Tutorial Dengan Pymol

berikut adalah tutorial penggunaan aplikasi Pymol
Buka aplikasi Pymol akan muncul 2 tampilan yaitu Molecular Graphic System dan Pymol Viewer.

http://3.bp.blogspot.com/-bgIpyjosmsA/VH6JjrlzqxI/AAAAAAAAAMU/YQeqIFlsWKY/s1600/12.png


 Klik toolbar build pada Molecular Graphic System , akan muncul banyak pilihan, missal kita pilih fitur Residue Aspartate

http://1.bp.blogspot.com/-zWSEFize-rY/VH6KdCQuPuI/AAAAAAAAAMg/bNF-DoNk9F0/s1600/2.png




kemudian apabila anda ingin mengubah-ubah tampilnnya kita bisa memilih fitur-fitur yang ada di sebelah kanan, untuk mengetahui formal charge kita bisa pilih fitur L-toolbar  other properties  formal charge

http://3.bp.blogspot.com/-y2uQ4NYjHho/VH6LZyHmE2I/AAAAAAAAAMo/_n003lIjZPM/s1600/3.png

http://2.bp.blogspot.com/-nM4YD7wGbqs/VH6LuZwdzvI/AAAAAAAAAMw/wWZQTEpOS48/s1600/4.png


jika ingin mengetahui Van der Walls radius tinggal pilih L-toolbar
 vdw radius

http://1.bp.blogspot.com/-Tf8V0hQ59-A/VH6MG4TYLVI/AAAAAAAAAM4/GJhwDYCLYqE/s1600/5.png



untuk mengetahui symbols pilih L-toolbar  element symbol

http://2.bp.blogspot.com/-k0uMAjHvAfw/VH6MbySug9I/AAAAAAAAANA/W4XFh7-9Q-o/s1600/6.png


pilih S-toolbar
 dots

http://2.bp.blogspot.com/-7niPG9ooZwU/VH6M1szYkYI/AAAAAAAAANI/CSMcCn4iBxo/s1600/7.png


dan kemudian jika ingin mengetahui mesh dan surface pilih S-toolbar
 mesh dan S-toolbar  surface

http://1.bp.blogspot.com/-Srhhop5qqlI/VH6NPjD5JbI/AAAAAAAAANQ/2XQQtDclo8I/s1600/8.png


Get view dan kemudian Orient

http://3.bp.blogspot.com/-BQehA2huiN4/VH6Nzmo8UXI/AAAAAAAAANc/bAtRK6PAsD4/s1600/9.png

 

 Selamat Mencoba.. :)