2/24

*課程簡介、評分方式

影片：  TEDxTaipei

台灣的生物科技夢：林政和 (Jimmy Lin) at TEDxTaipei 2013

3/03

*科學史： 中古世紀到十七世紀科學發展

t-test

http://en.wikipedia.org/wiki/Student%27s_t-test

Leeuwenhoel

http://en.wikipedia.org/wiki/Antonie_van_Leeuwenhoek

Gregor Johann Mendel

http://en.wikipedia.org/wiki/Gregor_Mendel

Youtube

On Education in Taiwan: Eric Yao (姚仁祿) at TEDxTaipei 2012

BIOTECHNOLOGY 1/4 - Story of Life (英文字幕，德語發音)

Mendelian Genetics (16:04)

請問，細菌這個英文字 (bacterium/bacteria) 何時出現？跟在發明顯微鏡之前或之後？

從觀察到細菌到出現 bacterium/bacteria 這個英文單字，為何有這麼多年的差距？

3/10

*科學史：十八、十九世紀的科學大躍進

TEDxTaipei   在飽和市場裡，絕處逢生的錦囊妙計：童子賢

(引用王國維的話，太有道理了！)

How Mendel's pea plants helped us understand genetics - Hortensia Jiménez Díaz (3:06)

時事分享

抗霧霾!柴靜自費調查採訪《穹頂之下》

地球公民基金會 我不認識我呼吸的PM2.5

你看見空污旗了嗎？空污嚴重，新內閣踹共！

下次從事戶外運動前，是否先看 PM2.5

環保署＼空氣品質監測網＼即時細懸浮微粒指標

發現病毒 (菸草鑲嵌病)

http://en.wikipedia.org/wiki/Dmitri_Ivanovsky

3/17

*科學史：二十世紀到現在的科學

TEDxTsipei  讓蜜蜂回不了家的原因：楊恩誠

看看主講者的手勢、眼神、講話的速度。其投影片是否為滿滿的文字？

提到

歐洲與美國對基因改造作物態度不同 (日本朋友與阿原指導教授的故事)

免疫組織染色法

快速簡介顯著差異。

PLOS ONE 2012 Impaired Olfactory Associative Behavior of Honeybee Workers Due to Contamination of Imidacloprid in the Larval Stage

從發現抗生素到實際應用，發現噬菌體到實際應用，換個領域，來談談人造衛星從概念到實踐，過了多久。

為什麼衛星會繞著地球跑？

IntraLytix 公司的商品 請看可愛的影片   

(Youtube 可以自動加上字幕，準確度很高，值得參考。就阿原的經驗這影片的配音很慢很清楚，90% 的美國人講或不是這樣，又快或含滷蛋，或是腔調重)

3/24

*認識化學元素與化合物

TEDxtaipei    進步原動能，來自破壞恆常穩定：詹宏志

Thomas Hunt Morgan 果蠅研究的開山祖師   謝豐舟教授

從發現核酸到確定有遺傳功能

http://biotech.nstm.gov.tw/02/021.asp

IntraLytix 公司的商品 請看可愛的影片   另一段

20150313

日本研究 一滴尿就知道是否罹癌  以線蟲判讀 確診率近96％

報導中提到，這成果發表在 PLOS ONE，

1. 請找出原始的文獻出處
2. 看看論文內容，與報導是否有差異？

PLOS ONE： A Highly Accurate Inclusive Cancer Screening Test Using Caenorhabditis elegans Scent Detection

Youtube: 「人類の未来を救う？」 ガンの匂いを嗅ぎ分ける虫(15/03/12)

被最毒「香蕉蜘蛛」咬到 可勃起4小時

1. 從食品安全的角度，水果採收之後如何處理，以避免被昆蟲咬傷的風險？
2. 從生技、商機、醫學的角度來看，各位有什麼看法？

3/31

*認識化學：元素、化合物、有機分子

TEDxTaipei  

經濟新定義 – 重點不是賺了多少錢，而是讓事情有多少轉變：蘇瑤華

*開原碼週期表軟體Kalzium (介紹：一、二)

