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1 | Please mark and/or comment on which software packages you use in your discipline or course. "current" indicates that the latest version is sufficient for your needs. Feel free to insert software packages when necessary. The convention here is to head columns with Individual/Interest. | |||||||||||||||||||||

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3 | Software | davclark/d-lab | paciorek | ronald/linguistics | ck37/machine learning | aculich | ph290 (aculich/lexin.li) | pbstark/unipd.it | rylo/ds8 | text mining | ||||||||||||

4 | Python 3.x | |||||||||||||||||||||

5 | python3 BeautifulSoup | current | ||||||||||||||||||||

6 | python3 Cython | current | ||||||||||||||||||||

7 | python3 datascience | current | ||||||||||||||||||||

8 | python3 ipython[notebook] | current | current | >= 3.1.x | ||||||||||||||||||

9 | python3 lxml | current | ||||||||||||||||||||

10 | python3 matplotlib | current | ||||||||||||||||||||

11 | python3 networkx | current | ||||||||||||||||||||

12 | python3 nltk | current | ||||||||||||||||||||

13 | python3 nose | current | ||||||||||||||||||||

14 | python3 numpy | current | current | current | ||||||||||||||||||

15 | python3 pandas | current | current | current | ||||||||||||||||||

16 | python3 Pillow | current | ||||||||||||||||||||

17 | python3 pycosat | current | ||||||||||||||||||||

18 | python3 pytest | current | ||||||||||||||||||||

19 | python3 PyYAML | current | ||||||||||||||||||||

20 | python3 readline | current | ||||||||||||||||||||

21 | python3 requests | current | ||||||||||||||||||||

22 | python3 rpy2 | current | ||||||||||||||||||||

23 | python3 scikit-learn | current | current | current | ||||||||||||||||||

24 | python3 scipy | current | current | current | ||||||||||||||||||

25 | python3 seaborn | current | ||||||||||||||||||||

26 | python3 sklearn-pandas | current | ||||||||||||||||||||

27 | Python 2.x | |||||||||||||||||||||

28 | python2 BeautifulSoup | current | ||||||||||||||||||||

29 | python2 Cython | current | ||||||||||||||||||||

30 | python2 ez-setup | current | ||||||||||||||||||||

31 | python2 ipython[notebook] | current | >= 3.1.x | |||||||||||||||||||

32 | python2 ipythonblocks | current | ||||||||||||||||||||

33 | python2 lxml | current | ||||||||||||||||||||

34 | python2 matplotlib | current | ||||||||||||||||||||

35 | python2 networkx | current | ||||||||||||||||||||

36 | python2 nltk | current | ||||||||||||||||||||

37 | python2 nose | current | ||||||||||||||||||||

38 | python2 numpy | current | ||||||||||||||||||||

39 | python2 pandas | current | ||||||||||||||||||||

40 | python2 Pillow | current | ||||||||||||||||||||

41 | python2 pymongo | current | ||||||||||||||||||||

42 | python2 pytest | current | ||||||||||||||||||||

43 | python2 PyYAML | current | ||||||||||||||||||||

44 | python2 readline | current | ||||||||||||||||||||

45 | python2 requests | current | ||||||||||||||||||||

46 | python2 rpy2 | current | ||||||||||||||||||||

47 | python2 scikit-learn | current | ||||||||||||||||||||

48 | python2 scipy | current | ||||||||||||||||||||

49 | python2 scrapy | current (just 2 or 3 is fine) | ||||||||||||||||||||

50 | python2 seaborn | current | ||||||||||||||||||||

51 | python2 six | current | ||||||||||||||||||||

52 | python2 sklearn_pandas | current | ||||||||||||||||||||

53 | python2 virtualenv | current | ||||||||||||||||||||

54 | R software environment | |||||||||||||||||||||

55 | R | current | current | >= 3.2.x | current | >= 3.1.x | ||||||||||||||||

56 | RStudio | current | current | current | current | |||||||||||||||||

57 | R bartMachine | current | ||||||||||||||||||||

58 | R caret | current | ||||||||||||||||||||

59 | R chron | current | ||||||||||||||||||||

60 | R class | current | ||||||||||||||||||||

61 | R colorspace | current | ||||||||||||||||||||

62 | R DBI | current | ||||||||||||||||||||

63 | R devtools | current | current | |||||||||||||||||||

64 | R dichromat | current | ||||||||||||||||||||

65 | R digest | current | ||||||||||||||||||||

66 | R doMC | current | current | |||||||||||||||||||

67 | R doParallel | current | current | |||||||||||||||||||

68 | R dplyr | current | ||||||||||||||||||||

69 | R earth | current | ||||||||||||||||||||

70 | R extraTrees | current | ||||||||||||||||||||

71 | R fields | current | ||||||||||||||||||||

72 | R foreach | current | current | |||||||||||||||||||

73 | R gbm | current | ||||||||||||||||||||

74 | R ggplot2 | current | current | current | current | |||||||||||||||||

75 | R glmnet | current | ||||||||||||||||||||

76 | R gridExtra | current | ||||||||||||||||||||

77 | R gtable | current | ||||||||||||||||||||

78 | R haven | current | ||||||||||||||||||||

79 | R inline | current | ||||||||||||||||||||

80 | R ISLR | current | ||||||||||||||||||||

81 | R iterators | current | ||||||||||||||||||||

82 | R kernlab | current | ||||||||||||||||||||

83 | R knitr | current | current | current | current | |||||||||||||||||

84 | R labeling | current | ||||||||||||||||||||

85 | R languageR | current | ||||||||||||||||||||

86 | R lme4 | current | current | current; some users require lme4 < 1.0 | ||||||||||||||||||

87 | R lubridate | current | ||||||||||||||||||||

88 | R mapproj | current | ||||||||||||||||||||

89 | R maps | current | ||||||||||||||||||||

90 | R mda | current | ||||||||||||||||||||

91 | R mgcv | current | ||||||||||||||||||||

92 | R multcomp | desired | ||||||||||||||||||||

93 | R munsell | current | ||||||||||||||||||||

94 | R openNLP | current | ||||||||||||||||||||

95 | R party | current | ||||||||||||||||||||

96 | R plot.rpart | current | ||||||||||||||||||||

97 | R plyr | current | current | |||||||||||||||||||

98 | R pROC | current | ||||||||||||||||||||

99 | R proto | current | ||||||||||||||||||||

100 | R pryr | current |

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