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4-Sintesi target microarrays e analisi dati
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Nella sintesi del target marcato in presenza di quantità limitate di RNA come si procede?
Si effettua un'amplificazione tramite PCR
Si effettua un'amplificazione tramite RNA polimerasi T7
Si incrementa la quantità di nucleotidi marcati durante la retrotrascrizione dell'RNA
Non so
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Cosa si intende con "range dinamico" di una tecnica?
Il tempo richiesto per elaborare il risultato a partire dal dato grezzo.
La soglia minima di rilevazione della tecnica.
La soglia massima di rilevazione della tecnica.
L'intervallo tra il valore massimo possibile e quello minimo di una grandezza variabile misurata con una tecnica qualsiasi.
Non so
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In che tecnica si ottengono due immagini tiff da un singolo array ibridizzato?
Affymetrix
Illumina
Ibridazione competitiva
Non so
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Perchè le immagini tiff sono dette 16 bit?
Perchè hanno una risoluzione di 16 pixel per micron.
Perchè includono da 2^0 a 2^16 possibili livelli di grigio.
Perchè il range dinamico è pari a 16.
Non so.
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Che cosa sono dei geni funzionalmente correlati?
Geni che codificano proteine che devono necessariamente appartenere allo stesso pathway.
Geni che condividono una relazione regolatoria o funzionale.
Geni che codificano proteine che devono necessariamente interagire tra loro.
Non so.
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Cos'è un grafico M/A
Un grafico in cui si rappresenta su un asse il log2 del rapporto dei valori di segnale e sull'altro il prodotto dei due valori.
Un grafico in cui si riporta su un asse il valore del segnale relativo ad uno dei due fluorofori e sull'altro asse il valore dell'altro fluoroforo.
Un grafico utile per evidenziare deviazioni dei valori di segnale dalla normalità e decidere se correggerli.
Non so.
Perchè si normalizzano i dati di microarrays?
Per rimuovere l'influenza sui dati di fattori diversi dalla variabile in esame.
Per rimuovere l'effetto sui geni della variabile in esame.
Per poter inserire i dati in un grafico M/A.
Per poter fare dei calcoli statistici sulle repliche multiple.
Non so.
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Che cosa si intende con Gene Ontology?
E' una procedura statistica per identificare la funzione dei geni in un processo.
E' un metodo per assegnare i geni ad un pathway e poterli visualizzare.
E' un vocabolario controllato della funzione di moltissimi geni in termini di Processo Biologico, Funzione Molecolare e Localizzazione Subcellulare.
Non so.
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