*MIT 的化學開放式課程

*台大開放式課程-化學 (蔡蘊明老師主講)

*開原碼化學平面繪圖軟體 BKchem (下載)

*開原碼化學立體繪圖軟體 Avogadro (下載)

*Chemical structures in Sourceforge

*使用 SMILES 文字化學式

*PhET 化學部份 (尤其是 pH 的觀念)

您不需要背下所有的東西，只要知道蔡蘊明老師主，如何用最短的時間找到您需要的化學知識!不只網路，有時候開口問到適當的人，會比網路更快更準！

4/07

*認識生化分子：蛋白質、醣類、脂質、核酸

剛介紹完 peptide bonds

TEDxTaipei   徐子涵：推翻傳統價值

生物化學，是指從化學分子的角度來看生物的反應，若要深入了解生物與生技，認識基礎分子就顯得很重要，好比要深入研究物理，就要有足夠的數學底子。

當然通識課不會過度要求大家要把分子背下來，希望各位可以帶著聽過可以增廣見聞的心情，他日若有需要，可以自行加強相關知識。

台大開放式課程 (蔡蘊明) #41 胺基酸與蛋白質

莊榮輝老師的講義 (阿原強力推薦)

生物化學基礎 Biochemistry Basics 2008

胺基酸 Amino Acid

蛋白質 Protein

開放式課程

可汗學院

Amino Acid Structure

Classification of Amino Acids

4/14

*遺傳工程 1：從 DNA 到 RNA 到 蛋白質

TEDxTaipei   陸子鈞：不可忽視的科學新聞

PanSci 泛科學

PhET: 基因表現--基本入門

認識生物分子資料庫的立體分子

RCSB Protein Data Bank - RCSB PDB

www.rcsb.org/

(英文網頁)

例如某人工合成的雙股螺旋 DNA (代號 3BNA)

4/21

#

**可能有少數人誤以為要期中考，所以今天第一次到課堂，現在把課程規定再說明一次。

公佈學期作業---請自行下載 學期作業   

https://drive.google.com/file/d/0BxeJ26IHD2s0OVYwQVR3WjBwa1U/view?pli=1

請下載後列印手寫，不要打字

2015-04-21 公佈，請在5/12點名簽到後親自繳交，不要代交。並在 5/26 點名簽到後領回，不要代領

除第六題之外，其餘參考國家考畢試題，請在比較有學術性的網站找適當的答案。

*遺傳工程 2：基因轉殖與表現

TEDxTaipei   蔣勳：留十八分鐘給自己

科技大展-非破壞水果糖度檢測

出版日期：2012-09-19

------帶糖度計到教室 (及 webcam)

莊榮輝老師的講義 (阿原強力推薦)

生物化學基礎 Biochemistry Basics 2008

蛋白質 Protein   核 酸

4/28

*DNA 及蛋白質電泳，及其應用

to ch6 p27

TEDxTaipei   劉奕成：小文藝復興及微型創業

TEDxTaipeiChange 2012 - Ben Jai (翟本喬) - 要上雲端，先換腦袋

生物化學基礎 Biochemistry Basics 2008

生物技術

5/05

台灣雲端計算的迷思與挑戰: Simon Chang (張善政) at TEDxTaipeiChange 2012

*知名的生技工程：胰島素的故事

全台糖尿病統計資訊- 全民糖尿病觀測站

中華民國糖尿病學會 - 中華民國內分泌暨糖尿病學會

歷年糖尿病盛行率 - 衛生福利部國民健康署

請問，如何查出最近幾年糖尿病的盛行率？ (每千人之中有多少人確定是糖尿病)-----------博碩

http://en.wikipedia.org/wiki/Insulin

分享了博碩士的基本用法

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5/05 15:58 公佈：[提醒--5/12 點名、簽到、交作業]

預計在 10:40 開始進行，由點名單中依照編號，每連續十個為一組，隨機選組，一次點二到三人，請帶著作業繳交，並簽到。請不要代簽及代交作業。點完之後才出現，視為遲到，請找阿原報到、簽到、繳作業。

