Алгоритмы в биоинформатике  

Преподаватель: Алексей Александрович Шпильман

Описание курса

Курс создан для введения слушателей в курс основных алгоритмов и принципов в биоинформатике.

Курс состоит из двух частей:

  1. Введение в биоинформатику - история исследования ДНК и белковых структур.
  2. Основные алгоритмы, используемые в биоинформатике.

Содержание курса

  1. История исследования белковых структур.
  2. История исследования ДНК.
  3. Алгоритмы выравнивания
  4. Алгоритмы поиска в банке
  5. Алгоритмы построения деревьев
  6. Скрытые марковские модели
  7. Алгоритмы множественного выравнивания последовательностей
  8. Алгоритмы выравнивания РНК
  9. Алгоритмы сборки геномов

Требования по ПО - нет.

Learning outcomes

По окончании курса студенты будут понимать принципы работы основных базовых алгоритмов биоинформатики и мотивацию стоящую за дизайном этих алгоритмов, с биологической точки зрения.

Аттестация:

Квизы: 40 баллов.

Домашние задания: 200 баллов. У каждого задания - свой мягкий и жесткий дедлайн. После мягкого дедлайна - половина баллов, после жесткого задание не принимается.

Заключительный тест 100 баллов.

5 - 350 баллов.

4 - 300 баллов.

3 - 250 баллов.