением длины чтения количество уникально картированных чтений *
1 point
Почему покрытие генома оказывается неравномерным при ресеквенировании всей геномной ДНК методом WGS *
Метод секвенирования WGS (whole genome shotgun) заключается в том, что геномную ДНК фрагментируют, например, ультразвуком, полученные фрагменты секвенируют без таргетного обогащения.
1 point
Какие алгоритмы и структуры данных используются программами - картировщиками? *
2 points
Required
В геноме из 2 генов на ген А попало 250 ридов, а на ген Б попало 500 ридов. Длины генов А и Б равны 500 п.н. Рассчитайте TPM гена Б: *
В качестве ответа укажите целую часть полученного числа
1 point
В четырех образцах на ген А попадает 500, 550, 400 и 425 ридов. Посчитайте дисперсию *
В качестве ответа укажите целую часть числа
2 points
На картинке ниже изображен *
1 point
Captionless Image
Если увеличить специфичность (за счет изменения уровня значимости) статистического теста, его чувствительность *
1 point
Возможно ли парноконцевое (paired-end) секвенирование РНК (RNAseq)? *
1 point
Метод оценки качества препарата РНК на основании вычисления RIN (RNA Integrity Number) основан на изменерии концентрации *
1 point
Эффект "притяжения" к референсу может вызвать следующие эффекты при картировании чтений *
1 point
Required
Submit
Clear form
Never submit passwords through Google Forms.
This content is neither created nor endorsed by Google. - Terms of Service - Privacy Policy