5/12

*食品及醱酵工程之生物技術 02

TEDxTaipei   郭俊賢：生態能源的無限可能

點名/簽到/親自繳交作業，無法出席者，請依規定請假。   

影片：

台灣阿里山牛樟芝養殖場

Youtube:

Enzyme-Linked Immunosorbent Assay (ELISA) - Multi-Lingual Captions --動畫示意 (1:48)(openmichigan)

ELISA --實驗影片 (4:52) (ProteintechEurope's channel)

5/19

*生物技術與農業應用01

TEDxTaipei    農業 3.0 ：吳季衡

**教學問卷調查，阿原希望聽到大家的建議，好的，保留到下次課程，需要改進的，阿原設法改進。 問卷不記名，在學期結束送完成績才看問卷，請放心作答。

**有機農業簡介-01-有機的概念

What is Organic (4:28)(PureandGreenOrganics)

阿原當年公費就是考上有機農業之學門

有機農業全球資訊網

• 有機農業簡介
• 台灣有機農業
• 國外有機農業

• 作物有機栽培技術
• 土壤與肥料管理
• 病蟲害與雜草管理
• 作物栽培技術研發與推廣
• 諮詢輔導專家
• 行銷與管理
• 有機漁畜
• 有機農業商品化資材

Chitin 在 Pubchem 的立體圖

https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/compound/24139#section=3D-Conformer

5/26

公佈學期作業成績，點名/簽到/親自領回作業，無法出席者，請依規定請假。不及格者請交作業二  (預計公佈作業二)

*生物技術與農業應用02

TEDxTaipei   賴青松：家鄉的旅程

**有機農業簡介-01-從法規來看有機

20120611 - 有機農業三難困局.mpg (10:51)

6/02

TEDxTaipei

設計創業家的自白：洪裕鈞

*生物技術與環保應用

• 16S ribosomal RNA, the prokaryotic ribosomal subunit

Youtube

Illumina MiSeq, 16S rRNA Sequencing and the American Gut Project

農委會虛擬博物館

科技大展-畜試所宜蘭分所 (7:41)

科技大展-非農藥防治 (2:43)

科技大展-茶園害蟲監控 (5:08)

科技大展-作物健康管理 (2:15)

科技大展-杏鮑菇 (2:28)

6/09

*生物技術與醫學應用

Youtube

[Biopharmaceutics] Introduction for Red Biotechnology and Biopharmaceuticals

 (21:51) 這位韓國教授的英文很清楚，沒有腔調，沒有滷蛋，大家練習一下。

PCR (4:37)

Agarose Gel Electrophoresis (4:06)

DNA Sequencing: The Chain Termination Method (Sanger Method) (3:00)

在 Pubmed-Gonme 上找出人類的基因體

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/?term=human

ADA

http://en.wikipedia.org/wiki/Adenosine_deaminase

Flu Attack! How A Virus Invades Your Body (3:39 )

NPR 的影片，以感冒病毒辨識感染後複製為例。

Engineering adenoviruses for gene therapy (1:55)

Gene Therapy - AAV Virus (1:29)

Liposome Basics-Part one (6:18)

先解釋磷脂質結構

Liposome Basics-Part two (6:22)

6/16

*生物技術所面臨的宗教與道德問題

TEDxTaipei

太空夢，NASA教我的競爭思考：劉倬宇

(很勵志的演講!)

Youtube

Coronavirus- catches you 50% sure you will die Middle East Respiratory Syndrome MERS-CoV) Alert !!!

The MERS Virus, explained. (Long Story Short) (2:45)

Complete MERS coronavirus genomes from China and South Korea are in GenBank

Wednesday, June 10, 2015

這是來自南韓 MERS 的基因

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nucleotide/KT029139

這是來自中國 MERS 的基因

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nucleotide/KT006149

youtube

The Immune System Explained I – Bacteria Infection

Monoclonal Antibody Production [HD Animation] (1:37)

林依瑩、不老騎士：不老靈魂，新追夢人

6/23

(本課程只有以作業，討論，點名進行評分，本課程沒有考試)